基于结构域的芥子油苷合成相关蛋白质相互作用模型构建和预测

从蛋白质一级序列抽取蛋白质结构域信息建立结构域特征向量,使用结构域特征向量训练基于高斯径向基核的支撑向量机,用5折交叉验证对支撑向量机参数网格寻优,然后用最优化参数训练得到蛋白质相互作用预测器。结果表明:预测器的交叉验证ROC曲线下面积达到了85.49%,可以有效预测拟南芥相关的蛋白质相互作用。

植物激素与芥子油苷在生物合成上的相互作用

植物激素在植物的生长发育中起着关键性作用,芥子油苷是一类重要的次生代谢物质。植物激素与芥子油苷之间存在复杂的相互作用。生长素与吲哚类芥子油苷在生物合成上存在着相互作用。植物防卫信号分子与芥子油苷之间也存在相互作用,茉莉酸强烈诱导吲哚类芥子油苷生物合成相关基因CYP79B2和CYP79B3的表达,从而诱导吲哚-3-甲基芥子油苷和N-甲氧吲哚-3-甲基芥子油苷等吲哚类芥子油苷的生成,水杨酸和乙烯则能轻度诱导4-甲氧吲哚-3-甲基芥子油苷的生成。植物防卫信号转导途径相互作用以精细调节不同种类吲哚类芥子油苷的生成。

三萜皂苷生物合成途径及相关酶

三萜皂苷是一种植物次生代谢物,具有多种生物活性,是许多中药的重要有效成分之一。综述三萜皂苷生物合成途径的研究概况,重点介绍相关酶基因的克隆及其结构特征。

环烯醚萜苷类生物合成途径及相关酶的研究进展

环烯醚萜苷类化合物种类繁多,近年来对此类化合物的广泛研究发现其具有多种生物活性,如抗炎、抗肿瘤、保肝、心血管系统保护作用等。结合近年来国内外的研究,将其生物合成途径、相关酶(GPPS、GES、G10H、10-HGO、IS、7-DLS、7-DLGT、7-DLH、LAMT及SLS)及编码基因的研究进展进行综述,一方面可达到人为调节其代谢产物生成的目的,另一方面可为基于环烯醚萜苷类的新药发现提供参考。

三磷酸腺苷结合盒转运子E1功能及其在疾病中作用的研究进展

三磷酸腺苷结合盒转运子E1(ABCE1)作为一种高度保守的转运蛋白,在生物体的多种细胞活动中发挥重要作用。ABCE1特异结合并抑制核糖核酸酶L活性,增强人类免疫缺陷病毒的复制能力;抑制与细胞增殖相关的2-5A/RNase、细胞质L通路;通过影响蛋白质翻译过程的起始、终止、核糖体循环影响真核生物蛋白质的合成;穿梭往返于细胞核质之间,可能涉及转录调控。将ABCE1的miRNAs或siRNA转入耐药肿瘤细胞中抑制其表达,可能提高化疗药物的敏感性,保证肿瘤化疗的可行性及可持续性,为逆转肿瘤耐药提供新的方法。ABCE1表达增高或降低均可降低活性氧的活性,因此,ABCE1亦可能成为治疗氧化应激相关疾病的新的靶基因。

西洋参不同组织部位中皂苷生物合成相关基因的表达研究

通过皂苷含量与基因表达量之间相关性分析,获得西洋参中不同组织部位皂苷含量与人参皂苷生物合成相关基因表达之间联系。以四年生红果期西洋参的14个组织部位为材料,利用高效液相法和香草醛-硫酸比色法测定西洋参样本中6种单体皂苷（人参皂苷Rg1,Re,Rb1,Rc,Rb2,Rd）,分组皂苷和总皂苷含量;同时,利用实时荧光定量PCR法检测西洋参不同组织部位中7种（SQS,OSC,DS,β-AS,SQE,P450,FPS）人参皂苷生物合成相关基因的表达量。在西洋参中7种人参皂苷生物合成相关酶基因虽然参与人参皂苷合成,但是β-AS和P450基因的表达对单体皂苷,分组皂苷及总皂苷含量影响不显著;FPS,SQS,OSC,DS和SQE这5种基因表达对单体皂苷Re,Rg1,Rb1,Rd,分组皂苷PPD和PPT,单体总皂苷TMS和总皂苷TS含量影响显著或者极显著（P〈0.05或P〈0.01）。西洋参中部分单体皂苷,分组皂苷以及总皂苷的生物合成受着皂苷合成途径多种酶基因相互作用影响,生物合成途径中关键酶基因表达差异决定了西洋参中不同组织部位皂苷含量。因此,该研究通过相关性分析进一步明确了FPS,SQS,OSC,DS和SQE这5种酶基因是控制西洋参中皂苷合成的关键酶,它们通过集群协同表达互作的方式调控西洋参中人参皂苷的生物合成。

地黄中环烯醚萜苷的生物合成研究进展

环烯醚萜苷是传统名贵药材地黄中的主要活性成分,具有重要的药理活性。环烯醚萜苷的生物合成在长春花中研究最早也最成熟,而地黄中的环烯醚萜结构与长春花等植物有所不同,近十年来地黄中环烯醚萜苷的生物合成研究逐渐增多。阐明地黄中环烯醚萜苷的生物合成途径具有重要意义。该文对地黄中环烯醚萜苷的生物合成途径、关键酶和基因及其合成调控的最新研究进展进行综述,以期为深入研究提供参考。