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高通量脑片细胞识别方法:基于Imaris与ImageJ的对比研究
1
作者
赵高炀
冯晓龙
王枫
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
2021年第6期637-645,共9页
目的:面对高分辨率的海量脑片染色信号数据,建立一种统一的方法来便捷的实现多场景下的准确识别.方法:选择5套不同分子标记的小鼠鼠脑荧光图像数据,对比分析了ImageJ和Imaris两种识别方法与人工识别的差异.结果:对于清晰无重叠的荧光信...
目的:面对高分辨率的海量脑片染色信号数据,建立一种统一的方法来便捷的实现多场景下的准确识别.方法:选择5套不同分子标记的小鼠鼠脑荧光图像数据,对比分析了ImageJ和Imaris两种识别方法与人工识别的差异.结果:对于清晰无重叠的荧光信号,Imaris和ImageJ均能进行快速准确地识别.而当图像内信号强度差异较大时,Imaris参数调整的识别结果是实时可见的,且鲁棒性较好,同一参数即可对全部信号进行较准确的量化,但在ImageJ中需要根据信号强度设置不同的参数进行多次识别.结论:Imaris是一种理想的、可以实现快速、方便、准确地识别和计算高通量脑片中荧光信号的方法.
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关键词
高通量细胞识别
脑片荧光信号
细胞计数
Imaris
IMAGEJ
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职称材料
题名
高通量脑片细胞识别方法:基于Imaris与ImageJ的对比研究
1
作者
赵高炀
冯晓龙
王枫
机构
中国科学院深圳先进技术研究院
中国科学院大学
出处
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
2021年第6期637-645,共9页
基金
广东省重点领域研发计划(2018B030331001)
粤港澳大湾区脑科学与类脑研究中心开放课题(2019025)
深圳市科技计划(ZDSYS20200828154800001)。
文摘
目的:面对高分辨率的海量脑片染色信号数据,建立一种统一的方法来便捷的实现多场景下的准确识别.方法:选择5套不同分子标记的小鼠鼠脑荧光图像数据,对比分析了ImageJ和Imaris两种识别方法与人工识别的差异.结果:对于清晰无重叠的荧光信号,Imaris和ImageJ均能进行快速准确地识别.而当图像内信号强度差异较大时,Imaris参数调整的识别结果是实时可见的,且鲁棒性较好,同一参数即可对全部信号进行较准确的量化,但在ImageJ中需要根据信号强度设置不同的参数进行多次识别.结论:Imaris是一种理想的、可以实现快速、方便、准确地识别和计算高通量脑片中荧光信号的方法.
关键词
高通量细胞识别
脑片荧光信号
细胞计数
Imaris
IMAGEJ
Keywords
high-throughput image identification
fluorescent signals in brain sections
cell counting
Imaris
ImageJ
分类号
Q42 [生物学—神经生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高通量脑片细胞识别方法:基于Imaris与ImageJ的对比研究
赵高炀
冯晓龙
王枫
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
2021
0
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