NF-κB调控脂多糖激活的PMN凋亡的下游相关基因

观测核因子 κB(nuclearfactorkappaB ,NF κB)调控脂多糖 (lipopolysaccharide ,LPS)激活的中性粒细胞 (polymor phonuclearneutrophil,PMN)凋亡的下游相关基因。将培养的人静脉血PMN分为对照 (control)组、LPS(10 0 μg/L)组、gliotoxin +LPS组及PD0 980 5 9+LPS组 ,后两组先用gliotoxin(10mg/L)或PD0 980 5 9(10 0 μmol/L)培养 30min ,后加入LPS(10 0 μg/L)继续培养 6 0min。收集细胞 ,提取总RNA。采用细胞凋亡相关蛋白及应激反应蛋白类基因芯片进行检测。结果显示 ,control组与LPS组有 8条差异基因 ,3条上调 ,5条下调 ;gliotoxin +LPS组与LPS组有 10条差异基因 ,7条上调 ,3条下调 ;PD0 980 5 9+LPS组与LPS组有 8条差异基因 ,5条上调 ,3条下调。综合分析发现Defenderagainstcelldeath 1和X linkedinhibitorofapoptosisprotein是NF κB调控PMN凋亡的下游相关基因。Ionizingradiationresistancecon ferringprotein在NF

一个新的家蚕BmLITAF基因的电子克隆及序列分析

在对家蚕蛹cDNA文库的测序中发现了脂多糖诱导肿瘤坏死因子α的转录激活因子(lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-α factor,LITAF)的EST序列(GenBank登录号AADK01016184)。经过比对发现BmLI-TAF全长为981 bp,由97 bp的5′端非翻译区序列(5′UTR)、390 bp的开放读码框(ORF)和494 bp的3′端非翻译区序列(3′UTR)组成。用电子克隆方法对BmLITAF进行基因结构分析发现,此基因由3个外显子和2个内含子组成,编码129个氨基酸。对BmLITAF蛋白进行疏水性、跨膜结构和信号肽分析的结果显示,BmLITAF具有跨膜结构域。根据BmLITAF的电子克隆序列由家蚕基因组PCR扩增获得BmLITAF基因,将其克隆到pGEM-T-easy载体中,测序验证与电子克隆结果一致。