期刊文献+
共找到7篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
牡丹非特异性脂质转移蛋白基因PsLTP的生物信息学分析
1
作者 问荣荣 苏钰 +3 位作者 高泽芳 徐梦宇 何雯雯 王步勇 《安徽农业科学》 CAS 2024年第2期87-92,共6页
[目的]了解牡丹非特异性脂质转移蛋白基因LTP的基因特征及其编码蛋白的生物学特性,探索其生物功能。[方法]运用Blast、ORF-Finder、ProtParam、SignalP 4.1、ProtScale和TMHMM 2.0 Server等生物信息学软件,分析牡丹nsLTP基因序列及其编... [目的]了解牡丹非特异性脂质转移蛋白基因LTP的基因特征及其编码蛋白的生物学特性,探索其生物功能。[方法]运用Blast、ORF-Finder、ProtParam、SignalP 4.1、ProtScale和TMHMM 2.0 Server等生物信息学软件,分析牡丹nsLTP基因序列及其编码蛋白的基本理化性质、信号肽、磷酸化位点、保守结构域等,并运用DANMAN、MEGA软件进行多序列比对和系统发育树构建。[结果]牡丹nsLTP基因(NCBI登录号为:JZ840269.1)序列全长为685 bp,开放阅读框长为354 bp,编码蛋白包含117个氨基酸,理论等电点为8.93,为不稳定性蛋白。牡丹nsLTP蛋白为疏水性蛋白,含有信号肽但不含跨膜结构域,NetPho Server预测其含有8个丝氨酸和3个酪氨酸磷酸化位点及5个苏氨酸磷酸化位点。PsnsLTP蛋白具有植物LTP蛋白典型结构,即4个α-螺旋,4对二硫键,1个可结合和容纳脂质分子的疏水结构。多序列比对及系统发育树分析显示,PsLTP蛋白与绒毛烟草LTP蛋白(XP_009608993.1)的相识度62.7%,且进化树聚为同一小分支,遗传距离较近。[结论]通过对牡丹nsLTP基因特性及蛋白结构研究,系统性研究了牡丹nsLTP基因的生物信息学特性,为牡丹抗病抗逆功能基因的研究提供了依据,也为其他植物nsLTP基因研究提供了参考。 展开更多
关键词 牡丹 非特异性转移蛋白基因LTP 蛋白结构 生物信息学
下载PDF
骆驼蓬脂转移蛋白基因真核表达载体的构建及其体内外抗瘤效应的研究 被引量:1
2
作者 赵晶 吕慧 +1 位作者 贾依娜古丽.朱玛拜 孙素荣 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期7-13,共7页
目的:构建骆驼蓬脂转移蛋白(lipid transfer protein from Peganum harmala,PhLTP)基因真核表达质粒,并探讨其对黑色素瘤B16细胞在体内外的抗肿瘤作用。方法:将PhLTP基因亚克隆至pcDNA3.1上,获得重组质粒pcDNA3.1-PhLTP;用脂质体转染法... 目的:构建骆驼蓬脂转移蛋白(lipid transfer protein from Peganum harmala,PhLTP)基因真核表达质粒,并探讨其对黑色素瘤B16细胞在体内外的抗肿瘤作用。方法:将PhLTP基因亚克隆至pcDNA3.1上,获得重组质粒pcDNA3.1-PhLTP;用脂质体转染法将重组质粒及空载体外转染B16细胞,MTT检测其对B16细胞生长的影响。建立B16荷瘤小鼠模型,设重组质粒(pcDNA3.1-PhLTP)、空载(pcDNA3.1)、生理盐水和阳性药物(CTX)组,分别处理小鼠后测量各组肿瘤体积并称瘤重,计算抑瘤率。光镜观察鼠脾、肝等组织变化;免疫组织化学法检测各瘤体中PhLTP、血管内皮生长因子(VEGF)及碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)的表达。结果:pcDNA3.1-PhLTP转染B16细胞72 h后,细胞增殖能力明显受到抑制(P<0.01)。注射pcDNA3.1-PhLTP组的小鼠肿瘤生长速度明显减慢,肿瘤体积小于空载和生理盐水组(P<0.05)。显微镜下可见重组质粒组肿瘤细胞有不同程度的点、片状坏死,而肝、肺等无明显病理损伤。重组质粒组肿瘤组织中有PhLTP蛋白的表达,且VEGF和bFGF的阳性表达指数都低于空载和生理盐水组(P<0.01)。结论:成功构建了重组表达质粒pcDNA3.1-PhLTP,体内外实验结果显示其能有效地抑制B16细胞的生长,预示了该重组质粒在治疗黑色素瘤中的潜在应用价值。 展开更多
关键词 骆驼蓬脂转移蛋白基因 转染 生长抑制 鼠黑色素瘤B16 血管生成
原文传递
烟草非特异性脂质转移蛋白基因的克隆与表达分析 被引量:5
3
作者 金大伟 杨军 +6 位作者 李锋 王燃 罗朝鹏 武明珠 魏攀 侯明生 林福呈 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第1期12-20,共9页
为了阐明非特异性脂质转移蛋白基因Nt LTP1.1在烟草抗病抗逆反应中的功能,用c DNA末端快速扩增技术(Rapid-amplification of c DNA ends,RACE)从普通烟草中克隆了该基因全长,并通过生物信息学方法分析了c DNA序列结构、蛋白理化性质、... 为了阐明非特异性脂质转移蛋白基因Nt LTP1.1在烟草抗病抗逆反应中的功能,用c DNA末端快速扩增技术(Rapid-amplification of c DNA ends,RACE)从普通烟草中克隆了该基因全长,并通过生物信息学方法分析了c DNA序列结构、蛋白理化性质、保守基序、三级结构以及系统进化关系;利用q RT-PCR检测了该基因在不同组织中的表达模式以及胁迫条件下的表达差异。结果表明:Nt LTP1.1基因全长615 bp,编码蛋白含有129个氨基酸,为一种小分子碱性可溶性蛋白。蛋白序列N端含有信号肽,预测其可能定位于分泌途径中。Blast比对结果显示,烟草非特异性脂质转移蛋白与番茄ns LTP1序列相似性最高,含有8CM保守基序(8个半胱氨酸残基组成的保守基序)。蛋白三级结构预测表明,Nt LTP1.1具有ns LTP典型的三级结构,包括4个α-螺旋,4对二硫键,1个可结合和容纳脂质分子的疏水腔。多重比对结果显示,Nt LTP1.1 8CM结构域模式为C1-X9-C2-X13-C3C4-X19-C5XC6-X22-C7-X13-C8。系统进化分析结果表明,ns LTP进化形成5类,Nt LTP1.1属于Type I。表达模式分析显示,Nt LTP1.1基因主要在烟草叶片中表达,具有明显的组织表达特异性。在低温胁迫条件下表达受到抑制,在水杨酸诱导条件下表达上调。因此,推测Nt LTP1.1基因可能在烟草防御反应中发挥作用。 展开更多
关键词 烟草 非特异性转移蛋白基因 克隆 表达分析 生物信息学
下载PDF
蜡梅花cDNA文库构建及其高频出现脂转移蛋白cDNA的表达 被引量:16
4
作者 眭顺照 李名扬 +4 位作者 蒋安 王洋 秦华 皮伟 任琛 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期644-648,共5页
目的构建蜡梅花cDNA文库,分析蜡梅脂转移蛋白基因的表达,为探索蜡梅冬季开花分子机理,分离克隆特色基因奠定基础。方法以蜡梅花器官为材料,用SMART cDNA Library Construction Kit构建文库,RT-PCR分析基因表达。结果经测定原始文库滴度... 目的构建蜡梅花cDNA文库,分析蜡梅脂转移蛋白基因的表达,为探索蜡梅冬季开花分子机理,分离克隆特色基因奠定基础。方法以蜡梅花器官为材料,用SMART cDNA Library Construction Kit构建文库,RT-PCR分析基因表达。结果经测定原始文库滴度达到1.4×106 pfu/ml,扩增总文库滴度约为1010pfu/ml,重组率达到96%,插入片段在0.5 kb以上,平均约1.1 kb,通过PCR检测,从总文库中检测到了表达丰度不同的蜡梅PI、AP3和LTP基因的特异片段,说明所构建的文库覆盖度高、代表性强,LTP基因具有内含子,而总文库中扩增出的LTP基因不含内含子,说明所构建的cDNA文库无基因组DNA污染,LTP基因在蜡梅开花各个时期均表现较高的转录水平,与EST分析时高频率出现LTP序列的情况相符,证实所构建的文库能够反映蜡梅开花过程基因表达的基本情况。结论已获得高质量的蜡梅花cDNA文库,可以用于进一步的基因克隆或EST测序分析,这是首次正式报道蜡梅cDNA文库的构建。LTP基因在蜡梅开花过程中可能具有重要的生物学功能,为探索蜡梅冬季开花分子机理提供了线索。 展开更多
关键词 蜡梅 CDNA文库 脂转移蛋白基因 RT-PCR
下载PDF
黔邵花猪CETP基因多态特征及其与生长性能的相关性 被引量:11
5
作者 魏麟 姚元枝 +1 位作者 刘胜贵 向德标 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期302-304,共3页
应用PCR-RFLP技术对湖南黔邵花猪280头个体的血浆胆固醇脂转移蛋白(CETP)基因436 bp进行扩增,用限制性内切酶AvaⅡ对其酶切可得到3种基因型.应用最小二乘单因素模型分析不同基因型对初生重、45日龄重、6月龄日重、体高、体长、膘厚的影... 应用PCR-RFLP技术对湖南黔邵花猪280头个体的血浆胆固醇脂转移蛋白(CETP)基因436 bp进行扩增,用限制性内切酶AvaⅡ对其酶切可得到3种基因型.应用最小二乘单因素模型分析不同基因型对初生重、45日龄重、6月龄日重、体高、体长、膘厚的影响.结果显示:CETP基因AvaⅡ酶切位点的各基因型对各生长性状的影响差异显著(P<0.05),对膘厚的影响差异极显著(P<0.01),Aa基因型对初生重、45日龄重、6月龄重、体高、体长等性状的影响较大,AA基因型相对较低.由此可知,CETP基因是影响生长性状的一个重要基因. 展开更多
关键词 黔邵花猪 血浆胆固醇脂转移蛋白基因 生长性能
下载PDF
两种抗病基因双T-DNA区双元载体的构建 被引量:1
6
作者 吴磊 史秀岚 +2 位作者 田巍 刘巧泉 王幼平 《分子植物育种》 CAS CSCD 2010年第5期976-980,共5页
选择标记基因的删除是植物转基因工程中重要的步骤之一,双T-DNA区双元载体转化法以其共整合频率高、删除标记基因效率高的优点在植物遗传转化中应用非常广泛。本文通过构建天麻抗真菌蛋白基因、脂质转移蛋白基因双T-DNA区双元载体,为培... 选择标记基因的删除是植物转基因工程中重要的步骤之一,双T-DNA区双元载体转化法以其共整合频率高、删除标记基因效率高的优点在植物遗传转化中应用非常广泛。本文通过构建天麻抗真菌蛋白基因、脂质转移蛋白基因双T-DNA区双元载体,为培育不含选择标记基因的抗病新材料奠定基础。通过PCR的方法克隆GAFP基因,产物纯化测序确定序列准确后与pSB130-35S载体进行BamHⅠ、SacⅠ双酶切;pCAMBIA2300-LTP、pSB130-35S经EcoRⅠ、HindⅢ双酶切,酶切产物纯化后连接,连接产物转化大肠杆菌。采用基因特异性引物进行菌液PCR鉴定阳性克隆,重组质粒pSB130-GAFP、pSB130-LTP双酶切产物大小分别为540bp、1200bp,与预期产物大小一致,pSB130-GAFP、pSB130-LTP双T-DNA区双元载体构建成功。载体pSB130-GAFP、pSB130-LTP转化根癌农杆菌后可以直接用于植物的遗传转化。 展开更多
关键词 双元载体 双T-DNA区 天麻抗真菌蛋白基因 转移蛋白基因
下载PDF
Cloning of Novel Tumor Metastasis-Related Genes from the Highly Metastatic Human Lung Adenocarcinoma Cell Line Anip973
7
作者 刘芳莉 李钰 +2 位作者 于旸 傅松滨 李璞 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第3期189-195,共7页
A cDNA library was successfully constructed from Anip973, a human lung adenocarcinoma cell line with high metastatic potential. NIH3T3 cells were stably transfected using this cDNA library and screened for morphologic... A cDNA library was successfully constructed from Anip973, a human lung adenocarcinoma cell line with high metastatic potential. NIH3T3 cells were stably transfected using this cDNA library and screened for morphological changes in a soft agar assay. Genomic DNA was isolated from putative clones and the integrated sequence was retrieved by PCR and sequencing. Three known genes, ribosomal protein L23, hypothetical protein FLJ22104, and serine protease inhibitor, kazal type 6 and a number of 5'-terminally truncated sequences were identified. Furthermore, cells transfected with ribosomal protein L23 was highly invasive compared with the empty vector as control (P 〈 0.02). These results indicate that the expression cloning of cDNA libraries in NIH3T3 cells and subsequent screening for loss of contact inhibition in soft agar is a viable tool for identifying tumor-related genes and ribosomal protein L23 gene plays a role in cell movement and metastasis. 展开更多
关键词 cDNA expression library soft agar ONCOGENE METASTASIS Homo sapiens ribosomal protein L23
下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部