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PLIN1基因InDel位点检测及其与同羊尾脂和生长性状的关联分析
1
作者
邱彦博
阮子豪
+3 位作者
易晓华
谢浦航
袁婷婷
孙秀柱
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024年第15期43-48,118,共7页
为了探讨同羊PLIN1基因结构及PLIN1基因的插入/缺失(inserted/deletion,InDel)位点对同羊尾脂和体尺性状的影响,试验对PLIN1基因结构进行了生物信息学分析,并测量了166只健康同羊的尾脂和体尺性状;通过测量同羊表型数据、提取基因组DNA...
为了探讨同羊PLIN1基因结构及PLIN1基因的插入/缺失(inserted/deletion,InDel)位点对同羊尾脂和体尺性状的影响,试验对PLIN1基因结构进行了生物信息学分析,并测量了166只健康同羊的尾脂和体尺性状;通过测量同羊表型数据、提取基因组DNA,并采用PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳和Sanger测序等方法检测PLIN1基因的InDel位点和分型情况,然后对PLIN1基因的InDel位点与同羊尾脂和体尺性状进行关联分析。结果表明:PLIN1基因位于绵羊的18号染色体上,有8个外显子和7个内含子。绵羊、山羊、普通牛、欧亚野猪、智人、小鼠的PLIN1蛋白结构高度保守,原鸡和绿头鸭的PLIN1蛋白结构与其他物种存在差异,以上8个物种的PLIN1蛋白有10个共同基序,2个特定的保守结构域,PLIN1基因在物种进化中相对保守。同羊的PLIN1基因存在1个26 bp(CGATCCTCGGTGCCCCAGAAACATTC)的InDel位点,包含DD、II和ID 3种基因型,I和D等位基因频率分别为0.2018和0.7982,II、ID和DD基因型频率分别为0.0663,0.2711,0.6627,该位点处于中间多态性(0.250.05);该位点对公羊的体尺性状无显著影响(P>0.05);但该位点的II基因型母羊背高显著高于ID和DD基因型(P<0.05)。说明PLIN1基因的InDel位点可被作为母羊育种的有用分子标记。
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关键词
脂滴包被蛋白1
(PLIN
1
)
同羊
尾
脂
插入/缺失(InDel)
生长性状
关联分析
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职称材料
枸骨叶水提物对小鼠肥胖的预防作用及对脂肪分化的影响
被引量:
3
2
作者
刘梅芳
孙悦
李丽
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期899-905,共7页
目的:研究枸骨叶水提物(ICAE)对高脂饮食(HFD)小鼠肥胖的预防作用及对脂肪分化的影响.方法:本研究采用HFD诱导小鼠肥胖,同时灌胃给予ICAE,以奥利司他(orlistat)为阳性对照药。39只昆明雄性小鼠分成4组,包括对照组(n=10)、肥胖模型组(n=9...
目的:研究枸骨叶水提物(ICAE)对高脂饮食(HFD)小鼠肥胖的预防作用及对脂肪分化的影响.方法:本研究采用HFD诱导小鼠肥胖,同时灌胃给予ICAE,以奥利司他(orlistat)为阳性对照药。39只昆明雄性小鼠分成4组,包括对照组(n=10)、肥胖模型组(n=9)、orlistat治疗组(n=10)和ICAE治疗组(n=10)。以体重、腹内和皮下脂肪含量、肝重以及血清甘油三酯(TG)和总胆固醇(TC)水平为指标,观察ICAE对肥胖的预防作用;在实验第5周,连续5 d监测ICAE对小鼠24 h平均摄食量的影响;HE染色观察ICAE对脂肪组织的影响。分离和培养大鼠附睾来源的前脂肪细胞,尼罗红染色观察ICAE对分化脂肪细胞内脂滴形态的影响,Western blot法检测ICAE对细胞内过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、脂滴包被蛋白1(Plin1)及激素敏感性脂肪酶(HSL)蛋白表达的影响。结果:ICAE可以显著抑制HFD引起的小鼠体重、腹内和皮下脂肪含量以及肝重的增加(P<0.01),并且显著降低血清TC和TG水平(P<0.01),但是对摄食量无显著影响;HE染色显示,ICAE能够显著减少HFD引起的白色脂肪细胞肥大。此外,在原代培养的大鼠分化脂肪细胞中,ICAE可以显著抑制细胞内脂滴的积累,并且显著下调脂肪分化关键转录因子PPARγ以及脂肪分化标志物Plin1和HSL的蛋白水平(P<0.01)。结论:ICAE对HFD诱导的小鼠肥胖具有预防作用,但对摄食量无明显影响;ICAE可以显著抑制脂肪分化过程,此作用可能与下调PPARγ的蛋白表达有关。
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关键词
枸骨叶水提物
肥胖
脂
肪分化
过氧化物酶体增殖物激活受体Γ
脂滴包被蛋白1
激素敏感性
脂
肪酶
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职称材料
PLIN1在肝细胞癌中的表达及其临床意义
3
作者
黄江华
覃宇奇
+1 位作者
张瑞
冯振博
《广西医科大学学报》
CAS
2022年第11期1726-1733,共8页
目的:探讨脂滴包被蛋白-1(PLIN1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床意义。方法:采用实时荧光定量PCR(RTqPCR)检测HCC细胞系(SK-HEP-1、Huh7)和正常肝细胞系(L02)中PLIN1 mRNA表达水平。采用免疫组织化学染色法检测94例HCC组织及82例癌旁...
目的:探讨脂滴包被蛋白-1(PLIN1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床意义。方法:采用实时荧光定量PCR(RTqPCR)检测HCC细胞系(SK-HEP-1、Huh7)和正常肝细胞系(L02)中PLIN1 mRNA表达水平。采用免疫组织化学染色法检测94例HCC组织及82例癌旁肝组织中PLIN1蛋白表达水平,并分析PLIN1表达与HCC患者临床病理参数间的关系。通过肿瘤基因组图谱(TCGA)、基因型组织表达数据库(GTEx)和基因表达综合数据库(GEO)收集RNA测序及芯片数据,进一步验证PLIN1在HCC中的表达。使用Kaplan-Meier法对HCC患者进行生存分析。基于TCGA数据库的表达数据及相应临床病理参数构建多因素Cox回归及列线图预测模型,评估HCC的危险因素及患者预后。结果:与正常肝细胞系相比,PLIN1 mRNA在HCC细胞系中表达降低(P<0.001);免疫组化结果显示,PLIN1蛋白在HCC组织中表达低于癌旁肝组织(P<0.001)。公共数据整合分析结果显示,PLIN1在HCC组织中表达下调[SMD=-0.76(-0.98~-0.53),I2=80.8%,P<0.001]。生存分析及列线图预测模型均提示HCC中PLIN1低表达患者生存时间短于高表达患者(P<0.05)。结论:PLIN1在HCC中低表达,且与患者的不良预后相关。
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关键词
脂
滴
包被
蛋白
-1
肝细胞癌
预后
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职称材料
题名
PLIN1基因InDel位点检测及其与同羊尾脂和生长性状的关联分析
1
作者
邱彦博
阮子豪
易晓华
谢浦航
袁婷婷
孙秀柱
机构
西北农林科技大学动物科技学院
西北农林科技大学草业与草原学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024年第15期43-48,118,共7页
基金
国家牧草产业技术体系项目(CARS-34)
畜禽种质资源精准鉴定项目“绵羊高繁性状精准评价和分子鉴定”(202121)。
文摘
为了探讨同羊PLIN1基因结构及PLIN1基因的插入/缺失(inserted/deletion,InDel)位点对同羊尾脂和体尺性状的影响,试验对PLIN1基因结构进行了生物信息学分析,并测量了166只健康同羊的尾脂和体尺性状;通过测量同羊表型数据、提取基因组DNA,并采用PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳和Sanger测序等方法检测PLIN1基因的InDel位点和分型情况,然后对PLIN1基因的InDel位点与同羊尾脂和体尺性状进行关联分析。结果表明:PLIN1基因位于绵羊的18号染色体上,有8个外显子和7个内含子。绵羊、山羊、普通牛、欧亚野猪、智人、小鼠的PLIN1蛋白结构高度保守,原鸡和绿头鸭的PLIN1蛋白结构与其他物种存在差异,以上8个物种的PLIN1蛋白有10个共同基序,2个特定的保守结构域,PLIN1基因在物种进化中相对保守。同羊的PLIN1基因存在1个26 bp(CGATCCTCGGTGCCCCAGAAACATTC)的InDel位点,包含DD、II和ID 3种基因型,I和D等位基因频率分别为0.2018和0.7982,II、ID和DD基因型频率分别为0.0663,0.2711,0.6627,该位点处于中间多态性(0.250.05);该位点对公羊的体尺性状无显著影响(P>0.05);但该位点的II基因型母羊背高显著高于ID和DD基因型(P<0.05)。说明PLIN1基因的InDel位点可被作为母羊育种的有用分子标记。
关键词
脂滴包被蛋白1
(PLIN
1
)
同羊
尾
脂
插入/缺失(InDel)
生长性状
关联分析
Keywords
perilipin
1
(PLIN
1
)
Tong sheep
tail fat
insertion/deletion(InDel)
growth traits
association analysis
分类号
S826.8 [农业科学—畜牧学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
枸骨叶水提物对小鼠肥胖的预防作用及对脂肪分化的影响
被引量:
3
2
作者
刘梅芳
孙悦
李丽
机构
济宁医学院药学院
出处
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期899-905,共7页
基金
国家级大学生创新训练计划项目(No.201610443038)
济宁医学院大学生创新训练计划项目(No.cx2016038)。
文摘
目的:研究枸骨叶水提物(ICAE)对高脂饮食(HFD)小鼠肥胖的预防作用及对脂肪分化的影响.方法:本研究采用HFD诱导小鼠肥胖,同时灌胃给予ICAE,以奥利司他(orlistat)为阳性对照药。39只昆明雄性小鼠分成4组,包括对照组(n=10)、肥胖模型组(n=9)、orlistat治疗组(n=10)和ICAE治疗组(n=10)。以体重、腹内和皮下脂肪含量、肝重以及血清甘油三酯(TG)和总胆固醇(TC)水平为指标,观察ICAE对肥胖的预防作用;在实验第5周,连续5 d监测ICAE对小鼠24 h平均摄食量的影响;HE染色观察ICAE对脂肪组织的影响。分离和培养大鼠附睾来源的前脂肪细胞,尼罗红染色观察ICAE对分化脂肪细胞内脂滴形态的影响,Western blot法检测ICAE对细胞内过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、脂滴包被蛋白1(Plin1)及激素敏感性脂肪酶(HSL)蛋白表达的影响。结果:ICAE可以显著抑制HFD引起的小鼠体重、腹内和皮下脂肪含量以及肝重的增加(P<0.01),并且显著降低血清TC和TG水平(P<0.01),但是对摄食量无显著影响;HE染色显示,ICAE能够显著减少HFD引起的白色脂肪细胞肥大。此外,在原代培养的大鼠分化脂肪细胞中,ICAE可以显著抑制细胞内脂滴的积累,并且显著下调脂肪分化关键转录因子PPARγ以及脂肪分化标志物Plin1和HSL的蛋白水平(P<0.01)。结论:ICAE对HFD诱导的小鼠肥胖具有预防作用,但对摄食量无明显影响;ICAE可以显著抑制脂肪分化过程,此作用可能与下调PPARγ的蛋白表达有关。
关键词
枸骨叶水提物
肥胖
脂
肪分化
过氧化物酶体增殖物激活受体Γ
脂滴包被蛋白1
激素敏感性
脂
肪酶
Keywords
Ilex cornuta aqueous extract
Obesity
Adipose differentiation
Peroxisome proliferator-activated receptorγ
Perilipin
1
Hormone-sensitive lipase
分类号
R965 [医药卫生—药理学]
R589.2 [医药卫生—内分泌]
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职称材料
题名
PLIN1在肝细胞癌中的表达及其临床意义
3
作者
黄江华
覃宇奇
张瑞
冯振博
机构
广西医科大学第一附属医院病理科
广西壮族自治区江滨医院病理科
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2022年第11期1726-1733,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81860419)。
文摘
目的:探讨脂滴包被蛋白-1(PLIN1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床意义。方法:采用实时荧光定量PCR(RTqPCR)检测HCC细胞系(SK-HEP-1、Huh7)和正常肝细胞系(L02)中PLIN1 mRNA表达水平。采用免疫组织化学染色法检测94例HCC组织及82例癌旁肝组织中PLIN1蛋白表达水平,并分析PLIN1表达与HCC患者临床病理参数间的关系。通过肿瘤基因组图谱(TCGA)、基因型组织表达数据库(GTEx)和基因表达综合数据库(GEO)收集RNA测序及芯片数据,进一步验证PLIN1在HCC中的表达。使用Kaplan-Meier法对HCC患者进行生存分析。基于TCGA数据库的表达数据及相应临床病理参数构建多因素Cox回归及列线图预测模型,评估HCC的危险因素及患者预后。结果:与正常肝细胞系相比,PLIN1 mRNA在HCC细胞系中表达降低(P<0.001);免疫组化结果显示,PLIN1蛋白在HCC组织中表达低于癌旁肝组织(P<0.001)。公共数据整合分析结果显示,PLIN1在HCC组织中表达下调[SMD=-0.76(-0.98~-0.53),I2=80.8%,P<0.001]。生存分析及列线图预测模型均提示HCC中PLIN1低表达患者生存时间短于高表达患者(P<0.05)。结论:PLIN1在HCC中低表达,且与患者的不良预后相关。
关键词
脂
滴
包被
蛋白
-1
肝细胞癌
预后
Keywords
Perilipin
1
hepatocellular carcinoma
prognosis
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PLIN1基因InDel位点检测及其与同羊尾脂和生长性状的关联分析
邱彦博
阮子豪
易晓华
谢浦航
袁婷婷
孙秀柱
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
枸骨叶水提物对小鼠肥胖的预防作用及对脂肪分化的影响
刘梅芳
孙悦
李丽
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
下载PDF
职称材料
3
PLIN1在肝细胞癌中的表达及其临床意义
黄江华
覃宇奇
张瑞
冯振博
《广西医科大学学报》
CAS
2022
0
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