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基于基因集富集分析的犬膨大性心肌症关键基因通路筛选
1
作者
刘春慧
王起山
潘玉春
《上海交通大学学报(农业科学版)》
2012年第5期30-33,共4页
犬膨大性心肌症(DCM)是以心室功能受损心房室都显著膨大为显著特征的犬常见疾病。尽管此病的发病率非常高,但该疾病的的遗传机制研究较少。本研究利用基因集富集分析(GSEA)的方法,针对NCBI的GEO数据库中的DCM的表达芯片数据进行分析,共...
犬膨大性心肌症(DCM)是以心室功能受损心房室都显著膨大为显著特征的犬常见疾病。尽管此病的发病率非常高,但该疾病的的遗传机制研究较少。本研究利用基因集富集分析(GSEA)的方法,针对NCBI的GEO数据库中的DCM的表达芯片数据进行分析,共发现与犬膨大性心肌症相关的显著上调的基因通路4个,显著上调的GO集合15个。这些显著的基因集合可作为犬膨大性心肌症相关的候选通路,为进一步进行犬膨大性心肌症的早期诊断,预防和个性化治疗奠定基础。
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关键词
犬
膨大性心肌症
基因集富集分析
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职称材料
题名
基于基因集富集分析的犬膨大性心肌症关键基因通路筛选
1
作者
刘春慧
王起山
潘玉春
机构
上海交通大学农业与生物学院
出处
《上海交通大学学报(农业科学版)》
2012年第5期30-33,共4页
基金
国家自然科学基金(30671492)
文摘
犬膨大性心肌症(DCM)是以心室功能受损心房室都显著膨大为显著特征的犬常见疾病。尽管此病的发病率非常高,但该疾病的的遗传机制研究较少。本研究利用基因集富集分析(GSEA)的方法,针对NCBI的GEO数据库中的DCM的表达芯片数据进行分析,共发现与犬膨大性心肌症相关的显著上调的基因通路4个,显著上调的GO集合15个。这些显著的基因集合可作为犬膨大性心肌症相关的候选通路,为进一步进行犬膨大性心肌症的早期诊断,预防和个性化治疗奠定基础。
关键词
犬
膨大性心肌症
基因集富集分析
Keywords
canine
Dilated Cardiomyopathy
gene set enrichment analysis
分类号
S851 [农业科学—预防兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于基因集富集分析的犬膨大性心肌症关键基因通路筛选
刘春慧
王起山
潘玉春
《上海交通大学学报(农业科学版)》
2012
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