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2013-2014年上海市污水中人类肠道病毒的基因型分布
被引量:
4
1
作者
李云逸
陆菁
+6 位作者
王秀芝
杨玉颖
费洁
张莉萍
李智
李崇山
左勇
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期154-159,共6页
目的 分析上海市闵行和嘉定区污水处理厂中人类肠道病毒(HEV)的时间分布特点及其基因分型。方法 于2013—2014年,选取闵行和嘉定区两所污水处理厂入水口作为采样点,每月24—28日采集污水标本1份,每份1 L,共48份。经阴离子膜吸...
目的 分析上海市闵行和嘉定区污水处理厂中人类肠道病毒(HEV)的时间分布特点及其基因分型。方法 于2013—2014年,选取闵行和嘉定区两所污水处理厂入水口作为采样点,每月24—28日采集污水标本1份,每份1 L,共48份。经阴离子膜吸附的方法浓缩,再用牛肉汤洗脱,取上清液并接种RD、HEp-2和L20B细胞进行病毒分离,共分离HEV 249株,其中非脊髓灰质炎病毒(NPEV)185株,脊髓灰质炎病毒(PV)64株(均为疫苗相关株)。通过RT-PCR鉴定基因型,采用Bioedit 7.0.0对VP1核苷酸序列进行序列同源性分析,使用MEGA 5.0软件,通过邻位法构建系统发生树,分析优势株及病毒传播链。结果 185株NPEV中178株鉴定出基因型,包括:柯萨奇B组病毒(CVB)2、3、5基因型,埃可病毒(ECHO)1、3、6、7、11、13、19、20、24、25、30基因型,柯萨奇A组病毒(CVA)4基因型。CVB5和ECHO6是在NPEV分离株中比例较高的两个基因型,分别占33.5%(56株)和24.9%(43株)。闵行区污水水样中HEV分离株主要集中在4—9月份,其中优势株ECHO6主要分布在2013下半年和2014上半年采集水样中,优势株CVB5主要在2013—2014年散在分布。嘉定的ECHO6和CVB5两个优势株的流行趋势与闵行区的基本一致。2013—2014年CVB5形成C6和C8基因亚型2个传播链,而与国外毒株有较大的差异;ECHO6形成C3、C6和D9基因亚型3个传播链,而D9基因亚型在上海属于优势基因亚型,在国内外有一定地域性的传播。结论 2013—2014年上海市污水中的分离到的PV均为疫苗株。HEV优势株为CVB5和ECHO6,其中ECHO6在2013下半年和2014上半年较为流行,CVB5在2014年下半年开始流行。CVB5和ECHO6存在多条传播链的共同流行现象。
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关键词
肠道
病毒
属
柯萨奇
病毒感染
艾可病毒感染
环境监测
原文传递
2001年徐州地区暴发性病毒性脑膜炎病原的研究
被引量:
3
2
作者
李显
郭喜玲
+2 位作者
史智扬
倪大新
汪华
《中华实验和临床病毒学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第1期66-69,共4页
目的确定引起2001年江苏省徐州地区无菌性脑膜炎流行的病原体。方法组织培养法从患者脑脊液分离病毒,标准血清中和试验鉴定分离毒株;中和试验检测双份血清中和抗体效价;逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测肠道病毒特异性基因片段。结果22...
目的确定引起2001年江苏省徐州地区无菌性脑膜炎流行的病原体。方法组织培养法从患者脑脊液分离病毒,标准血清中和试验鉴定分离毒株;中和试验检测双份血清中和抗体效价;逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测肠道病毒特异性基因片段。结果22份脑脊液中分离出4株柯萨奇B5型、2株柯萨奇B3型、1株艾可7型肠道病毒,分离阳性率31.8%。RT-PCR检测脑脊液21份,肠道病毒阳性11份,阳性率52.4%。19例双份血清中11例中和效价呈4倍以上增长或转阳,阳性率57.9%。结论此次江苏省徐州地区无菌性脑膜炎流行的病原体是以柯萨奇B5为主要血清型的肠道病毒。
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关键词
脑膜炎
无菌性
肠道
病毒
属
柯萨奇
病毒感染
艾可病毒感染
原文传递
题名
2013-2014年上海市污水中人类肠道病毒的基因型分布
被引量:
4
1
作者
李云逸
陆菁
王秀芝
杨玉颖
费洁
张莉萍
李智
李崇山
左勇
机构
上海交通大学医学院基础医学院
上海市疾病预防控制中心病原生物检定所
上海市疾病预防控制中心免疫规划所
上海市嘉定区疾病预防控制中心免疫规划科
上海市闵行区疾病预防控制中心免疫规划科
出处
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期154-159,共6页
基金
上海市卫生和计划生育委员会项目(GWTD2015S01、15GWZK0101)
全球健康-盖茨基金项目(OPP1039272)
文摘
目的 分析上海市闵行和嘉定区污水处理厂中人类肠道病毒(HEV)的时间分布特点及其基因分型。方法 于2013—2014年,选取闵行和嘉定区两所污水处理厂入水口作为采样点,每月24—28日采集污水标本1份,每份1 L,共48份。经阴离子膜吸附的方法浓缩,再用牛肉汤洗脱,取上清液并接种RD、HEp-2和L20B细胞进行病毒分离,共分离HEV 249株,其中非脊髓灰质炎病毒(NPEV)185株,脊髓灰质炎病毒(PV)64株(均为疫苗相关株)。通过RT-PCR鉴定基因型,采用Bioedit 7.0.0对VP1核苷酸序列进行序列同源性分析,使用MEGA 5.0软件,通过邻位法构建系统发生树,分析优势株及病毒传播链。结果 185株NPEV中178株鉴定出基因型,包括:柯萨奇B组病毒(CVB)2、3、5基因型,埃可病毒(ECHO)1、3、6、7、11、13、19、20、24、25、30基因型,柯萨奇A组病毒(CVA)4基因型。CVB5和ECHO6是在NPEV分离株中比例较高的两个基因型,分别占33.5%(56株)和24.9%(43株)。闵行区污水水样中HEV分离株主要集中在4—9月份,其中优势株ECHO6主要分布在2013下半年和2014上半年采集水样中,优势株CVB5主要在2013—2014年散在分布。嘉定的ECHO6和CVB5两个优势株的流行趋势与闵行区的基本一致。2013—2014年CVB5形成C6和C8基因亚型2个传播链,而与国外毒株有较大的差异;ECHO6形成C3、C6和D9基因亚型3个传播链,而D9基因亚型在上海属于优势基因亚型,在国内外有一定地域性的传播。结论 2013—2014年上海市污水中的分离到的PV均为疫苗株。HEV优势株为CVB5和ECHO6,其中ECHO6在2013下半年和2014上半年较为流行,CVB5在2014年下半年开始流行。CVB5和ECHO6存在多条传播链的共同流行现象。
关键词
肠道
病毒
属
柯萨奇
病毒感染
艾可病毒感染
环境监测
Keywords
Enterovirus
Coxsackievirus infections
Echovirus infections
Environmental monitoring
分类号
R123 [医药卫生—环境卫生学]
原文传递
题名
2001年徐州地区暴发性病毒性脑膜炎病原的研究
被引量:
3
2
作者
李显
郭喜玲
史智扬
倪大新
汪华
机构
江苏省疾病预防控制中心微生物检验室
出处
《中华实验和临床病毒学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第1期66-69,共4页
文摘
目的确定引起2001年江苏省徐州地区无菌性脑膜炎流行的病原体。方法组织培养法从患者脑脊液分离病毒,标准血清中和试验鉴定分离毒株;中和试验检测双份血清中和抗体效价;逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测肠道病毒特异性基因片段。结果22份脑脊液中分离出4株柯萨奇B5型、2株柯萨奇B3型、1株艾可7型肠道病毒,分离阳性率31.8%。RT-PCR检测脑脊液21份,肠道病毒阳性11份,阳性率52.4%。19例双份血清中11例中和效价呈4倍以上增长或转阳,阳性率57.9%。结论此次江苏省徐州地区无菌性脑膜炎流行的病原体是以柯萨奇B5为主要血清型的肠道病毒。
关键词
脑膜炎
无菌性
肠道
病毒
属
柯萨奇
病毒感染
艾可病毒感染
Keywords
Meningitis, aseptic
Enterovirus
Coxsackievirus infections
Echovirua infections
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2013-2014年上海市污水中人类肠道病毒的基因型分布
李云逸
陆菁
王秀芝
杨玉颖
费洁
张莉萍
李智
李崇山
左勇
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017
4
原文传递
2
2001年徐州地区暴发性病毒性脑膜炎病原的研究
李显
郭喜玲
史智扬
倪大新
汪华
《中华实验和临床病毒学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006
3
原文传递
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