中国淋巴囊肿病毒胸苷酸合酶基因结构特点及分析

胸苷酸合酶(Thymidylate synthase, TS)是进行 DNA 合成所必需的酶类,与细胞分化及肿瘤发生密切相关。淋巴囊肿病毒属于虹彩病毒科成员,是能引起百余种淡、海水鱼感染,并产生肿瘤的病毒病原。在已完成中国淋巴囊肿病毒株 (Lymphocystis disease virus-China, LCDV-C) 基因组序列测定的基础上,本文对位于 LCDV-C 基因组开放阅读框 ORF 011L 的 TS 基因结构、及其推定蛋白结构进行了分析。该基因全长 858bp,GC 含量为 28.2%,编码一个长为 286aa、分子量为 32.7kD、等电点为 7.1 的推定蛋白,称之为中国淋巴囊肿病毒胸苷酸合酶(LCDV-CTS)。该酶所具有的叶酸结合区在第 44 和 70 位氨基酸之间,dUMP 结合区在第 163 和 206 位氨基酸之间,24个必需氨基酸具有高度保守性。二级结构预测结果显示 LCDV-C TS 含 8 个 α 螺旋,6 个 β 折叠和 23 个环,表明其具备酶活性分子所有的柔性和可变性结构特征。这是迄今所知在脊椎动物虹彩病毒中唯一含两个完整结合区的 TS。对来自包括 LCDV 在内二十个物种的 TS 结构进行同源性分析,显示 LCDV-C TS 被单独分为一枝。进一步对 LCDV-C TS 可能的起源途径及与宿主的作用等进行了探讨。