表型性状的准确记录及其有效管理和分析是选育优良畜禽品种(系)工作的重要内容。东北农业大学肉鸡腹脂率双向选择系(Northeast Agricultural University High and Low Fat,NEAUHLF)经过20年的选育工作积累了大量与肉鸡脂肪沉积的分子遗...表型性状的准确记录及其有效管理和分析是选育优良畜禽品种(系)工作的重要内容。东北农业大学肉鸡腹脂率双向选择系(Northeast Agricultural University High and Low Fat,NEAUHLF)经过20年的选育工作积累了大量与肉鸡脂肪沉积的分子遗传基础研究相关的表型数据。为了有效并系统地存储、管理和分析利用这些表型数据,本研究建立了东北农业大学肉鸡腹脂率双向选择系表型数据库(The NEAUHLF Phenome Database,NEAUHLFPD)管理系统。NEAUHLFPD主要涵盖以下表型记录和信息:1~19世代系谱记录和29项表型数据(分别为鸡体尺性状、体重性状、屠体性状及相应的率性状信息等)。该表型数据库的架构和设计过程具体如下:(1)架构信息。WEB服务器—Apache;数据库—MySQL;数据库管理工具—Navicat;用于动态交互性站点创建的服务器端脚本语言—PHP;超文本标记语言—HTML。(2)结构信息。主界面上有数据库整体组成及功能的详细介绍,以及数据库各部分基本结构的索引按钮。功能模块主要包含两方面内容:第一模块,表型(phenotype)数据的物理存储空间,可实现数据指标的选定、筛选、范围设定和查找等功能;第二模块,表型数据的基本描述性统计计算(descnptlve statlstms),可对条件筛选后的数据进行基本统计量的计算,同时还可实现对筛选数据的按条件排序等功能。NEAUHLFPD不仅能有效储存和管理表型数据,还可以兼容高通量基因组学数据,有利于今后进一步开展鸡脂肪组织生长发育的分子遗传基础研究以及推进低脂肉鸡的选育工作。展开更多
本研究旨在观察cGhrelin对黄羽肉鸡体重与腹脂率的调节作用。选择24只14日龄的黄羽肉鸡按体重随机分为试验组和对照组,试验组每天定时腹腔注射0.5 nmol/100 g cGhrelin,对照组注射相应体积的生理盐水;注射前称重,记录摄食量;第6天屠宰...本研究旨在观察cGhrelin对黄羽肉鸡体重与腹脂率的调节作用。选择24只14日龄的黄羽肉鸡按体重随机分为试验组和对照组,试验组每天定时腹腔注射0.5 nmol/100 g cGhrelin,对照组注射相应体积的生理盐水;注射前称重,记录摄食量;第6天屠宰检测腹脂率。结果表明:cGhrelin试验组的采食量于2 d后显著低于对照组(P<0.05);3 d后试验组体重比对照组降低11.25%(P<0.05);在第6天试验结束时,试验组公鸡腹脂率显著低于对照组(P<0.05),而母鸡差异不显著(P>0.05)。结果提示,cGhrelin具有降低黄羽肉鸡的食欲与采食量,减少脂肪沉积与体重增加。展开更多
为探讨HMG box蛋白1(HMG box protein 1,HBP1)基因启动子区多态性对鸡腹脂率的影响,以东北农业大学高、低脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,采用直接测序法检测HBP1基因多态性和个体基因型,共获得168个SNPs位点基因型。应用滑动...为探讨HMG box蛋白1(HMG box protein 1,HBP1)基因启动子区多态性对鸡腹脂率的影响,以东北农业大学高、低脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,采用直接测序法检测HBP1基因多态性和个体基因型,共获得168个SNPs位点基因型。应用滑动窗口法对位于该基因启动子区54个多态性位点构建单倍型,分别开展单位点和单倍型与鸡腹脂率的关联分析。结果表明,HBP1基因启动子区有7个(g.-5335G>A、g.-4354T>A、g.-3328C>T、g.-3327G>A、g.-1013T>C、g.-990G>A和g.-159A>C)位点显著影响肉鸡腹脂率(P<0.05)。此外,等位基因频率分析显示,这些位点等位基因频率在两系间分布存在极显著差异(P<0.0001)。研究结果表明,HBP1基因为影响鸡腹脂率重要候选基因,7个多态性位点为影响鸡腹脂率重要分子标记。展开更多
文摘表型性状的准确记录及其有效管理和分析是选育优良畜禽品种(系)工作的重要内容。东北农业大学肉鸡腹脂率双向选择系(Northeast Agricultural University High and Low Fat,NEAUHLF)经过20年的选育工作积累了大量与肉鸡脂肪沉积的分子遗传基础研究相关的表型数据。为了有效并系统地存储、管理和分析利用这些表型数据,本研究建立了东北农业大学肉鸡腹脂率双向选择系表型数据库(The NEAUHLF Phenome Database,NEAUHLFPD)管理系统。NEAUHLFPD主要涵盖以下表型记录和信息:1~19世代系谱记录和29项表型数据(分别为鸡体尺性状、体重性状、屠体性状及相应的率性状信息等)。该表型数据库的架构和设计过程具体如下:(1)架构信息。WEB服务器—Apache;数据库—MySQL;数据库管理工具—Navicat;用于动态交互性站点创建的服务器端脚本语言—PHP;超文本标记语言—HTML。(2)结构信息。主界面上有数据库整体组成及功能的详细介绍,以及数据库各部分基本结构的索引按钮。功能模块主要包含两方面内容:第一模块,表型(phenotype)数据的物理存储空间,可实现数据指标的选定、筛选、范围设定和查找等功能;第二模块,表型数据的基本描述性统计计算(descnptlve statlstms),可对条件筛选后的数据进行基本统计量的计算,同时还可实现对筛选数据的按条件排序等功能。NEAUHLFPD不仅能有效储存和管理表型数据,还可以兼容高通量基因组学数据,有利于今后进一步开展鸡脂肪组织生长发育的分子遗传基础研究以及推进低脂肉鸡的选育工作。
文摘为探讨HMG box蛋白1(HMG box protein 1,HBP1)基因启动子区多态性对鸡腹脂率的影响,以东北农业大学高、低脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,采用直接测序法检测HBP1基因多态性和个体基因型,共获得168个SNPs位点基因型。应用滑动窗口法对位于该基因启动子区54个多态性位点构建单倍型,分别开展单位点和单倍型与鸡腹脂率的关联分析。结果表明,HBP1基因启动子区有7个(g.-5335G>A、g.-4354T>A、g.-3328C>T、g.-3327G>A、g.-1013T>C、g.-990G>A和g.-159A>C)位点显著影响肉鸡腹脂率(P<0.05)。此外,等位基因频率分析显示,这些位点等位基因频率在两系间分布存在极显著差异(P<0.0001)。研究结果表明,HBP1基因为影响鸡腹脂率重要候选基因,7个多态性位点为影响鸡腹脂率重要分子标记。
