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基于局部回归的色谱保留时间对齐可逆算法
被引量:
1
1
作者
李龙
张纪阳
+3 位作者
史秀建
孙汉昌
谢红卫
欧阳辰星
《中南大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期100-105,共6页
提出并实现一种基于局部回归的对齐算法,选择鉴定结果最多的一次实验作为参考,实现色谱保留时间的可逆对齐,将n次实验的对齐建模次数从n(n-1)/2次减少为n-1次。该算法还实现不同实验间色谱保留时间的非线性对齐,并且能够克服少量从色谱...
提出并实现一种基于局部回归的对齐算法,选择鉴定结果最多的一次实验作为参考,实现色谱保留时间的可逆对齐,将n次实验的对齐建模次数从n(n-1)/2次减少为n-1次。该算法还实现不同实验间色谱保留时间的非线性对齐,并且能够克服少量从色谱柱中多次流出肽段的影响。研究结果表明:该方法计算时间复杂度远比现有算法的低,对齐精度也能够满足后续计算的需要。
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关键词
液质联用串联质
谱
定量蛋白质组学
色谱保留时间对齐
局部回归
可逆算法
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职称材料
题名
基于局部回归的色谱保留时间对齐可逆算法
被引量:
1
1
作者
李龙
张纪阳
史秀建
孙汉昌
谢红卫
欧阳辰星
机构
国防科学技术大学机电工程与自动化学院
北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室
中南大学商学院
出处
《中南大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期100-105,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30621063)
文摘
提出并实现一种基于局部回归的对齐算法,选择鉴定结果最多的一次实验作为参考,实现色谱保留时间的可逆对齐,将n次实验的对齐建模次数从n(n-1)/2次减少为n-1次。该算法还实现不同实验间色谱保留时间的非线性对齐,并且能够克服少量从色谱柱中多次流出肽段的影响。研究结果表明:该方法计算时间复杂度远比现有算法的低,对齐精度也能够满足后续计算的需要。
关键词
液质联用串联质
谱
定量蛋白质组学
色谱保留时间对齐
局部回归
可逆算法
Keywords
liquid chromatography-tandem mass spectrometry
quantitative proteomics
retention time alignment
localregression
reversible algorithm
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
Q332 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于局部回归的色谱保留时间对齐可逆算法
李龙
张纪阳
史秀建
孙汉昌
谢红卫
欧阳辰星
《中南大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
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