药效假说在配体从头设计中的适用性探讨

在基于靶蛋白结构的多肽分子设计中，药效假说是从头设计方法的基本前提。虽然该假说是否成立已有不少议论，但尚未见到系统分析的报道。通过对８ 个蛋白质复合物界面做了氨基酸模拟图谱，并从模拟图谱的结构偏差与能量分量的关系，对药效假说的适用条件进行了讨论。同时也给出一个ＨＩＶ－ １ 蛋白酶及抑制剂复合物的功能图谱。从所得结果来看，药效假说在以氨基酸为药效基团时，尽管不少情况下仍然有效，但不是普遍成立的。