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脂质生物合成的转录调控、相关靶标确证及新药发现 被引量:3
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作者 林超 柳军 孙宏斌 《中国科学:化学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期923-936,共14页
脂质生物合成失调是代谢异常的重要方面,与高脂血症、胰岛素抵抗、动脉粥样硬化、骨质疏松及肿瘤等多种疾病密切相关.在转录调控层面上,固醇调节元件结合蛋白和肝脏X型受体二者分别负责脂质生物合成及转运代谢相关蛋白的调控.两条调控... 脂质生物合成失调是代谢异常的重要方面,与高脂血症、胰岛素抵抗、动脉粥样硬化、骨质疏松及肿瘤等多种疾病密切相关.在转录调控层面上,固醇调节元件结合蛋白和肝脏X型受体二者分别负责脂质生物合成及转运代谢相关蛋白的调控.两条调控信号网络之间既相互关联又互相制约,共同维持体内脂质代谢的平衡.转录共激活因子PGC-1?同时调控SREBP、LXR和ERR?三种转录因子的活性,在脂代谢转录调节方面处于关键枢纽地位. 展开更多
关键词 脂质生物合成 SREBPs LXR PGC-1β ERRα
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6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶在产油细菌浑浊红球菌PD630脂质积累中的作用 被引量:2
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作者 张冬冬 赵利娜 +2 位作者 昝新艺 唐鑫 宋元达 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期61-68,共8页
产油微生物脂质合成的过程已基本清晰:乙酰辅酶A和还原力NADPH在脂肪酸合酶(FAS)的作用下合成脂肪酸。产油微生物菌体内主要有苹果酸酶(ME)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)、6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6PGDH)和异柠檬酸脱氢酶(ICDH)为其脂质... 产油微生物脂质合成的过程已基本清晰:乙酰辅酶A和还原力NADPH在脂肪酸合酶(FAS)的作用下合成脂肪酸。产油微生物菌体内主要有苹果酸酶(ME)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)、6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6PGDH)和异柠檬酸脱氢酶(ICDH)为其脂质合成提供所需还原力NADPH。为了研究6PGDH在浑浊红球菌PD630(Rhodococcus opacus PD630)脂质积累中的作用,作者将编码氧化磷酸戊糖路径(oxPPP)中6PGDH的基因gnd在R. opacus PD630中过表达。结果表明,与对照菌株相比较,过表达gnd的重组菌株总脂肪酸含量提高了20%~30%,且6PGDH酶活力和gnd的转录水平也显著提高。由此可见,6PGDH在R. opacus PD630脂质合成中具有重要的作用,能为其提供所需的还原力NADPH,以促进其脂质的积累。 展开更多
关键词 6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶 脂质生物合成 NADPH 产油微生物 浑浊红球菌PD630
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基于网络药理学和分子对接探究罗布麻叶抗高脂血症的作用机制 被引量:10
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作者 许泽恭 祝晨蔯 +5 位作者 周玖瑶 赵钟祥 李瑜 章娟 周园 张蕾 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1154-1163,共10页
目的基于网络药理学和分子对接方法探究罗布麻叶(Apocynum venetum L.leaves,AVL)抗高脂血症的活性成分和分子作用机制。方法依据中药药理学技术平台(TCMSP)数据库、SuperPred webserver、STITCH、SwissTargetPrediction和PharmMapper... 目的基于网络药理学和分子对接方法探究罗布麻叶(Apocynum venetum L.leaves,AVL)抗高脂血症的活性成分和分子作用机制。方法依据中药药理学技术平台(TCMSP)数据库、SuperPred webserver、STITCH、SwissTargetPrediction和PharmMapper数据库,筛选罗布麻叶的潜在活性成分、预测潜在作用靶点。从OMIM、DrugBank和GeneCard数据库搜索高脂血症疾病的相关靶点信息,由Cytoscape生物信息分析软件构建“分子-靶点-疾病”网络。在String数据库中构建蛋白互作网络并在Cytoscape中进行可视化。采用Cytoscape和Bioconductor数据库分别对交集靶点进行GO和KEGG通路富集分析,最终采用分子对接进行初步验证。结果筛选出罗布麻叶中金丝桃苷、槲皮素和山柰酚等28个活性成分,作用于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、肿瘤蛋白P53(TP53)和丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3/ERK1)等129个潜在靶点,GO分析发现罗布麻叶治疗高脂血症的潜在靶点主要参与压力应激、脂质代谢和类固醇代谢等生物过程,KEGG通路分析主要涉及流体剪切应力与动脉粥样硬化、IL-17和AGE-RAGE等信号通路。分子对接结果表明潜在活性成分和AKT1、TP53和MARK3等关键靶蛋白均能稳定结合。结论本研究初步阐述了罗布麻叶抗高脂血症的作用机制,发现其通过脂质生物合成、炎症反应调控和氧化应激等过程发挥治疗高脂血症的作用。 展开更多
关键词 血症 罗布麻叶 网络药理学 分子对接 脂质生物合成 炎症反应调控 氧化应激
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3个基因共调控下莱茵衣藻的转录组分析 被引量:2
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作者 黄瑛 李小连 +3 位作者 殷剑波 林永祺 彭小波 贾彬 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第2期194-200,共7页
为研究多基因调控下微藻油脂合成调控的分子机制,对acs2-cis1-dof基因共调控的莱茵衣藻藻株DLC进行转录组测序及分析,获得749个差异表达基因.通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)聚类分析发现,... 为研究多基因调控下微藻油脂合成调控的分子机制,对acs2-cis1-dof基因共调控的莱茵衣藻藻株DLC进行转录组测序及分析,获得749个差异表达基因.通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)聚类分析发现,有51个差异表达基因参与碳水化合物代谢,15个差异表达基因参与脂质代谢,差异基因主要富集在甘油酯代谢、脂肪酸降解、糖酵解及糖异生、淀粉和蔗糖代谢等通路中.采用BODIPY 505/515荧光染色法检测发现,热激后莱茵衣藻藻株DLC细胞内的甘油三酯质量较野生型提高了193%,通过检测吸光度发现藻细胞的淀粉质量降低了45%,说明基因共调控不仅增强了脂质合成代谢,还使得糖代谢中的碳流重新定向.研究工作为探究基因共调控下脂质合成代谢的分子机理以及微藻产油基因工程提供理论参考. 展开更多
关键词 基因工程 生物信息学 转录组 acs2基因 cis1基因 DOF转录因子 脂质生物合成 莱茵衣藻
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Utilization of Crude Glycerol by Yarrowia lipolytica IMUFRJ 50678 in Bioproduct Production
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作者 Jamile Ribeiro Coelho de Lima Renata Oliveira da Rocha Calixto +1 位作者 Lea Maria de Almeida Lopes Francisca Pessoa de Franca 《Journal of Chemistry and Chemical Engineering》 2013年第11期1087-1093,共7页
Transesterification is the most common production process for biodiesel. From this reaction, a glycerin phase is produced that is impure, thus lowering market value. However, because it is rich in carbon, it is an alt... Transesterification is the most common production process for biodiesel. From this reaction, a glycerin phase is produced that is impure, thus lowering market value. However, because it is rich in carbon, it is an alternative for generating bioproducts with a higher added value through bioconversion by microorganisms. The aim of this study was to screen parameters, such as pH (4, 5, 6, 7 and 8) and the initial glycerol concentration at 30 ± ℃ with agitation at 150 rpm for bioemulsifier and lipid synthesis in a submerged medium by Yarrowia lipolytica IMUFRJ 50678 from crude glycerin. The best conditions for bioemulsifier production were 30 ± ℃ at pH: 6 with 50 g/L of initial substrate, which produced 2.7 g/L of lipids, from which the optimum 300.5 mg/L of triglycerides was produced over 48 h of microorganism growth. 展开更多
关键词 Crude glycerol Yarrowia lipolytica BIODIESEL bioproducts.
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