银杏叶绿体基因组密码子使用偏性分析

利用CodonW等软件,对银杏叶绿体基因组57个基因密码子的使用偏性及其影响因素进行研究。对银杏叶绿体基因组的ENC值、中性绘图、ENC-plot绘图、最优密码子、奇偶偏差、对应性分析的结果表明:影响银杏叶绿体基因组密码子使用偏性的因素,以自然选择压力为主,自身基因变异和碱基组成等也有一定影响。依据ENC值建立高低表达基因库,最终确定UUU、UUG、CUU、GUU、UCA、CCA、ACA、UAU、AAU、CGA、AGA等11个银杏叶绿体基因组的最优密码子。