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四照花亚属的nrDNA ITS致同进化不完全
被引量:
4
1
作者
胡兆锋
向秋云
黄宏文
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期29-37,共9页
四照花亚属(Cornus subg. Syncarpea)隶属于山茱萸科山茱萸属(Cornus),我国该亚属共有5种8亚种。为探讨四照花亚属nrDNA ITS序列的致同进化不完全现象及假基因产生的可能原因,分析了该亚属4种(每种1~2个居群)共21个个体的nrDNA ...
四照花亚属(Cornus subg. Syncarpea)隶属于山茱萸科山茱萸属(Cornus),我国该亚属共有5种8亚种。为探讨四照花亚属nrDNA ITS序列的致同进化不完全现象及假基因产生的可能原因,分析了该亚属4种(每种1~2个居群)共21个个体的nrDNA ITS序列。结果表明,这些类群的nrDNA ITS存在多态性,通过分析这些nrDNA ITS克隆序列的G+C含量、5.8S保守基序和二级结构最小自由能,推测其可能存在假基因。系统发育研究结果显示所有nrDNA ITS序列分成5个分支,同一个体的不同拷贝被分别置于两个甚至多个分支中,且不同分支显示了不同种间关系。四照花亚属物种个体内部存在nrDNA ITS不完全致同进化,可能归咎于不完全的世系分选(incomplete lineage sorting)、种间杂交或多倍化等进化事件,从而导致基因组内nrITS区序列出现多态性,同时也导致难以通过外部形态来划分亚属内种间界限。
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关键词
四照花亚属
NRDNA
ITS
致同进化不完全进化
假基因
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题名
四照花亚属的nrDNA ITS致同进化不完全
被引量:
4
1
作者
胡兆锋
向秋云
黄宏文
机构
中国科学院华南植物园
北卡罗来纳州立大学植物生物学系
出处
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期29-37,共9页
基金
中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-YW-Z-1024)资助
文摘
四照花亚属(Cornus subg. Syncarpea)隶属于山茱萸科山茱萸属(Cornus),我国该亚属共有5种8亚种。为探讨四照花亚属nrDNA ITS序列的致同进化不完全现象及假基因产生的可能原因,分析了该亚属4种(每种1~2个居群)共21个个体的nrDNA ITS序列。结果表明,这些类群的nrDNA ITS存在多态性,通过分析这些nrDNA ITS克隆序列的G+C含量、5.8S保守基序和二级结构最小自由能,推测其可能存在假基因。系统发育研究结果显示所有nrDNA ITS序列分成5个分支,同一个体的不同拷贝被分别置于两个甚至多个分支中,且不同分支显示了不同种间关系。四照花亚属物种个体内部存在nrDNA ITS不完全致同进化,可能归咎于不完全的世系分选(incomplete lineage sorting)、种间杂交或多倍化等进化事件,从而导致基因组内nrITS区序列出现多态性,同时也导致难以通过外部形态来划分亚属内种间界限。
关键词
四照花亚属
NRDNA
ITS
致同进化不完全进化
假基因
Keywords
Cornus subg. Syncarpea nrDNA ITS Incomplete concerted evolution Pseudogenes
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
四照花亚属的nrDNA ITS致同进化不完全
胡兆锋
向秋云
黄宏文
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
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