ATG5基因单核苷酸多态性与中国西南地区汉族人群肺结核易感性的相关性研究

目的探讨自噬相关基因-5(ATG5)单核苷酸多态性与中国西南地区汉族人群肺结核发病风险的相关性。方法2014年1月至2016年2月,纳入四川大学华西医院的900例活动性肺结核患者(肺结核组)和1534例健康对照者(健康对照组)进行研究。采用新型多重酶连接反应基因分型技术对ATG5基因上的9个单核苷酸多态性(SNP)位点(rs10484575、rs11754416、rs9486302、rs2284193、rs117827198、rs633724、rs79454666、rs77441653、rs3804338)进行基因分型。比较9个SNP位点的等位基因频率、基因型及遗传模型分布在肺结核组和健康对照组之间的差异,并采用Haploview 4.2软件进行连锁不平衡及单倍型分析。结果肺结核组与健康对照组ATG5基因rs10484575、rs11754416基因型频率差异有统计学意义(P=0.035、0.045),rs10484575携带A等位基因的个体患肺结核的风险降低(OR=0.711,95%CI:0.546~0.926,P=0.011),rs11754416携带A等位基因的个体患肺结核的风险降低(OR=0.717,95%CI:0.549~0.936,P=0.014)。遗传模型分析显示,rs10484575、rs11754416加性和显性模型与肺结核易感性降低有关。同时,rs10484575、rs11754416之间存在强连锁不平衡(r 2>96%),两种单倍型模型分布差异有统计学意义(P=0.011、0.016)。ATG5其余7个SNP位点在肺结核组和健康对照组中差异均无统计学意义(P>0.05)。结论ATG5的基因SNP rs10484575、rs11754416可能与中国西南地区汉族人群肺结核易感性有关。

自噬相关基因LC3和ATG5在胃癌中的表达及临床意义

目的探讨自噬相关基因微管相关蛋白1轻链3(microtubule-associated protein 1 light chain 3,LC3)和自噬相关基因-5(autophagy related gene-5,ATG5)在胃癌细胞发生发展不同阶段的表达情况并分析其临床意义。方法选取胃黏膜正常细胞、胃黏膜不典型增生细胞、胃癌细胞共58例,分别记为正常组(17例)、不典型组(19例)、胃癌组(22例),采用qRT-PCR、Western Blot、免疫组织化学法检测每组中自噬相关基因LC3和ATG5的mRNA及蛋白表达水平,应用SPSS 23.0软件分析正常组、不典型组、胃癌组3组间LC3和ATG5的mRNA及蛋白表达情况,并分析LC3和ATG5蛋白表达的相关性以及LC3和ATG5蛋白表达与胃癌患者临床病理学参数的关系。结果正常组、不典型组、胃癌组中LC3和ATG5 mRNA及蛋白表达水平逐渐升高,各组间差异均有统计学意义(P<0.05)。LC3蛋白表达情况与性别、年龄、浸润深度、分化程度及淋巴结状态均不存在相关性。ATG5蛋白表达情况与浸润深度、分化程度及淋巴结状态均有相关性。LC3和ATG5蛋白在3组中均呈正相关(P<0.05)。结论细胞自噬可促进胃癌的发生发展,其机制可能与LC3、ATG5过度表达有关。LC3、ATG5在促进胃癌的发生发展中起相互协同的作用。