测序反应中PCR产物纯化方法的比较

目的寻找最佳的PCR产物纯化方法,建立稳定的重亚硫酸盐直接测序技术平台。方法应用过柱、乙醇／醋酸钠及SAP-Exon Ⅰ 3种纯化方法,对10例PCR产物进行纯化。结果经配对资料t检验,乙醇／醋酸钠和过柱纯化与SAP-Exon Ⅰ纯化法比较,纯化后PCR产物损失量均有极显著性差异(P<0．01),测序结果也有显著性差异(P<0．05)。结论应用SAP- Exon Ⅰ纯化法,PCR产物损失量低,测序结果明显优于另外两种方法。

OPRM1基因PCR产物和测序产物三种纯化方法的比较

目的探讨一种快速、简便、效果好的OPRM1基因PCR产物和测序产物纯化方法，建立稳定的DNA测序技术平台。方法采用乙醇／醋酸钠、过柱和SAp-Exonuclease1结合BigDyeXterminatorPurificationKit3种纯化方法，对50份OPRMl基因PCR产物和测序产物进行纯化效果的比较。结果SAP—ExonucleaseI法对PCR反应产物进行纯化的回收率显著高于乙醇／醋酸钠和过柱法，分别为0．86±0．01，0．48±0．08，0．65±0．01（t=32．5，P〈0．001；t=86．1，P〈0．001）；BigDyeXterminatorPurificationKit法对测序产物进行纯化成功率显著高于乙醇／醋酸钠和过柱法，分别为100％，62％和84％（x2=23．46，P〈0．001；x2=8．70，P=0．003）。结论SAP—ExonucleaseI结合BigDyexterminatorPurifica—tionKit是一种快速、简便、效果好的测序纯化方法。

重亚硫酸盐修饰直接测序技术检测p16基因甲基化的研究

目的建立稳定的重亚硫酸盐直接测序技术,检测p16基因甲基化状况。方法提取正常人全血基因组DNA,建立起稳定的重亚硫酸盐直接测序平台,利用该技术检测结直肠癌细胞株p16基因甲基化状况。结果应用列联表的Fisher,ExactTest比较3种纯化方法的测序结果,乙醇/醋酸钠和过柱纯化与SAP-ExonI纯化法比较,测序结果差异有统计学意义(P<0.05);应用重亚硫酸盐直接测序技术,可检测出p16基因目的片段中CpG岛所有CpG位点的甲基化状况。结论应用SAP-ExonI纯化法,建立了稳定的重亚硫酸盐直接测序技术,并可检测出目的片段中CpG岛所有CpG位点的甲基化状况。

激光诱导荧光技术在DNA计算输出中的应用

DNA计算机以其高度并行性和巨大的信息存储容量为NP-完全问题的解决提供了一种全新的方法,而快速准确的结果输出是其走向实用的关键之一。文章主要介绍激光诱导荧光(LIF)技术,并对LIF在DNA计算机输出中的应用进行了讨论。

基因芯片技术检测HBV DNA及拉米夫定耐药株的应用研究

目的 :研究基因芯片技术检测 HBV DNA及拉米夫定耐药株在临床应用中的特异性、实用性。方法 :利用基因芯片法、双脱氧测序法分别对 4 3例服用拉米夫定且 HBV DNA仍为阳性的乙型肝炎 (乙肝 )患者及 10例非乙肝患者的血清进行 HBV DNA和 P区 5 2 8、5 5 2、5 5 5突变位点检测、对比。结果 :两种方法检测 HBV DNA10 0 %相符 ;检测拉米夫定耐药突变株 12 4个位点结果相符 ,5个位点结果不相符 (P >0 .0 5 ) ,提示两种方法检测HBV DNA及 P区 5 2 8、5 5 2、5 5 5突变位点阳性率相等。结论 :利用基因芯片技术检测 HBV DNA及拉米夫定耐药株 ,其特异性可与 DNA测序媲美 ,在混合株检测方面比 DNA测序有更大的优势。其方法简便 ,能大量地对临床标本进行检测 ,可作为临床常规检测手段。

TAT-BPI融合蛋白原核表达载体的构建

目的 探讨使BPI能高效率穿透细胞膜或多种屏障,中和不同解剖部位的LPS,构建TAT-BPI原核表达载体并鉴定的方法,为研制多肽抗生素打下基础.方法 人工合成编码TAT蛋白转导区的DNA片段,插入载体pUC57后得到pUC57-TAT重组质粒;提取正常人外周血多形核粒细胞总RNA, 采用RT-PCR技术扩增BPI N端cDNA片段,构建pUC57-TAT-BPI克隆载体;用酶切和双脱氧测序法进行鉴定.结果 获得含有约630 bp的TAT-BPI融合蛋白基因片段序列,测序分析与Genebank中该序列相符,同源性分析TAT序列中第10、30位核苷酸有突变,氨基酸同源性为93%,蛋白质同源性为90%,在BPI序列中234、454、495、556位核苷酸有突变,氨基酸同源性为98%,蛋白质同源性为95%.结论 成功构建了TAT-BPI融合蛋白的原核表达载体,为进一步研究BPI的抗菌作用奠定了基础.