基于Z曲线方法重新注释脑膜炎奈瑟菌MC58株基因组

已测序的微生物基因组中包含的注释开放阅读框(open reading frames,ORFs)可以分为两大类:第一类对应于功能已知的蛋白质编码基因;第二类则为功能未知的假设ORFs,其中通常有一部分实际上不编码蛋白质。采用基于Z曲线的方法从属于第一类的功能已知基因出发训练参数,进而确定第二类ORFs中非编码的部分。通过支持向量机的学习及分类,结果显示十重交叉检验平均正确率为98.45%,说明Z曲线联合支持向量机是一种高度准确的基因识别方法。最终,确定216个假设ORFs实际上不编码蛋白质。通过采用Blastp进行序列比对,保留的假设ORFs中有341个在高可靠性的条件下获得了功能信息。根据蛋白质直系同源簇方法进行功能分类,分别有30、53、59和159个新注释的假设ORFs属于信息储存和加工类、细胞加工和信号传递类、新陈代谢类和特征不明显类。另外还有70个不属于其中的任何一类。注释结果比RefSeq及GenBank提供的原注释更加准确,更加完整。

脑膜炎奈瑟菌W群11序列型复合物的增加与英格兰和威尔士的侵袭性疾病相关

背景：在英格兰和威尔士地区,侵袭性脑膜炎球菌病的发病率十多年以来一直持续下降,但脑膜炎球菌W群（MenW）引起的病例从2009年以来就一直持续增长。方法：英国公共卫生当局实施强化的对英格兰和威尔士地区侵袭性脑膜炎球菌疾病的国家监测。获得了诊断于3年流行时期（2010—2011到2012—2013）的所有实验室确诊的由W群（MenW）引起的病例的详细资料,另外对临床分离株做了全基因组测序分析。

脑膜炎奈瑟氏菌细菌素的分型研究

细菌素是细菌产生的一种能抑制某些细菌生长的蛋白质类物质。其抑菌作用方式可能系终止细菌蛋白质的合成,与噬菌体相似都有溶源性菌株,但不能繁殖,并可被蛋白酶降解。根据细菌素的敏感性,我国学者丁绍卿等从204株A群菌株中选出9株,可将A群分为17个型。何晓青等也对流脑菌株进行细菌素分型。1982年与1986年我们自流脑流行区、散发区及非流行分得的A群菌株共34株,进行了细菌素的分型研究,现报告如下:

B群脑膜炎奈瑟菌、大肠杆菌K1菌株、溶血巴斯德菌A2菌株的荚膜多糖疫苗

B群脑膜炎奈瑟菌等细菌的荚膜多糖是细菌的主要毒力因子和保护性抗原，由N-乙酰-D-神经氨酸（NeuSAc）通过α（2→8）键连接形成（2→8）-α-NeuSAc复合物。

中国C群脑膜炎奈瑟菌脉冲场凝胶电泳分析

目的对中国C群脑膜炎奈瑟菌分离株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,了解安徽省C群流行性脑脊髓膜炎(流脑)暴发菌株及国内C群脑膜炎奈瑟菌菌株的分子流行病学特征。方法212株C群脑膜炎奈瑟菌菌株分离自流脑患者、密切接触者和健康人群鼻咽部,包括安徽省C群流脑菌株48株,其中38株与C群流脑暴发相关。脉冲场凝胶电泳选用NheⅠ限制性内切酶,聚类分析选用BioNumerics软件。结果212株C群脑膜炎奈瑟菌菌株共分为43个PFGE带型,命名为AHl～AH43,AH1是中国C群脑膜炎奈瑟菌主要的带型,占69.3%(n=147),分布于11个省市。安徽省48株C群菌株共分为3个PFGE型别(AH1、AH2、AH3),45株(93.8%)为AH1型。安徽省38株与C群流脑暴发相关的菌株中,37株(97.4%)为AH1型。全国53株流脑患者分离菌株中,AH1型菌株占67.9%(36/53);121株流脑病例密切接触者分离菌株中。AH1型占71.9%(87/121),38株健康人群鼻咽部分离菌株中,AH1型占63.2%(24/38)。结论AH1型C群脑膜炎奈瑟菌是中国目前C群流脑流行的主要克隆群,安徽省C群流脑暴发是由AH1型C群脑膜炎奈瑟菌引起的,已在全国呈扩散流行的趋势。

流行性脑脊髓膜炎的流行病学

流行性脑脊髓膜炎是由脑膜炎奈瑟菌引起的经呼吸道传播所致的一种化脓性脑膜炎。脑膜炎奈瑟菌属奈瑟菌属，为革兰阴性双球菌，菌体呈肾形或豆形，直径0．6～1．0μm，凹面相对，成双排列，亦可以呈4个菌相联。该菌仅存在于人体，可以在带菌者鼻咽部及病人血液、脑脊液、皮肤瘀点中发现。本菌属专属需氧菌，营养要求高，普通培养基上不能生长，常用巧克力色血琼脂平板，在5％~10％C0：、PH7．4～7．6条件下最易生长。本菌按其表面特异性多糖抗原不同，可以分为A、B、C、D、E、X、Y、Z、W135、H、I、K、L等13个群，还可根据外膜蛋白抗原差异分为20多个血清型。其中以A、B、C三群最常见，占90％以上；其中C群致病力最强；B群次之，Y群最弱。不同时期不同地区流行菌株有所不同，近30年来我国流行菌株一直是A群，占90％以上，B群和C群为散发菌株，但是B群流行有上升趋势。本菌裂解可以释放内毒素，为其致病重要因素，并可以产生自溶酶，在体外易自溶死亡。

全球2008～2014年疫苗可预防侵袭性细菌性疾病的监测

脑膜炎和肺炎是全球儿童发病和死亡的首要病因,大多数病例是由肺炎球菌（Streptococcus pneumoniae,Sp）、脑膜炎奈瑟菌（Neisseria meningitidis,Nm）和流行性感冒（流感）嗜血杆菌（Haemophilus influenzae,Hi）感染所引起的。现有的疫苗可预防上述细菌多种血清群（型）的感染。