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miR-873-5p通过靶向自噬相关基因Beclin1抑制肺癌细胞进展和抗血管生成的机制 被引量:3
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作者 王永杰 方小丽 +4 位作者 刘仕强 王杰 陈旭 汪华 何文武 《解剖学研究》 CAS 2023年第1期27-33,共7页
目的 探讨微小RNA(miRNA)-873-5p通过靶向自噬相关基因Beclin1抑制肺腺细胞进展和抗血管生成的机制研究。方法 通过双荧光素酶报告验证miR-873-5p靶向Beclin1。将人肺癌细胞系A549随机分为4组:对照组、Mimic组、Mimic+Beclin1组和Beclin... 目的 探讨微小RNA(miRNA)-873-5p通过靶向自噬相关基因Beclin1抑制肺腺细胞进展和抗血管生成的机制研究。方法 通过双荧光素酶报告验证miR-873-5p靶向Beclin1。将人肺癌细胞系A549随机分为4组:对照组、Mimic组、Mimic+Beclin1组和Beclin1组。通过质粒转染技术过表达miR-873-5p以及Beclin1。实时荧光定量PCR(q PCR)和Western blot检测RNA或蛋白的表达水平。分别通过CCK-8、克隆形成实验和流式细胞术检测细胞活力、增殖和凋亡,细胞划痕实验、Transwell实验和管生成实验检测各组的细胞迁移、侵袭和血管生成能力。结果 MiR-873-5p直接靶向Beclin1。过表达miR-873-5p抑制Beclin1 mRNA和蛋白的表达水平,过表达Beclin1显著逆转miR-873-5p对Beclin1的抑制作用。Mimic组的细胞活力和细胞增殖能力显著低于对照组,凋亡率高于对照组(P<0.05),Beclin1组的细胞活力和细胞增殖能力显著高于对照组,细胞凋亡率低于对照组(P<0.05),并且Mimic+Beclin1组的细胞活力和细胞增殖能力显著高于Mimic组,细胞凋亡率低于mimc组(P<0.05)。Mimic组的细胞迁移和侵袭能力显著低于对照组(P<0.05),Beclin1组的细胞迁移和侵袭能力显著高于对照组(P<0.05),并且Mimic+Beclin1组的细胞迁移和侵袭能力显著高于Mimic组(P<0.05);Mimic组的血管生成能力显著低于对照组(P<0.05),Beclin1组的血管生成能力显著高于对照组(P<0.05),并且Mimic+Beclin1组的血管生成能力显著高于Mimic组(P<0.05)。结论 MiR-837-5p可通过靶向抑制Beclin1的水平抑制肺癌细胞的生长、侵袭和血管生成,从而发挥抑制肺癌转移的作用。 展开更多
关键词 肺癌 非小细胞肺癌 微小RNA 自噬基因beclin1 自噬 血管生成
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自噬相关基因Beclin1和MAPLC3在急性白血病骨髓单个核细胞中的表达及其意义 被引量:7
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作者 胡晓燕 白海 +6 位作者 潘耀柱 王存邦 吴冰 赵强 艾昊 陈哲 韩夏 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2011年第3期598-601,共4页
本研究旨在检测人急性白血病(AL)骨髓单个核细胞中自噬相关基因Beclin1和微管相关蛋白质轻链3(MAPLC3)的表达,并探讨其意义。采用透射电子显微镜(TEM)和RT-PCR方法检测初治、复发难治、完全缓解(CR)的急性白血病患者和正常人骨髓单个核... 本研究旨在检测人急性白血病(AL)骨髓单个核细胞中自噬相关基因Beclin1和微管相关蛋白质轻链3(MAPLC3)的表达,并探讨其意义。采用透射电子显微镜(TEM)和RT-PCR方法检测初治、复发难治、完全缓解(CR)的急性白血病患者和正常人骨髓单个核细胞(BMMNC)中的自噬活性以及Beclin1、MAPLC3mRNA的表达。结果表明:急性白血病初治组骨髓单个核细胞自噬活性、Beclin1和MAPLC3mRNA表达分别为80%、0.68±0.18、0.24±0.06;在难治复发组分别为100%、0.79±0.09、0.30±0.07;在完全缓解组分别为40%、0.52±0.15、0.16±0.04;在正常对照组分别为20%、0.57±0.13、0.16±0.05。初治组和难治复发组自噬活性和Beclin1、MAPLC3mRNA的相对表达量均高于正常对照组,差异有统计学意义(p<0.05)。完全缓解组和正常对照组之间比较差异无统计学意义(p>0.05)。结论 :初治组急性白血病骨髓单个核细胞中自噬活性和自噬相关基因Beclin1、MAPLC3mRNA的表达均上调,在难治复发组自噬活性和自噬相关基因Beclin1、MAPLC3mRNA的表达上调尤为明显,这可能与急性白血病的发生、发展及其耐药相关。 展开更多
关键词 急性白血病 自噬相关基因 beclin1基因 MAPLC3基因 骨髓单个核细胞
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自噬相关基因Beclin1在星形细胞瘤中的表达及意义 被引量:5
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作者 黄新 白红民 +2 位作者 陈亮 李宾 卢亦成 《中国微侵袭神经外科杂志》 CAS 北大核心 2009年第12期559-562,共4页
目的探讨自噬相关基因Beclin1在星形细胞瘤中的表达,及与肿瘤病理和临床表现的相关性与意义。方法采用免疫组化和免疫印迹法检测62例不同级别的星形细胞瘤Beclin1的表达情况,并结合临床表现和病理结果进行相关性分析。结果免疫组化显示... 目的探讨自噬相关基因Beclin1在星形细胞瘤中的表达,及与肿瘤病理和临床表现的相关性与意义。方法采用免疫组化和免疫印迹法检测62例不同级别的星形细胞瘤Beclin1的表达情况,并结合临床表现和病理结果进行相关性分析。结果免疫组化显示星形细胞瘤中Beclin1蛋白表达随肿瘤级别升高而降低。免疫印迹法显示高级别(Ⅲ~Ⅳ级)星形细胞瘤Beclin1平均光密度比值低于低级别(Ⅰ~Ⅱ级)肿瘤(P=0.036)。生存期大于36个月者Beclin1平均光密度比值高于生存期小于36个月者(P=0.041)。结论Beclin1在高级别星形细胞瘤中表达下降,Beclin1检测可作为判断生存期和临床预后的辅助指标。 展开更多
关键词 星形细胞瘤 自噬 beclin1基因 生存期
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自噬相关基因Beclin1在外阴鳞癌中的表达及临床意义 被引量:4
4
作者 韩雪 宋子璇 欧阳玲 《现代肿瘤医学》 CAS 2017年第10期1604-1608,共5页
目的:探讨自噬相关基因Beclin1在外阴鳞癌中的表达及其与临床病理特征的关系。方法:采用免疫组织化学的方法检测Beclin1蛋白在50例外阴鳞癌、30例外阴上皮内瘤变及10例正常外阴组织中的表达情况,RT-PCR的方法检测25例外阴鳞癌、13例外... 目的:探讨自噬相关基因Beclin1在外阴鳞癌中的表达及其与临床病理特征的关系。方法:采用免疫组织化学的方法检测Beclin1蛋白在50例外阴鳞癌、30例外阴上皮内瘤变及10例正常外阴组织中的表达情况,RT-PCR的方法检测25例外阴鳞癌、13例外阴上皮内瘤变及10例正常外阴组织中Beclin1 mRNA的表达情况。结果:Beclin1蛋白在外阴癌、外阴上皮内瘤变、正常外阴组织中阳性率分别为52.0%、8 6.6%、9 0.0%,Beclin1蛋白在外阴癌组织中的表达明显低于外阴上皮内瘤变及正常外阴组织,具有统计学差异(P<0.05)。Beclin1 mRNA在外阴癌中的相对表达量为(0.318±0.031),显著低于外阴上皮内瘤变(0.634±0.037)及正常外阴组织(0.702±0.042)。Beclin1蛋白在外阴鳞癌中的表达与肿瘤临床分期、分化程度、有无淋巴结转移有关(P<0.05),与患者年龄无关(P>0.05)。结论:Beclin1在外阴鳞癌组织中表达下调,提示自噬活性的改变可能对外阴鳞癌的发生、发展起一定的作用。 展开更多
关键词 自噬相关基因 beclin1 外阴癌
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自噬相关基因Beclin1和LC3与子宫内膜异位症的研究进展 被引量:9
5
作者 孔志伟 姚婷婷 《医学综述》 2019年第21期4166-4173,共8页
子宫内膜异位症(EMs)是具有类似恶性肿瘤临床行为学特征的常见妇科良性病变,治疗较困难,复发率高。目前,EMs的发病机制尚不清楚,可能与机体自噬异常以及多种疾病的发生发展相关。自噬相关基因Beclin1和微管相关蛋白1轻链3(LC3)可对哺乳... 子宫内膜异位症(EMs)是具有类似恶性肿瘤临床行为学特征的常见妇科良性病变,治疗较困难,复发率高。目前,EMs的发病机制尚不清楚,可能与机体自噬异常以及多种疾病的发生发展相关。自噬相关基因Beclin1和微管相关蛋白1轻链3(LC3)可对哺乳动物细胞自噬的调节发挥重要作用,EMs中存在自噬异常,异位子宫内膜可能存在自噬活性改变或特定自噬基因的减少、缺失、变异以及蛋白质表达异常,但目前关于EMs中Beclin1和LC3表达的研究较少,且研究结果尚不统一。 展开更多
关键词 子宫内膜异位症 自噬 beclin1 微管相关蛋白1轻链3
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自噬相关基因Beclin1在鳞状细胞癌中的研究进展 被引量:1
6
作者 徐艳艳 李小静 《系统医学》 2017年第15期159-162,共4页
自噬通过降解受损蛋白质、细胞器为细胞提供循环能量,与机体多种生理和病理过程密切相关,是机体的防御和应激调控机制。自噬的调节是一个相当复杂的过程,多种调控因子参与其中。Beclin1是一种自噬相关基因,又称为BECN1,参与调控自噬的... 自噬通过降解受损蛋白质、细胞器为细胞提供循环能量,与机体多种生理和病理过程密切相关,是机体的防御和应激调控机制。自噬的调节是一个相当复杂的过程,多种调控因子参与其中。Beclin1是一种自噬相关基因,又称为BECN1,参与调控自噬的起始阶段,基因Beclin1通过调控自噬,自噬的异常活化或抑制都与鳞状细胞癌的发生、发展密切相关,鳞癌发生早期自噬抑制肿瘤增殖和迁移,鳞癌发生晚期自噬促进肿瘤发展。因此,探索Beclin1与鳞癌的作用有重要的临床意义,为寻求鳞癌早期诊断及肿瘤发展不同阶段的靶向治疗提供思路。 展开更多
关键词 自噬 自噬相关基因beclin1 鳞状细胞癌
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细胞缝隙连接蛋白43、自噬相关基因Beclin-1表达水平与甲状腺癌患者TNM分期的相关性研究 被引量:2
7
作者 杨东杰 《河南医学研究》 CAS 2018年第16期2893-2895,共3页
目的探究细胞缝隙连接蛋白43(Cx43)、自噬相关基因Beclin-1表达水平与甲状腺癌患者TNM分期的相关性。方法选取2011年5月至2017年4月许昌市人民医院术后确诊的125例甲状腺癌患者,68例甲状腺良性疾病患者,因其他原因进行手术或甲状腺活检... 目的探究细胞缝隙连接蛋白43(Cx43)、自噬相关基因Beclin-1表达水平与甲状腺癌患者TNM分期的相关性。方法选取2011年5月至2017年4月许昌市人民医院术后确诊的125例甲状腺癌患者,68例甲状腺良性疾病患者,因其他原因进行手术或甲状腺活检的42例甲状腺组织正常者,均行Cx43、Beclin-1免疫组化染色检测。比较不同甲状腺组织中Cx43、Beclin-1表达水平,并分析Cx43、Beclin-1表达水平与甲状腺癌患者TNM分期的相关性。结果甲状腺癌组织中Cx43、Beclin-1阳性表达率低于甲状腺良性病变组织、正常甲状腺组织,差异有统计学意义(P <0. 05)。甲状腺癌患者TNMⅠ+Ⅱ期Cx43阳性表达率高于Ⅲ+Ⅳ期,差异有统计学意义(P <0. 05)。Cx43与甲状腺癌患者TNM分期呈负相关(P <0. 05);自噬相关基因Beclin-1与甲状腺癌患者TNM分期无关(P> 0. 05)。结论 Cx43表达与甲状腺癌患者TNM分期呈负相关,自噬相关基因Beclin-1与甲状腺癌患者TNM分期无关。 展开更多
关键词 甲状腺癌 TNM分期 细胞缝隙连接蛋白43 自噬相关基因beclin-1
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自噬相关基因Beclin1与乳腺癌病理相关性分析
8
作者 邹华伟 陈澎涛 刘洋 《实用癌症杂志》 2021年第6期895-898,共4页
目的探讨自噬相关基因Beclin1在乳腺癌中的表达情况和与乳腺癌相关病理的相关性。方法选取120例乳腺癌患者作为研究对象,将其分为恶性组,所有患者均行手术或空心针穿刺病理证实为乳腺癌患者,取同期120例良性乳腺肿瘤患者作为良性组,另... 目的探讨自噬相关基因Beclin1在乳腺癌中的表达情况和与乳腺癌相关病理的相关性。方法选取120例乳腺癌患者作为研究对象,将其分为恶性组,所有患者均行手术或空心针穿刺病理证实为乳腺癌患者,取同期120例良性乳腺肿瘤患者作为良性组,另取同期120例健康者的乳腺组织进行分析,将其分为对照组。分析三组患者自噬相关基因Beclin1的表达情况及阳性率,120例乳腺癌患者的临床病理情况,并应用回归分析,分析自噬相关基因Beclin1与乳腺癌病理相关性。结果通过对比三组中自噬相关基因Beclin1mRNA表达水平发现,良性组和恶性组均显著低于对照组,且恶性组显著低于良性组,对比差异显著(P<0.05);通过对比三组自噬相关基因Beclin1蛋白表达阳性率发现,良性组阳性率为60.00%,恶性组患者阳性率为26.67%,对照组阳性率为91.67%,对比差异显著(P<0.05);120例乳腺癌患者中,Beclin1阳性与Beclin1阴性患者月经状态、年龄、肿瘤大小对比无明显差异(P>0.05),两组患者的临床分期、淋巴结转移、组织分化程度对比差异显著(P<0.05);Spearman相关分析显示,月经状态、年龄、肿瘤大小与自噬相关基因Beclin1不相关(P>0.05),临床分期、淋巴结转移和组织分化程度与自噬相关基因Beclin1呈负相关(P<0.05)。结论自噬相关基因Beclin1在乳腺癌患者的癌组织中表达低于良性肿瘤患者和健康人士,随着患者病情加重,自噬相关基因Beclin1表达明显降低,Beclin1与乳腺癌患者的临床分期、淋巴结转移和组织分化程度呈负相关,因此可以应用自噬相关基因Beclin1来判断乳腺癌患者病情的严重程度。 展开更多
关键词 自噬相关基因 beclin1 乳腺癌 病理
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自噬相关基因Beclin1在乳腺癌发生发展及治疗中的作用 被引量:14
9
作者 蒲倩 吴成林 周丽君 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期98-103,共6页
乳腺癌是女性最常见的、发病率位居恶性肿瘤首位的肿瘤。自噬是一种高度保守的溶酶体依赖性分解代谢途径,参与细胞的生理和病理过程,是细胞维持自稳态的重要机制之一,并对肿瘤的生物学有着复杂且重要的作用。Beclin1是第一个在哺乳动物... 乳腺癌是女性最常见的、发病率位居恶性肿瘤首位的肿瘤。自噬是一种高度保守的溶酶体依赖性分解代谢途径,参与细胞的生理和病理过程,是细胞维持自稳态的重要机制之一,并对肿瘤的生物学有着复杂且重要的作用。Beclin1是第一个在哺乳动物中发现的与自噬相关的抑癌基因,其作为自噬体形成过程中的重要分子之一,是调控细胞自噬活性的关键靶点。近年来的研究发现,Beclin1与乳腺癌的发生发展及预后密切相关。其不仅可以降低乳腺癌的发生概率,也能促进乳腺癌的进展。同时,Beclin1也参与影响乳腺癌的辅助治疗效果,既可以影响化疗药物诱导的乳腺癌细胞的凋亡,也是乳腺癌内分泌治疗耐药的主要原因之一。Beclin1与HER2之间的相互作用也影响着靶向药物的疗效。因此本文就Beclin1与乳腺癌的发生发展及其在治疗中的作用进行综述。 展开更多
关键词 自噬 beclin1基因 乳腺癌
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甲状腺癌组织自噬相关基因Beclin-1和LC3的蛋白表达及其临床病理学意义 被引量:3
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作者 王培成 李晓荣 +1 位作者 刘新义 王吉生 《新疆医科大学学报》 CAS 2018年第9期1099-1102,1106,共5页
目的探讨甲状腺癌中自噬相关基因Beclin-1和LC3的表达及意义。方法收集2013-2016年威海市市立医院甲状腺外科手术切除的甲状腺癌63例标本,以距肿瘤边缘5cm以上的组织定义为配对癌旁组织,并收集同期住院的甲状腺腺瘤(42例)和结节性甲状... 目的探讨甲状腺癌中自噬相关基因Beclin-1和LC3的表达及意义。方法收集2013-2016年威海市市立医院甲状腺外科手术切除的甲状腺癌63例标本,以距肿瘤边缘5cm以上的组织定义为配对癌旁组织,并收集同期住院的甲状腺腺瘤(42例)和结节性甲状腺肿组织标本(31例)。采用免疫组织化学SP法检测上述标本中Beclin-1和LC3的表达情况及两者之间的相关性。结果各组织Beclin-1蛋白表达差异有统计学意义(P<0.05)。甲状腺癌中Beclin-1的阳性表达率(39.68%,25/63)明显低于甲状腺腺瘤(69.05%,29/42)、结节性甲状腺肿(83.87%,26/31)和癌旁正常组织中(85.71%,54/63)的阳性表达率(P<0.05)。LC3蛋白在甲状腺癌的阳性表达率为25.40%(16/63),在甲状腺腺瘤、结节性甲状腺肿、癌旁正常组织中的阳性表达率分别为40.48%(17/42)、38.72%(12/31)、42.86%(27/63)。在甲状腺癌中LC3表达低于以上正常的3种组织。4者比较LC3的表达差异有统计学意义(P<0.05)。Beclin-1蛋白的表达与颈部淋巴结转移有关(χ~2=8.433,P=0.000)。经Spearman相关性检验分析,在甲状腺癌中LC3与Beclin-1蛋白成正相关(r=0.272,P=0.031)。结论 Beclin-1、LC3在甲状腺癌中低表达,在甲状腺癌中Beclin-1与LC3的表达量呈正相关。 展开更多
关键词 甲状腺癌 自噬相关基因 beclin-1 LC3 表达
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自噬相关基因微管相关蛋白1A/1B轻链3B在结肠癌中的表达及临床意义
11
作者 高松 吴跃锐 +1 位作者 梁明超 吴建萍 《吉林医学》 CAS 2024年第2期255-259,共5页
目的:探讨自噬相关基因微管相关蛋白1A/1B轻链3B(MAP1LC3B)在结肠癌中的表达及临床意义。方法:采用癌症基因组图谱(TCGA)数据库中提供的临床和RNA-seq数据,以预测MAP1LC3B水平与结肠癌的关系。再利用免疫组织化学染色(IHC)、Western印... 目的:探讨自噬相关基因微管相关蛋白1A/1B轻链3B(MAP1LC3B)在结肠癌中的表达及临床意义。方法:采用癌症基因组图谱(TCGA)数据库中提供的临床和RNA-seq数据,以预测MAP1LC3B水平与结肠癌的关系。再利用免疫组织化学染色(IHC)、Western印迹等技术对人群样本(结肠癌组织40例,癌旁组织20例)中MAP1LC3B表达情况进行检测,验证其表达情况与临床病理参数包括肝转移与否、淋巴结转移与否及组织分化等的关系。结果:MAP1LC3B在结肠癌组织中的表达阳性率为72.5%,明显高于癌旁组织组,差异具有统计学意义(P=0.001);在MAP1LC3B阳性组中,21例(72.41%)合并肝转移(P=0.001),且患者的TNM分期多为Ⅴ期患者,占79.31%,与MAP1LC3B阴性组比较差异具有统计学意义(P=0.001),但MAP1LC3B的表达与结肠癌组织的分化程度(P=0.056)和淋巴结转移情况比较,差异无统计学意义(P=0.265)。与TCGA数据库等分析结果有所差异,但Kaplan-Meier生存分析表明,MAP1LC3B高表达与预后不良显著相关,差异有统计学意义(P<0.01),且MAP1LC3B表达水平与CD8+T细胞的功能最为密切。结论:自噬相关基因MAP1LC3B在结肠癌组织中异常表达,并参与介导了肿瘤的恶性生物学行为,影响患者预后。 展开更多
关键词 自噬 基因 微管相关蛋白1A/1B轻链3B 结肠癌
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二黄祛脂颗粒联合水飞蓟宾胶囊对非酒精性脂肪肝患者脂肪肝指数、炎症因子及自噬相关基因水平的影响
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作者 陈平 龚晓清 +2 位作者 李晓红 尹春燕 滕佳欢 《广州中医药大学学报》 CAS 2024年第6期1422-1429,共8页
【目的】探讨二黄祛脂颗粒联合水飞蓟宾胶囊对非酒精性脂肪肝(NAFLD)患者脂肪肝指数、炎症因子及自噬相关基因水平的影响。【方法】将126例痰瘀互结型NAFLD患者随机分为对照组和观察组,每组各63例。对照组给予水飞蓟宾胶囊口服治疗,观... 【目的】探讨二黄祛脂颗粒联合水飞蓟宾胶囊对非酒精性脂肪肝(NAFLD)患者脂肪肝指数、炎症因子及自噬相关基因水平的影响。【方法】将126例痰瘀互结型NAFLD患者随机分为对照组和观察组,每组各63例。对照组给予水飞蓟宾胶囊口服治疗,观察组在对照组的基础上给予二黄祛脂颗粒口服治疗,疗程为3个月。观察2组患者治疗前后脂肪肝指数、炎症因子[白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)]、肝功能及血脂指标[丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)、γ谷氨酰转肽酶(GGT)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)]、自噬相关基因[自噬相关基因7(ATG7)、肌球蛋白样BCL2结合蛋白(Beclin 1)]水平的变化情况,并评价2组患者的临床疗效和安全性。【结果】(1)疗效方面,治疗3个月后,观察组的总有效率为90.48%(57/63),对照组为71.43%(45/63),组间比较(χ^(2)检验),观察组的疗效明显优于对照组(P<0.01)。(2)脂肪肝指数方面,治疗后,2组患者的脂肪肝指数均较治疗前明显降低(P<0.05),且观察组对脂肪肝指数的降低幅度明显优于对照组(P<0.01)。(3)炎症因子方面,治疗后,2组患者血清IL-6、TNF-α水平均较治疗前明显降低(P<0.05),且观察组对血清IL-6、TNF-α水平的降低幅度均明显优于对照组(P<0.05)。(4)肝功能方面,治疗后,2组患者血清ALT、AST、GGT水平均较治疗前明显降低(P<0.05),且观察组对血清ALT、AST、GGT水平的降低幅度均明显优于对照组(P<0.05)。(5)血脂方面,治疗后,2组患者血清TG、TC、LDL-C水平均较治疗前明显降低(P<0.05),血清HDL-C水平均较治疗前明显升高(P<0.05),且观察组对血清TG、TC、LDL-C水平的降低幅度及对血清HDL-C水平的升高幅度均明显优于对照组(P<0.05)。(6)自噬相关基因方面,治疗后,2组患者的血清ATG7、Beclin 1水平均较治疗前明显升高(P<0.05),且观察组对血清ATG7、Beclin 1水平的升高幅度均明显优于对照组(P<0.05)。(7)安全性方面,用药过程中2组患者均未见肝、肾功能损害或严重不良反应。【结论】二黄祛脂颗粒联合水飞蓟宾胶囊治疗痰瘀互结型NAFLD患者疗效确切,有助于缓解脂肪肝症状,降低炎症因子水平,改善肝功能及血脂水平,调节自噬相关基因表达。 展开更多
关键词 二黄祛脂颗粒 水飞蓟宾胶囊 非酒精性脂肪肝(NAFLD) 痰瘀互结型 脂肪肝指数 炎症因子 自噬相关基因
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WGCNA分析筛选膝骨关节炎自噬相关基因
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作者 赵连兴 杜欣瑞 +1 位作者 刘凯 王建忠 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期517-524,共8页
目的利用生物信息学分析方法筛选出膝骨关节炎中的差异性自噬相关基因,并获取其中特征性基因的miRNA及转录因子调控网络,进而阐释自噬在膝骨关节炎发病机制中的作用。方法首先,通过GEO数据库下载并整合GSE55235和GSE169077的基因表达谱... 目的利用生物信息学分析方法筛选出膝骨关节炎中的差异性自噬相关基因,并获取其中特征性基因的miRNA及转录因子调控网络,进而阐释自噬在膝骨关节炎发病机制中的作用。方法首先,通过GEO数据库下载并整合GSE55235和GSE169077的基因表达谱矩阵,随后使用R软件对整合后的基因表达矩阵分别进行差异分析、WGCNA分析。然后,将两种分析结果与从genecards数据库中获取的自噬相关基因取交集,得到差异性自噬相关基因,并对差异性自噬相关基因进行GO、KEGG、GSEA富集分析。最后,利用cytoscape中的CytoHubba插件筛选出特征性基因并在数据集GSE98918中对其进行验证。结果经筛选后共得到了111个差异性自噬相关基因,经验证集验证最终得到7个可靠的特征性基因,分别是COL1A1、MMP9、CCL5、CX3CR1、ITGB2、PTPRC、CSF1R,并获得了特征基因的miRNA的调控网络和转录因子调控网络。结论自噬在膝骨关节炎发病机制中具有重要作用,7个特征性自噬相关基因包括COL1A1、MMP9、CCL5、CX3CR1、ITGB2、PTPRC、CSF1R可作为潜在的生物标志物为诊断、治疗该疾病提供新思路。 展开更多
关键词 自噬相关基因 膝骨关节炎 生物信息学 富集分析 生物标志物
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自噬相关基因5在人恶性胸膜间皮瘤中的表达及其意义
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作者 刘如爱 王播勇 +3 位作者 李锦松 普元倩 余敏 熊伟 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第8期673-679,共7页
目的探讨自噬相关基因5(ATG5)在人恶性胸膜间皮瘤(MPM)细胞和组织中的表达情况,分析ATG5与MPM患者临床病理参数和预后的相关性。方法实时定量PCR(RT-qPCR)和Western blotting检测正常人胸膜间皮细胞和MPM细胞、非MPM胸膜间皮组织和MPM... 目的探讨自噬相关基因5(ATG5)在人恶性胸膜间皮瘤(MPM)细胞和组织中的表达情况,分析ATG5与MPM患者临床病理参数和预后的相关性。方法实时定量PCR(RT-qPCR)和Western blotting检测正常人胸膜间皮细胞和MPM细胞、非MPM胸膜间皮组织和MPM组织中ATG5的表达差异。应用TCGA数据库分析ATG5与MPM患者临床病理特征和预后的相关性。构建Cox回归模型,分析影响MPM患者预后的因素。GEPIA数据库评估ATG5与MPM肿瘤标志物和新型血清标志物的相关性。TIMER数据库分析ATG5与MPM免疫细胞浸润和关键免疫调节基因的相关性。结果ATG5在MPM细胞和组织中显著高表达,且与MPM患者的肿瘤分期呈正相关(P<0.05)。生存分析显示,ATG5高表达组MPM患者的预后更差,肿瘤病理类型可能是患者预后不良的危险因素(P<0.05)。ATG5与多种MPM肿瘤标志物(MTAP、SETD2、NF2、FIB3)和新型血清标志物(HMGB1、SMPR、THBS2、KRAS)显著相关(P<0.05)。ATG5表达与MPM中免疫细胞浸润(B细胞、CD4^(+)T细胞和巨噬细胞)和免疫相关基因(CD28、CUL48B、CD166、MMP14)呈显著正相关(P<0.05)。结论ATG5在MPM中表达上调,且与患者不良预后和免疫浸润水平相关,有望成为MPM早期筛查、诊断和预后评估的重要生物标志物。 展开更多
关键词 恶性胸膜间皮瘤 自噬相关基因5 自噬 预后 免疫浸润
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低级别胶质瘤自噬相关基因预后分类器的构建及验证
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作者 李国俊 刘妲 +4 位作者 李永事 邓仕凤 李会兵 山常国 金鑫 《临床神经外科杂志》 2024年第1期23-30,37,共9页
目的 本研究旨在构建自噬相关基因(ARGs)的风险分类器,从而预测低级别胶质瘤(LGG)患者的生存率。方法 从UCSC Xena, CGGA, GlioVis和GTEx公共数据库中获取LGG患者和正常脑组织数据,结合人类自噬数据库筛选出232个ARGs。通过差异分析得... 目的 本研究旨在构建自噬相关基因(ARGs)的风险分类器,从而预测低级别胶质瘤(LGG)患者的生存率。方法 从UCSC Xena, CGGA, GlioVis和GTEx公共数据库中获取LGG患者和正常脑组织数据,结合人类自噬数据库筛选出232个ARGs。通过差异分析得到差异ARGs。在训练集中,利用单因素Cox回归分析和LASSO回归分析,构建ARGs的预后分类器。通过绘制受试者工作特征(ROC)曲线确定最佳Cut-off值。Kaplan-Meier生存曲线和ROC曲线下面积(AUC)用于评估分类器性能,并在内部数据集和外部数据集中验证。Cox回归分析用于评估分类器的独立预后价值。最后,结合常见临床参数和风险分类用于构建列线图模型,并利用ROC曲线,一致性指数和校准曲线评估该模型的预测能力。结果 本研究构建了由6个ARGs(BAG1、 PTK6、 EEF2、 PEA15、 ITGA6和MAP1LC3C)的预后风险分类器,其可将LGG患者分为具有明显生存差异的高、低风险组在多个数据集(均P<0.05)。5年AUC值显示该分类器在训练集,内部验证集和TCGA总集中分别为0.837, 0.755,和0.803。同时,在外部验证集中,1年,2年和3年ROC曲线依然提示该分类器具有较好的预测准确性。Cox回归分析显示该预后分类器在来自TCGA的多个数据集中都具有独立预后价值(HR>1,P<0.05)。之后构建了包含多个常见临床参数和预后风险分类的列线图模型,时间依赖性ROC,一致性指数(C-index)和校准曲线分析同时证实了该模型的预后价值。结论 本研究建立了一个由6个ARGs的具有高预后价值的风险分类器,并结合临床病理特征和风险分类构建了用于临床决策的列线图,能更好地帮助临床医生判断LGG患者的预后和进行个体化治疗的临床决策。 展开更多
关键词 低级别胶质瘤 自噬相关基因 预后分类器 临床意义
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风湿性心脏病患者血清类风湿因子、自噬相关基因7水平与心功能、免疫炎症的关系
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作者 许文娟 王志为 +1 位作者 李德仲 舒品源 《心脑血管病防治》 2024年第7期22-26,共5页
目的探讨类风湿因子(RF)、自噬相关基因7(Atg7)在风湿性心脏病患者血清中的表达及与心功能、免疫炎症的相关性。方法选取2018年5月至2021年5月长江大学附属仙桃市第一人民医院收治的102例风湿性心脏病患者为观察组,并根据纽约心脏协会... 目的探讨类风湿因子(RF)、自噬相关基因7(Atg7)在风湿性心脏病患者血清中的表达及与心功能、免疫炎症的相关性。方法选取2018年5月至2021年5月长江大学附属仙桃市第一人民医院收治的102例风湿性心脏病患者为观察组,并根据纽约心脏协会心功能分级将患者分为Ⅳ级组(34例)、Ⅲ级组(36例)、Ⅱ级组(32例)。按照年龄、性别随机选择100例健康体检者为对照组。收集一般资料,检测血清RF、Atg7、免疫炎症相关指标水平并进行心脏超声检查。Pearson法分析RF、Atg7与心功能、免疫炎症指标的相关性。利用ROC曲线评价血清RF、Atg7水平对风湿性心脏病患者的诊断价值。结果观察组患者血清中RF、Atg7表达水平均高于对照组,差异有统计学意义(t=72.872、15.973,均P<0.05);心功能Ⅳ级组和Ⅲ级组患者RF、Atg7、左心室舒张末期内径(LVEDD)水平均高于Ⅱ级患者,左心室射血分数(LVEF)均低于Ⅱ级组患者,差异有统计学意义(P<0.05);心功能Ⅳ级组患者RF、Atg7、LVEDD水平高于Ⅲ级组患者,LVEF低于Ⅲ级组患者,差异有统计学意义(P<0.05);风湿性心脏病患者血清中RF与Atg7表达呈正相关(r=0.463,P<0.05);风湿性心脏病患者血清中RF、Atg7表达与超敏C反应蛋白、肿瘤坏死因子-α、白介素6、红细胞沉降率、免疫球蛋白A、免疫球蛋白G、免疫球蛋白M、LVEDD均呈正相关,与LVEF均呈负相关(P<0.05);血清RF、Atg7水平预测风湿性心脏病患者的ROC曲线下面积分别为0.856(95%CI=0.799~0.901)、0.843(95%CI=0.786~0.890),对应的敏感度分别为84.31%、86.27%,特异度分别为89.00%、83.00%。两者联合检测风湿性心脏病患者的ROC曲线下面积为0.933(95%CI=0.889~0.963),敏感度和特异度分别为87.25%、86.00%。结论RF、Atg7在风湿性心脏病患者血清中高表达,与患者心功能及免疫炎症密切相关。 展开更多
关键词 风湿性心脏病 类风湿因子 自噬相关基因7 心功能 免疫炎症
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基于TCGA数据库肺腺癌自噬相关基因预后模型的建立与验证
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作者 吴双丽 吴铁成 +3 位作者 喻光 徐敬宣 李保健 邢龙 《现代医药卫生》 2024年第10期1621-1626,共6页
目的探究肺腺癌自噬相关基因(ARGs),并构建肺腺癌ARGs的预后模型。方法肺腺癌的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库和人类自噬基因(HADb)数据库,获取ARGs,并基于肺腺癌差异表达ARGs构建肺腺癌预后模型并验证,进一步... 目的探究肺腺癌自噬相关基因(ARGs),并构建肺腺癌ARGs的预后模型。方法肺腺癌的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库和人类自噬基因(HADb)数据库,获取ARGs,并基于肺腺癌差异表达ARGs构建肺腺癌预后模型并验证,进一步构建列线图及校准曲线探究模型在临床中的应用价值。对差异表达ARGs进行基因本体和京都基因与基因组百科全书富集分析。对获得的具有预后意义的差异表达ARGs进行Lasso回归分析并构建肺腺癌预后模型。绘制Kaplan-Meier生存曲线。结果共获得31个差异表达ARGs,筛选得到10个具有预后意义的差异表达ARGs。高风险组患者与较差的总生存期明显相关,差异有统计学意义(P<0.05)。T分期、N分期、风险评分为肺腺癌患者的独立预后因素。校准曲线和列线图全局一致性为0.710,说明模型预测结果与实际情况具有较高的符合度。结论基于差异表达ARGs构建的风险模型可作为肺腺癌患者的一种预后特征或可为肺腺癌患者的个体化治疗提供参考依据。 展开更多
关键词 肺腺癌 自噬相关基因 预后模型 癌症基因组图谱数据库 计算生物学
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放疗与吉西他滨治疗对肺癌A549细胞自噬相关基因Beclin1表达的影响
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作者 吴晓翠 樊红琨 +2 位作者 乔鹏 潘小丽 王文玉 《现代生物医学进展》 CAS 2015年第34期6642-6644,6648,共4页
目的:探讨放疗与吉西他滨(Gemcitabine,GEM)治疗对人肺腺癌A549细胞中自噬相关基因Beclin1表达的影响。方法:使用60Coγ照射(6Gy)人肺腺癌A549细胞,细胞继续培养6、12和24h。使用人剂量吉西他滨处理人肺腺癌A549细胞,细胞继续培养24 h后... 目的:探讨放疗与吉西他滨(Gemcitabine,GEM)治疗对人肺腺癌A549细胞中自噬相关基因Beclin1表达的影响。方法:使用60Coγ照射(6Gy)人肺腺癌A549细胞,细胞继续培养6、12和24h。使用人剂量吉西他滨处理人肺腺癌A549细胞,细胞继续培养24 h后,以未处理的A549细胞为对照,用RT-PCR和Western blotting法检测A549细胞中Beclin1 m RNA和蛋白的表达。结果:经过放射线照射后,三组A549细胞内Beclin1 m RNA和蛋白的表达量均增加,且在24小时末表达量达到最大。经过吉西他滨处理后,吉西他滨处理组A549细胞内Beclin1 m RNA和蛋白的表达量均增加。结论:放射治疗与吉西他滨治疗均可导致A549细胞内自噬相关基因Beclin1表达上调。 展开更多
关键词 自噬相关基因beclin1 肺癌A549细胞 放射治疗 吉西他滨
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自噬相关基因Beclin1和MAPLC3在乳头状甲状腺癌的表达及意义 被引量:17
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作者 卢秀波 杨建辉 +2 位作者 刘洋 刘征 王晓明 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1628-1630,共3页
目的检测人甲状腺乳头状癌标本中自噬相关基因Beclin1和微管相关蛋白轻链3(MAPLC3)的表达,并探讨其意义。方法采用Westernblot方法检测甲状腺乳头状癌(PTC)组织和甲状腺良性疾病组织中以及正常甲状腺组织中Beclin1和MAPLC3蛋白的... 目的检测人甲状腺乳头状癌标本中自噬相关基因Beclin1和微管相关蛋白轻链3(MAPLC3)的表达,并探讨其意义。方法采用Westernblot方法检测甲状腺乳头状癌(PTC)组织和甲状腺良性疾病组织中以及正常甲状腺组织中Beclin1和MAPLC3蛋白的表达。结果Westernblot检测Beclin1在甲状腺乳头状癌的相对表达量为3.05±0.43,与甲状腺良性疾病组织(5.48±0.63)和正常甲状腺组织(5.93±0.88)中的相对表达量比较差异有统计学意义(F=205.30,P〈0.05);MAPLC3在甲状腺乳头状癌的相对表达量为2.17±0.37,与甲状腺良性疾病组织(3.18±0.49)和正常甲状腺组织(3.55±0.53)中的相对表达量比较差异有统计学意义(F=91.53,P〈0.05)。结论Beclin1和MAPLC3蛋白在甲状腺乳手状癌中的表达明显低于甲状腺良性疾病组织以及正常甲状腺组织,表达的差异有统计学意义。自噬相关基因在甲状腺癌组织中的表达下降,可能与甲状腺癌的发生、发展相关。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 自噬相关基因 beclin1基因 MAPLC3基因
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自噬相关基因LC3和Beclin1在大鼠急性坏死性胰腺炎中的表达和意义 被引量:6
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作者 杨淑丽 陈卫昌 +1 位作者 孙楹 陈冯梅 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2011年第12期1231-1236,共6页
目的:研究大鼠急性坏死性胰腺炎(ANP)胰腺组织LC3、Beclin1的表达,并探讨其在ANP中的作用及意义.方法:36只SD大鼠随机分为假手术(SO)组和ANP组,ANP组采用胰胆管逆行注射5%牛磺胆酸钠诱导制作大鼠ANP模型,SO组开腹后翻动胰腺后关腹,各组... 目的:研究大鼠急性坏死性胰腺炎(ANP)胰腺组织LC3、Beclin1的表达,并探讨其在ANP中的作用及意义.方法:36只SD大鼠随机分为假手术(SO)组和ANP组,ANP组采用胰胆管逆行注射5%牛磺胆酸钠诱导制作大鼠ANP模型,SO组开腹后翻动胰腺后关腹,各组再分3、6和12h3个不同时间点.观察各组大鼠血清炎症因子及胰腺的病理改变,运用免疫组织化学法检测各组大鼠在不同时间点胰腺组织LC3和Beclin1的变化.结果:ANP组血浆淀粉酶(U/L)、TNF-α(μg/L)较SO组明显增加(血浆淀粉酶:3h:4936±1207vs1447±355;6h:5464±768vs1513±333;12h:6139±710vs1539±231;TNF-α:3h:111.24±21.86vs56.14±7.69;6h:107.55±33.05vs57.13±11.30;12h:108.24±24.83vs58.60±9.54,均P<0.05),且ANP组大鼠胰腺病理改变随着时间延长加重.正常大鼠胰腺腺泡细胞LC3、Beclin1低表达,大鼠ANP3h后胰腺细胞LC3、Beclin1表达开始增多,在6和12h呈强表达.结论:大鼠ANP后胰腺组织Beclin1和LC3增多,表明ANP后胰腺自噬活性增强,其表达与炎症变化程度相关,细胞自噬增强是可能对损伤的反应. 展开更多
关键词 自噬 急性坏死性胰腺炎 微管相关蛋白1轻链3 beclin1
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