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芦笋枯萎病菌的鉴定及rDNA ITS序列分析
被引量:
3
1
作者
杨迎青
兰波
+4 位作者
孙强
陈洪凡
余建
张顺梁
李湘民
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期22-27,共6页
为准确鉴定芦笋枯萎病致病菌并确定其分类地位,通过形态学观察和核糖体DNA内转录间区(rDNA ITS)序列比对方法,对该病菌进行形态学和分子生物学鉴定,比较其与近缘真菌rDNA ITS序列的差异,并进行系统发育分析。鉴定结果表明,芦笋枯萎病的...
为准确鉴定芦笋枯萎病致病菌并确定其分类地位,通过形态学观察和核糖体DNA内转录间区(rDNA ITS)序列比对方法,对该病菌进行形态学和分子生物学鉴定,比较其与近缘真菌rDNA ITS序列的差异,并进行系统发育分析。鉴定结果表明,芦笋枯萎病的致病菌为尖孢镰刀菌天门冬专化型Fusarium oxysporum f.sp.asparagi。芦笋枯萎病菌F.oxysporumf.sp.asparagi及其同属近缘种木贼镰刀菌F.equiseti和变红镰刀菌F.incarnatum的rDNA ITS序列比对结果表明,其序列在76~80、104~115、129~138、151~158、175~178、382~402、438~445和473~479bp等rDNA ITS区段上存在差异性碱基。芦笋枯萎病菌及其近缘真菌系统发育分析结果表明,6属真菌大致聚为2个组群2个亚群,芦笋枯萎病菌F.oxysporum f.sp.asparagi与木贼镰刀菌F.equiseti和变红镰刀菌F.incarnatum亲缘关系最近。
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关键词
芦笋枯萎病菌
RDNA
ITS
序列比对
系统发育
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题名
芦笋枯萎病菌的鉴定及rDNA ITS序列分析
被引量:
3
1
作者
杨迎青
兰波
孙强
陈洪凡
余建
张顺梁
李湘民
机构
江西省农业科学院植物保护研究所
中华人民共和国黄岛出入境检验检疫局综合技术服务中心
江西农业大学生物工程学院
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期22-27,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31460456)
江西省科技支撑计划重点项目(20151BBF60067)
江西省青年科学基金项目(20142BAB214022)
文摘
为准确鉴定芦笋枯萎病致病菌并确定其分类地位,通过形态学观察和核糖体DNA内转录间区(rDNA ITS)序列比对方法,对该病菌进行形态学和分子生物学鉴定,比较其与近缘真菌rDNA ITS序列的差异,并进行系统发育分析。鉴定结果表明,芦笋枯萎病的致病菌为尖孢镰刀菌天门冬专化型Fusarium oxysporum f.sp.asparagi。芦笋枯萎病菌F.oxysporumf.sp.asparagi及其同属近缘种木贼镰刀菌F.equiseti和变红镰刀菌F.incarnatum的rDNA ITS序列比对结果表明,其序列在76~80、104~115、129~138、151~158、175~178、382~402、438~445和473~479bp等rDNA ITS区段上存在差异性碱基。芦笋枯萎病菌及其近缘真菌系统发育分析结果表明,6属真菌大致聚为2个组群2个亚群,芦笋枯萎病菌F.oxysporum f.sp.asparagi与木贼镰刀菌F.equiseti和变红镰刀菌F.incarnatum亲缘关系最近。
关键词
芦笋枯萎病菌
RDNA
ITS
序列比对
系统发育
Keywords
Fusarium wilt fungus of asparagus
rDNA ITS
sequence alignment
phylogenetic relationship
分类号
S432.44 [农业科学—植物病理学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
芦笋枯萎病菌的鉴定及rDNA ITS序列分析
杨迎青
兰波
孙强
陈洪凡
余建
张顺梁
李湘民
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
3
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