2021年北京市哨点医院致泻大肠埃希氏菌感染病例特征分析

目的 通过分析2021年北京市哨点医院致泻大肠埃希氏菌(Diarrheagenic Escherichia coli,DEC)感染病例的流行趋势和临床特征,为制定有效的健康教育与疾病防控提供依据。方法 收集2021年北京市36家食源性疾病主动监测医院腹泻病例的粪便或肛拭子标本及其性别、年龄、住址、发病时间、饮食史、临床特征等信息,对采集的粪便或肛拭子标本中的DEC进行分离培养鉴定。采用χ^(2)或Fisher确切概率法检验比较DEC不同分型的阳性检出率。结果 2021年北京市食源性疾病监测共采集腹泻病例粪便或肛拭子标本5697份,DEC阳性检出率为7.65%(436/5697),其中20~39岁年龄组阳性检出率最高(χ^(2)=18.804,P<0.001)。从年龄分布来看,20~39岁年龄组肠产毒性大肠埃希菌(Enterotoxigenic Escherichia coli,ETEC)阳性病例数高于其他年龄组(χ^(2)=36.769,P<0.001),从地区分布来看,感染肠聚集性大肠埃希菌(Enteroaggregative Escherichia coli,EAEC)和肠致病性大肠埃希菌(Enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)的病例多来自远郊(χ^(2)=50.679,χ^(2)=19.659,P均<0.001),感染ETEC的病例主要分布在城区(χ^(2)=13.420,P=0.001)。从季节分布来看,EAEC、ETEC和EPEC夏季感染均高于其他季节(χ^(2)=32.096,χ^(2)=89.339,χ^(2)=16.876,P均<0.001),肠出血性大肠埃希菌(Enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)感染主要发生在春季(χ^(2)=10.976,P<0.001)。自述可疑饮食史信息方面,感染ETEC的病例多食用过酒类及冷冻食品(χ^(2)=41.837,P<0.001),EAEC感染者多食用过婴儿食品(χ^(2)=24.229,P=0.007)。临床特征方面,出现腹痛的病例ETEC检出率更高(χ^(2)=8.017,P=0.005),出现恶心或呕吐的病例中EAEC的检出率更高(χ^(2)=5.701,P=0.017;χ^(2)=4.160,P=0.041)。结论 北京市哨点医院致泻大肠埃希氏菌感染病例具有季节性及人群流行特征,可结合不同分型DEC感染病例的可疑食品暴露信息及临床特征,为食品安全健康宣教和临床诊断提供依据。

河南省人源和食源多重耐药致泻大肠埃希氏菌耐药特征与基因组分析

目的了解河南省临床和食品来源中多重耐药的致泻大肠埃希氏菌的耐药性和基因组特征.方法对2017-2022年河南省分离的101株多重耐药致泻大肠埃希氏菌,通过微量肉汤稀释法进行抗生素敏感性实验.基于全基因组测序结果分析其耐药基因、多位点序列分型、质粒类型并基于核心基因组单核苷酸多态性位点(cgSNPs)构建系统发育树.结果101株多重耐药的致泻大肠埃希氏菌对氨苄西林、四环素、萘啶酸的耐药率最高,分别为87.1%、79.2%、64.4%;对头孢噻肟的耐药率为38.6%.全基因组测序数据表明:101株分离株可被分为60种ST型,其中ST10、ST1491、ST38是优势型别;101株分离株共预测出23种质粒类型,其中携带率最高的类型为IncFIB.分离株携带喹诺酮类、氨基糖苷类、βG内酰胺酶类、四环素类等多种耐药基因,其中超广谱βG内酰胺酶基因bla_(CTX-M-14)和bla_(CTX-M-55)上下游遗传环境中均存在插入序列(IS26、IS903B、ISECP1).结论河南省人源和食源多重耐药的致泻大肠埃希氏菌具有较高的遗传多样性,整体耐药水平较高,其bla_(CTX-M)基因的传播可能与插入序列(IS)有关.

汉中地区仔猪腹泻性大肠埃希氏菌的分离鉴定及生物学特性研究

为分析汉中地区仔猪腹泻性大肠埃希氏菌的血清型及耐药性等情况,2021-2022年采集汉中地区腹泻仔猪肛拭子及粪便样本72份,分离培养后经生化试验、16S rRNA PCR鉴定、O血清型鉴定及药物敏感性试验。结果显示,分离到58株大肠埃希氏菌;58株大肠埃希氏菌包含12种血清型,其中主要的流行血清型为O80、O138、O141;58株大肠埃希氏菌对氨苄西林、红霉素、氯霉素、克林霉素、四环素、环丙沙星、头孢噻吩、头孢曲松、阿米卡星9种药物的耐药率在50%以上。研究结果可为汉中地区有效防治仔猪大肠埃希氏菌病提供科学依据。

实时荧光环介导等温扩增快速分型致泻大肠埃希氏菌方法的建立

致泻大肠埃希氏菌(diarrheagenic Escherichia coli,DEC)是一种重要的食源性致病菌,该研究立足DEC目前流行率高、基层分型困难的现状,建立了快速分型5种DEC的实时荧光环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法。针对DEC的8段特征性毒力基因pic、aggR、lt、st、stx 1、stx2、escV、invE及大肠埃希氏菌属特异性基因uidA设计LAMP引物,优化反应体系,并对方法的分析性能及临床菌株分型效果进行了评价。结果显示,所建立的方法对pic和escV的检出限是1 ng/μL,对aggR、stx 1、invE和uidA的检出限是100 pg/μL,对lt、st和stx 2的检出限是10 pg/μL,该方法灵敏度与特异度均为100%,DEC型别间无交叉反应,对临床菌株的分型与实际结果完全一致。方法快速简便、设备要求低,借助恒温荧光读取设备可在40 min内迅速判定待检菌株是否为DEC及其致病类型,可满足各机构现场快速检测的需求。

青海牧区犊牛腹泻大肠埃希氏菌毒力基因及血清型分布特征研究

为掌握青海牧区致牦牛腹泻大肠埃希氏菌病的流行特征,以期为牦牛大肠埃希氏菌性腹泻的预防和治疗提供依据,对青海省玉树、果洛、海北地区采集的99份犊牦牛腹泻相关样本进行致病性大肠埃希氏菌的分离培养及O抗原血清分型、毒力基因扩增及小鼠毒性试验等研究。结果显示,分离菌株主要携带F17、ompA、fimC、espA、HPI、LEE、VT1、SLT2等毒力基因,未检出K88、K99、LT1等毒力基因,小鼠最低致死剂量为2.5×10^(9)CFU/mL,优势血清型为O25、O55和O107,分别占定型血清的25.40%、14.29%和19.05%,系统主要发育群为B1群。研究结果将为后续青海地区致犊牦牛腹泻大肠杆菌病的治疗、发病机制探讨及疫苗研制提供支撑。

汉中地区某猪场仔猪腹泻性大肠埃希氏菌的分离鉴定及耐药性检测

为明确汉中某猪场仔猪腹泻的病原菌及其耐药情况,试验无菌采集腹泻仔猪病料,分离培养后经生化试验、16S rRNA PCR鉴定、药物敏感性试验以及小鼠致病性试验等研究进行探索。试验结果显示该分离株在各培养基上的菌落特征、革兰氏染色镜检结果及生化特性与大肠埃希氏菌相吻合;分离菌株16S rRNA序列与GenBank中登录的大肠埃希氏菌同源性达99%以上;分离菌株对氨苄西林、多黏菌素B、氯霉素、头孢曲松、头孢噻吩、头孢唑林等耐受,对头孢他啶、米诺环素、阿米卡星3种药物敏感,同时对多种抗生素产生耐药性;在小鼠致病性试验中发现48 h内试验组小鼠全部死亡且对照组无死亡,并从死亡小鼠组织中得到该菌株,说明分离菌有较强的致病力。结果表明,本试验所分离的病原菌为多重耐药致病性大肠埃希氏菌。本研究结果可为该猪场仔猪腹泻性大肠埃希氏菌病的临床防治提供科学依据。

腹泻犬粪源大肠埃希氏菌的分离鉴定及其耐药特性与毒力基因的检测

为检测蚌埠地区腹泻犬肠道大肠埃希氏菌的耐药特性和毒力基因携带情况,采集75份腹泻犬粪便样本进行大肠埃希氏菌的分离鉴定,采用Kirby-Bauer(K-B)纸片扩散法对12种抗菌药物的耐药性进行检测,通过PCR对6种耐药基因及6种毒力基因进行检测。结果共分离得到62(82.7%,62/75)株大肠埃希氏菌,分离菌株对恩诺沙星耐药率为46.8%,对氨基糖苷类耐药率为9.7%~16.1%,其中丁胺卡那霉素为16.1%;头孢菌素类为6.5%~12.9%,其中头孢他啶为12.9%;喹诺酮类耐药基因qnr检出率为51.6%,头孢菌素类耐药基因blaCMY-2为9.7%;毒力基因mdh、fimC、ompA的检出率分别为100%、64.5%和74.2%。结果表明所分离大肠埃希氏菌对不同抗菌药物的耐药差异较大,耐药基因的分布与耐药表型有较高的相关性,mdh、fimC和ompA为主要携带毒力基因。临床上应加强对细菌抗菌药物耐受和毒力变化的监测,以提高治疗效果,减少耐药菌株出现。

河北省部分地区腹泻犊牛源大肠埃希氏菌毒力基因检测与耐药性分析

为明确河北省部分地区大肠埃希氏菌携带的毒力因子情况及对药物的敏感度,更好地控制由致病性大肠埃希氏菌导致的犊牛腹泻,从河北省部分地区(廊坊、定州、石家庄、保定、衡水、邢台)的牛场采集了128份腹泻犊牛粪样,从中分离大肠埃希氏菌,利用PCR对分离的大肠埃希氏菌进行毒力因子和耐药基因的检测,并采用K-B纸片法对分离菌株进行12种抗菌药物的药物敏感性试验。结果显示,从128份腹泻犊牛粪便中分离到菌株125株,其中104株为大肠埃希氏菌。104株分离菌中61株携带毒力基因,毒力基因携带率为58.70%(61/104),毒力基因F17、Stx1、irp2、FyuA、STa、Stx2阳性率分别为17.31%、0.08%、24.04%、35.58%、10.58%、0.04%,未检测出K99、F41、LT和eaeA基因,部分大肠埃希氏菌携带多重毒力因子。16种耐药基因的检测显示aph(3'')-Ib、tetC、sul3、qnrA、qnrC、tetB、aac(6′)-Ⅰb、tetA、bla TEM、bla CTX-M、sul1、sul2、oqxA、oqxB、qnrS、qnrB阳性率分别为59.62%、26.0%、28.85%、0.05%、32.69%、29.81%、46.15%、48.08%、82.69%、78.85%、55.77%、74.04%、25.00%、30.77%、43.27%、0.07%。药物敏感性试验结果显示,104株分离菌耐2种以上抗菌药物的菌株达86.62%,对卡那霉素、恩诺沙星和环丙沙星敏感率较高,研究结果可为河北省部分地区大肠埃希氏菌性犊牛腹泻的防治提供理论依据。

大肠埃希氏菌疫苗生产用菌种种子批的建立与鉴定

为了研制仔猪大肠杆菌病三价(K88+K99+987P)灭活疫苗,以大肠埃希氏菌生产菌种C83549(k88)第2代和C83644(k99)、C83710(987p)第3代基础种子作为原始种子,建立了用于仔猪大肠杆菌病疫苗生产的大肠埃希氏菌基础种子批,分别对种子批的F1、F5、F10、F13代进行了全面鉴定。结果表明,各代种子的培养特性、生化特性均符合大肠埃希氏菌特征,抗原结构分别为C83549(O149∶K88)、C83644(O68∶K99)和C83710(O9∶987P);各代次菌株的菌毛抗原RIHA单位≥800,菌种免疫原性鉴定合格;各菌株经口服途径灌服1.5×10^(10)CFU/头,可引起仔猪100%发病。因此,3个菌株均可用作仔猪大肠杆菌病三价(K88+K99+987P)灭活疫苗生产的菌种。

北京某医院感染性腹泻患者致泻性大肠埃希菌毒力和耐药特征分析

目的明确本院感染性腹泻患者致泻性大肠埃希菌毒力和耐药特征。方法采用VITEK MS微生物质谱检测系统初步鉴定,多重实时荧光PCR检测毒力基因,对本院感染性腹泻患者临床分离的致泻性大肠埃希菌(Diarrheagenic Escherichia coli,DEC)进行5种型别鉴定。微量肉汤稀释法和E-test法药敏试验检测DEC菌株的耐药表型特征。二代测序及生物信息学分析其耐药分子特征。采用Fisher确切概率法进行统计学分析。结果本院DEC检出率为11.9%,其中EAEC占比37.5%,非典型EPEC占比34.38%,ETEC占比25.0%,EIEC占比3.12%,未检出EHEC菌株。32株DEC对氨苄西林、四环素、甲氨苄啶/磺胺异恶唑耐药率最高,分别为53.12%、43.75%和37.5%。ESBLs(+)株占比18.75%,其多重耐药菌株检出率为83.83%,显著高于ESBLs(-)菌株,差异有统计学意义(P=0.042)。32株DEC共有25个ST型,优势基因型为ST10共4株(12.5%),ST28、ST31和ST3153各2株(各占比6.25%),其他21个型别各1株菌(各占比3.13%)。EAEC中检出1株携带bla_(NDM-1)的耐碳青霉烯类菌株。结论我院感染性腹泻患者的DEC以aggR、pic、astA、eae 4种毒力基因较为常见,以EAEC、EPEC为主要型别,基因型别呈高度多态性,检出多重耐药菌株。

基于CRISPR序列的致泻性大肠埃希菌跨种传播风险机器学习模型构建

【目的】基于CRISPR序列信息应用机器学习模型预测致泻性大肠埃希菌感染人的潜在风险,并以此识别具有人兽共患风险的高危菌株。【方法】从Enterobase数据库批量获取806株中国分离的致泻性大肠埃希菌基因组序列信息,提取CRISPR位点的间隔序列构造特征,建立机器学习模型并使用交叉验证评价机器学习模型的预测效果。使用最佳模型输出致泻性大肠埃希菌的感染风险,并比较不同动物来源分离株对人的潜在感染风险。【结果】从806株菌株中共获取1093个间隔序列簇,人源分离株独有间隔序列簇为196个,动物源分离株独有间隔序列簇为291个,其中606个二者共享,线性判别分析发现人源和动物源菌株的间隔序列簇分布存在明显差异。以间隔序列簇作为特征,成功构建随机森林模型、逻辑斯谛回归模型、支持向量机模型和梯度提升树模型4种机器学习模型,其宿主预测准确率均超过0.82,受试者工作特征曲线下面积(area under receiver operating characteristic curve,AUC)值均接近0.9。最终确定随机森林模型的分类效果最佳,优化后模型预测准确率为0.844,AUC值为0.915。根据最佳模型输出的致泻性大肠埃希菌的感染风险,猪源分离株感染人的风险最高,羊源分离株感染人的风险较低,极少数禽源分离株可能具备感染人的潜力。【结论】基于间隔序列构建的机器学习模型对具有人兽共患风险的致泻性大肠埃希菌具备一定的识别能力,该模型为传染性疾病防控提供了新思路。

大肠埃希氏菌表达系统在猪亚单位疫苗中的应用

大肠埃希氏菌表达系统是目前应用最广、研究最为透彻的外源蛋白表达系统,具有遗传背景清楚、易培养和控制、转化操作简单、表达水平高、成本低、周期短等优点深受疫苗研究者的青睐,但也存在易形成包涵体和无法对蛋白修饰等问题需要对其进行优化。生猪作为我国最重要的经济动物,其疫病安全防控对养猪业和我国人民的健康可持续发展有重要意义。论文对近年来大肠埃希氏菌表达系统在猪病毒性亚单位疫苗中的研究进展进行概述,为促进大肠埃希氏菌表达系统改进及其亚单位疫苗后续应用提供参考。

奶牛乳房炎大肠埃希氏菌和肺炎克雷伯菌及奇异变形杆菌三重TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立

为建立检测奶牛乳房炎主要革兰氏阴性致病菌的快速诊断方法,选择大肠埃希氏菌phoa基因,肺炎克雷伯菌rcsa基因以及奇异变形杆菌urer基因设计合成特异性引物与探针,建立了奶牛乳房炎大肠埃希氏菌和肺炎克雷伯菌及奇异变形杆菌三重Taq Man荧光定量PCR检测方法。该方法可在120 min内通过一管反应体系特异性鉴定出3种常见的奶牛乳房炎革兰氏阴性致病菌,最低检测限可达1×10^(1)copies/μL且特异性和重复性良好,以此方法对80份奶牛乳房炎生乳样进行检测,大肠埃希氏菌检出率为35%(28/80),肺炎克雷伯菌检出率为21.2%(17/80),奇异变形杆菌检出率为11.2%(9/80)。结果表明,所建立的奶牛乳房炎大肠埃希氏菌和肺炎克雷伯菌及奇异变形杆菌三重Taq Man荧光定量PCR检测方法具有操作简单、特异性强、灵敏度高的特点,适用于奶牛乳房炎的临床诊断,对革兰氏阴性致病菌的快速检测及合理用药具有指导意义。

榆林市绒山羊源大肠埃希氏菌耐药基因分子流行病学调查

为了解榆林市绒山羊大肠埃希氏菌对抗菌药物的耐药性以及耐药基因的携带情况,采集榆林地区羔羊、育成羊、经产母羊与种公羊粪便样品各72份,通过药敏试验检测其耐药表型,PCR扩增检测其耐药基因携带情况。试验共分离到288株大肠埃希氏菌,药敏试验结果表明,榆林市羊源大肠埃希氏菌对检测的16种抗菌药物均有不同程度的耐药性,耐药率较高的为林可霉素100%(288/288)、青霉素97.57%(281/288)、克林霉素96.88%(279/288)、红霉素93.06%(268/288),其中96.88%(276/288)为多重耐药,以3~4重耐药为主。耐药基因检出率较高的为gyrA、TEM、gyrB、CTX-M 9、TEM-1,分别占99.31%(286/288)、97.57%(281/288)、94.44%(272/288)、88.19%(254/288)、81.60%(235/288)。经统计学分析,耐药基因检出数在羔羊、育成羊、经产母羊与种公羊之间无显著差异。分离的288株大肠埃希氏菌抗菌药物耐药普遍,耐药基因分布广泛。试验结果为榆林市绒山羊抗菌药物的科学使用提供了基础数据,同时也为榆林市公共卫生安全提供了理论支撑。

2017年江苏省食源性疾病中致泻大肠埃希氏菌的感染状况及耐药性分析

目的:了解江苏省食源性疾病病例中致泻大肠埃希氏菌的感染、耐药及病原学特征,为疾病防控及临床治疗提供依据。方法:收集2017年江苏省48家食源性疾病哨点医院腹泻患者粪便或肛拭子标本,采用传统分离培养结合荧光定量PCR方法,检测5种致泻大肠埃希氏菌并进行分型鉴定,对其感染状况进行流行病学分析;采用微量肉汤稀释法测定266株致泻大肠埃希氏菌对8类14种抗菌药物的耐药性。结果:在9 884份粪便或肛拭子样本中,检出289份致泻大肠埃希氏菌(2.92%),5种病原型别中检出率最高为肠黏附性大肠埃希氏菌(EAEC,1.53%),其次为肠产肠毒素大肠埃希氏菌(ETEC,0.81%)和肠致病性大肠埃希氏菌(EPEC,0.54%),有2株菌为双重菌合并感染;致泻大肠埃希氏菌夏秋季节检出较高,其中8月份检出率最高;男性、女性检出率分别为2.78%和3.08%,差异无统计学意义(χ2=0.801,P>0.05);在年龄分布上,<1岁组检出最高(4.55%),1～5岁组其次(4.06%),不同年龄组检出率有统计学意义(χ2=45.780,P<0.01);致泻大肠埃希氏菌呈现较高的耐药率(91.35%),耐药率最高的抗菌药物是氨苄西林(64.3%),其次是萘啶酸(60.9%)和四环素(51.9%);多重耐药率达到60.9%,其中1株菌耐受14种抗菌药物。结论:江苏省食源性致泻性大肠埃希菌中EAEC感染率最高,多重耐药情况较为严重,<5岁的婴幼儿需要重点关注。

阿米卡星诱导对大肠埃希氏菌耐药性及生物被膜和外排泵活性的影响

为研究亚抑菌浓度阿米卡星诱导对大肠埃希氏菌敏感菌株耐药性、生物被膜形成能力及外排泵活性的影响,采用微量肉汤稀释法测定阿米卡星对6株菌株的最小抑菌浓度(MIC),并以0.5 MIC作为初始诱导浓度进行诱导,每隔5 d重新测定阿米卡星MIC,并调整诱导浓度,共计30 d,最后将诱导第30天菌株进行无药物压力稳定培养5 d,保存各诱导菌株及无药传代菌株共计210株,测定各诱导菌株药物敏感性、生物被膜形成能力及部分菌株外排泵活性变化。结果发现,随着诱导天数的增加,阿米卡星对6株分离菌株MIC逐渐升高,诱导菌株耐药性不断增强,其对诱导第30天菌株的MIC值为诱导前的8~32倍;经过5 d无药培养后,MIC测定结果与第30天基本保持一致;诱导后的菌株中,强成膜能力菌株占总数的5%,中成膜能力菌株为56.7%;以每5 d的生物被膜形成量平均值与原菌相比,结果发现,所有诱导菌株生物被膜形成量均显著增加(P<0.01),表明亚抑菌浓度阿米卡星诱导可促进大肠埃希氏菌生物被膜的形成;无药稳定培养5 d的菌株与诱导第30天菌株相比,生物被膜形成能力基本保持不变。荧光探针测定外排泵结果显示,诱导菌株外排泵活性显著受到抑制。以上研究结果表明,阿米卡星诱导促进菌株生物被膜的形成,抑制外排泵活性,使菌株的耐药性增强,研究结果可为氨基糖苷类药物用药提供理论依据。

大肠埃希氏菌诱导小鼠乳腺纤维化模型中瘦素及其受体、MMPs和TIMPs表达的研究

为探究Leptin、Ob-R、MMP-2、MMP-9、TIMP-1和TIMP-2对小鼠乳腺组织纤维化的作用,用奶牛乳腺炎大肠埃希氏菌感染小鼠乳腺后,分别于感染后1、3、7、14、21 d采集小鼠乳腺组织,应用免疫组化染色检测Leptin、Ob-R、MMP-2、MMP-9、TIMP-1和TIMP-2在小鼠乳腺组织细胞中的表达与分布,应用qPCR、Western blot方法检测小鼠乳腺组织中Leptin、Ob-R、MMP-2、MMP-9、TIMP-1和TIMP-2 mRNA转录水平和蛋白表达水平。结果显示,小鼠感染E.coli前期(1~7 d),Leptin、Ob-R、MMP-2、MMP-9、TIMP-1和TIMP-2主要在上皮细胞,炎性细胞中表达,感染后期(14~21 d)主要在上皮细胞、成纤维细胞和炎性细胞中表达。qPCR检测mRNA转录水平,E.coli感染1~14 d,Leptin、Ob-R、MMP-2和MMP-9的转录水平均显著上升,TIMP-2的mRNA转录水平极显著下降,感染后期(14~21 d)Leptin、Ob-R、MMP-2、TIMP-1和TIMP-2的mRNA转录水平与空白组相比无显著性差异,MMP-9mRNA转录水平极显著上升。Western blot检测蛋白表达水平,E.coli感染后1~14 d,Leptin、MMP-2、TIMP-1整体蛋白表达水平上升,TIMP-2蛋白表达水平下降,Ob-R在感染后7~14 d显著上升,MMP-9在3 d和14 d显著上升,感染后14~21 d,Ob-R、MMP-2、MMP-9呈上升趋势,Leptin呈下降趋势,TIMP-1、TIMP-2与对照组的蛋白表达水平基本持平。研究表明,通过E.coli建立的小鼠乳腺纤维化模型,能够刺激Leptin、Ob-R、MMP-2、MMP-9和TIMP-1表达,抑制TIMP-2表达。初步探究了乳腺纤维化与Leptin及其受体、MMPs和TIMPs的关系,为进一步探索纤维化的分子作用机理奠定了基础。

产志贺毒素大肠埃希氏菌活菌检测方法的应用现状及展望

产志贺毒素大肠埃希氏菌作为一种重要的食源性致病菌,会对人体健康造成严重威胁。对其进行快速、准确的鉴定检测是预防和控制相关疾病的有效手段。基于此,文章对目前可用于检测活体产志贺毒素大肠埃希氏菌的方法进行综述,主要包括传统的细胞培养方法、免疫学检测方法和分子生物学方法等,并对这些方法的应用和发展前景展开了深入探讨。随着分子生物学和生物工程技术的发展,不同检测方法联合使用可以克服单一方法的缺陷,从而取得更高效、准确的检测结果。

2016年江苏省食源性疾病患儿中致泻大肠埃希氏菌毒力基因分布与耐药性特征

目的了解江苏省食源性疾病患儿中致泻大肠埃希氏菌的流行状况、不同毒力基因型的分布和对抗生素的敏感性特征。方法从江苏省各设区市的三甲医院共收集3566例食源性疾病患儿的粪便或肛拭子标本进行致泻大肠埃希氏菌检测,用实时荧光定量PCR进行毒力分型,用微量肉汤稀释法进行药敏实验。结果江苏省食源性疾病患儿中,共检出致泻大肠埃希氏菌104株,总检出率为2.9%(104/3566)。在5种毒力基因型致泻大肠埃希氏菌中,肠聚集性大肠埃希氏菌、肠致病性大肠埃希氏菌是主要的毒力基因型,分别占61.5%(64/104)、26.9%(28/104)。致泻大肠埃希氏菌对氨苄西林耐药率最高,达71.2%,其次为四环素和萘啶酸,分别为59.6%和54.8%。未发现亚胺培南耐药菌株。多重耐药率为75.0%。结论肠聚集性大肠埃希氏菌是导致江苏省儿童食源性疾病最主要的致泻大肠埃希氏菌。约95%以上的致泻大肠埃希氏菌对头孢他啶、头孢西丁敏感,100%对亚胺培南敏感。耐药率及多重耐药率高,应加强致泻大肠埃希氏菌耐药性监测及临床抗生素合理使用。

腹泻仔猪肠道致病性大肠埃希氏菌和沙门氏菌的分离鉴定与耐药性研究

为探明仔猪细菌性腹泻肠道致病性大肠埃希氏菌和沙门氏菌流行的血清型、耐药表型及耐药基因型,本试验采集了贵州省5个地(州)市7个规模化养猪场的128份腹泻仔猪肠道样本,并对采集的样本进行了大肠埃希氏菌和沙门氏菌分离与鉴定,通过动物试验鉴定菌株的致病性,利用血清学方法鉴定其血清型,并通过药敏纸片法对主要致病菌进行耐药性研究,采用PCR技术检测各致病菌株耐药相关基因,分析细菌耐药表型和耐药基因型相关性。结果显示,本研究共分离鉴定到78株致病性大肠埃希氏菌与21株沙门氏菌,致病性大肠埃希氏菌血清型以O138、O87为主,沙门氏菌血清型以鼠伤寒沙门氏菌、肠炎沙门氏菌居多;药敏试验结果表明,本试验分离到的78株致病性大肠埃希氏菌对β-内酰胺类药物耐药率达80%以上,对其他种类的抗菌药耐药率均超过40%,分离鉴定的21株沙门氏菌对氨基糖苷类药物耐药率达50%以上,对其他种类的抗菌药耐药率均达20%以上;本试验分离鉴定的致病性大肠埃希氏菌共检出12种耐药相关基因,沙门氏菌共检出10种耐药相关基因,两种细菌耐药基因型与耐药表型符合率均达60%以上,且均为多重耐药。本研究为仔猪腹泻的综合防控提供了理论依据。