VEGF基因单核苷酸多态性与中国北方汉族人SLE易感性的相关性研究

目的:研究血管内皮生长因子(VEGF)基因单核苷酸多态性(SNP)与中国北方汉族人系统性红斑狼疮(SLE)易感性的相关性。方法:应用Sequenom飞行时间质谱技术检测44例SLE患者和100例正常对照者外周血VEGF基因的SNPs,选择6个VEGF基因的SNP位点:rs2010963、rs3024994、rs3025000、rs3025010、rs3025035和rs833070进行基因分型,用SPSS 11.5软件对数据资料进行统计分析。结果:SLE患者VEGF多态性位点rs2010963、rs3024994、rs3025000、rs3025010、rs3025035的基因型频率及等位基因频率与正常对照组比较差异无统计学意义(P>0.05);VEGFrs833070 A等位基因频率明显高于对照组(31.2%vs20%,χ2=4.547,P=0.033,OR=1.818,95%CI 1.045-3.162)。rs833070 G等位基因在SLE组中关节炎与无关节炎组中频率有显著差异(56%vs80.4%,χ2=5.613,P=0.018,OR=0.336,95%CI 0.134-0.843),rs833070 GG基因型频率明显低于无关节炎组(GGvsAG+AA:28%vs65.2%,χ2=6.684,P=0.010,OR=0.207,95%CI 0.061-0.705),而VEGF rs833070位点基因型、等位基因型的频率与患者血清中ds-DNA抗体、抗Sm抗体、狼疮性肾炎、间质性肺疾病的发生无相关性(P>0.05)。结论:VEGF基因SNP点rs833070与北方汉族人SLE发病易感性相关,rs833070位点A等位基因可能增加了SLE患病的易感性,而rs833070 GG基因型及G等位基因型可能是SLE合伴关节炎的保护性基因。

布依族XRCC1基因单核苷酸多态性及其组合型分析

目的分析布依族人群DNA修复基因XRCC1 C26304T、G27466A与G28152A单核苷酸多态性及其等位基因频率与组合分布特征。方法获取自然人群个体布依族192例血白细胞基因组DNA,利用PCR扩增限制性酶切法(PCR-RFLP)检测XRCC1 C26304T、G27466A与G28152ASNPs。结果XRCC1 C26304T SNPs基因型分布CC、CT、TT分别为64.6%、28.6%、6.8%,C、T等位基因频率分别为78.7%、21.3%。XRCC1 G27466A SNPs基因型分布GG、GA、AA分别为85.9%、12.5%、1.6%,G、A等位基因频率分别为91.7%、8.3%。XRCC1 G28152A SNPs基因型分布GG、GA、AA分别为55.2%、37.0%、7.8%,G、A等位基因频率分别为73.7%、26.3%。本研究发现XRCC1基因C26304T和G28152A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为CC+GG 60例(31.2%);C26304T和G27466A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为CC+GG 98例(51.0%);G28152A和G27466A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为GG+GG 88例(45.8%)。结论本研究揭示了布依族人群XRCC1基因3位点的单核苷酸多态性、基因型及其组合分布特征,为进一步研究该基因SNPs与其生理功能和疾病的关系提供基础资料。

尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶基因多态性与肾移植患者他克莫司浓度/剂量比值的相关性

目的研究尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶(UGT)基因单核苷酸多态性与服用他克莫司的肾移植术后患者体内的血药浓度/剂量(C/D)比值之间的关系。方法以92例经肾移植的患者为研究对象,收集患者的体质量以及个人基本信息,采集患者血液,检查患者血液中他克莫司的血药浓度。同时,对患者进行基因分型,研究基因与药物C/D之间的关系。结果在UGT(rs12233719)基因型中,GG型、GT型+TT型患者的C/D值分别为(136±105),(142±103)(ng/ml)·kg/mg,差异无统计学意义(P>0.05);在UGT(rs7439366)基因型中,TT型、TC型和CC型患者的C/D值分别为(120±63),(144±106),(133±111)ng/ml·kg/mg,差异无统计学意义(P>0.05)。rs12233719和rs7439366基因连锁不平衡检验D’=0.999。结论UGT(rs12233719)和(rs7439366)基因多态性对他克莫司的C/D值无明显影响,但是两者之间存在基因连锁不平衡。服用他克莫司前检测患者基因型有助于制定个体化用药方案,减少不良反应。

胸苷酸合成酶基因5′-端非翻译区域多态性在肺癌诊疗中的应用

目的探讨胸苷酸合成酶(TS)基因5′-端非翻译区域(5′-UTR)多态性在肺癌诊疗中的应用效果。方法回顾性分析2018年8月至2019年6月50例非小细胞肺癌患者临床资料,所有患者均实施顺铂化学治疗方案,化学治疗2~3个周期后对其临床化学治疗总有效率进行评价,根据其化学治疗效果的不同分为A组(化学治疗敏感性高,25例),B组(化学治疗敏感性低,25例),2组均使用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对TS基因5′-UTR多态性进行检测,比较化学治疗敏感性与TS基因5′-UTR多态性与化学治疗敏感性及化学治疗毒性反应的关系。结果A组中TS基因5′-UTR2R/3R+2R/2R的分布率80%(20/25)明显高于B组48%(12/25),差异有统计学意义(P<0.05);非小细胞肺癌患者中TS基因5′-UTR2R/3R+2R/2R对化学治疗的毒性反应明显高于携带TS基因5′-UTR3R/3R,差异有统计学意义(P<0.05)。结论TS基因5′-UTR2R/3R+2R/2R在化学治疗效果较好的患者中有着较为广泛的分布,并且TS基因5′-UTR3R/3R者对铂类化学治疗具有较强的耐药性。

BDNF rs12273539基因多态性与2型糖尿病认知障碍的关联存在性别差异

目的探讨脑源性神经营养因子(BDNF)rs12273539基因多态性和2型糖尿病认知障碍(T2DM-CI)之间的关联。方法选择T2DM-CI患者92例,无认知障碍的T2DM(T2DM-NCI)患者191例,聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法检测BDNF rs12273539基因多态性,SPSS 15.0及在线遗传软件SHEsis进行统计分析。结果在总体样本和男性样本中,BDNF rs12273539 TT基因型在认知障碍病例组分布相对过多,可能是T2DM-CI的易感基因型,在女性样本中BDNF-rs12273539等位基因和基因型分布在T2DM-CI组和T2DM-NCI组的差异无统计学意义。结论BDNF-rs12273539可能是T2DM-CI的易感基因;BDNFrs12273539基因多态性与T2DM-CI的关联存在性别差异。

新生儿高胆红素血症与易感基因-UGT1A1 TATA盒多态性相关性研究

目的探讨高胆红素血症与易感基因-UGT1A1 TA-TA盒的多态性相关性,进一步明确新生儿高胆红素血症的发病机制。方法实验分为高胆红素血症组(A组)和健康新生儿对照组(B组)。分别抽取患儿及健康新生儿外周静脉血,提取两组基因组DNA,PCR扩增UGT1A1基因。PCR产物纯化后直接测序找出相应的突变点。结果两组的孕龄、体质量、性别及喂养方式比较差异均无统计学意义。A、B两组基因型分布:A组基因型分布差异有统计学意义(P<0.01),A组38例杂合子A(TA)6TAA/A(TA)7TAA型基因突变占15.8%,B组占0%;A、B组均无纯合子A(TA)7TAA/A(TA)7TAA型基因突变;A组基因型突变率明显高于B组。结论易感基因-UGT1A1 TATA盒多态性与新生儿高胆红素血症具有明显的相关性。

胃癌组织TSER多态性与5-Fu体外药敏的关系

目的探讨胃癌组织胸苷酸合成酶增强子区(TSER)多态性与5-Fu体外药敏的关系。方法对45例胃癌患者新鲜标本进行体外肿瘤细胞原代培养,用ATP-TCA法检测肿瘤细胞对5-Fu的敏感性并用PCR法检测肿瘤的TSER多态性,分析TSER多态性分布频率与体外药敏有效率的关系。结果TSER多态性三种基因型频率分布:2R/2R、2R/3R、3R/3R基因组分别为6.7%(3/45)、31.1%(14/45)和62.2%(28/45)。5-Fu总有效率为33.3%(14/42)。3R/3R基因组26例,有效5例,无效21例,有效率19.2%;(2R/2R、2R/3R)基因组16例,有效9例,无效7例,有效率56.3%。TSER基因型组之间对5-Fu敏感性存在显著差异性(P<0.05)。结论TSER多态性对5-Fu化疗敏感性可能有关,基因型检测可能有助于预测胃癌组织对5-Fu化疗敏感性。

BDNF、GRIN1基因与双相情感障碍的关联研究

为了探讨GRIN1和BDNF基因的遗传变异在双相情感障碍疾病中的相关作用,从GRIN1、BDNF基因上各取2个SNP位点,采用TaqMan法对100例双相情感障碍患者和100例健康人进行了单核苷酸多态性分析,比较两组基因型频率的差异,并使用软件SHEsis进行单体型分析。结果发现GRIN1基因上的rs2301363和hcv1840191与双相情感障碍发病的关联有统计学意义(P<0.05),它们形成的单倍型T/G在两组人群中的分布差异亦有统计学意义(P<0.05)。而BDNF基因上的rs7103411和rs6265与双相情感障碍发病无统计学意义。实验结果表明GRIN1基因是双相情感障碍的易感基因之一。

吸烟和性别对身体质量指数遗传结构的影响(英文)

采用基于混合线性模型的关联分析方法,检测了身体质量指数(BMI)的相关基因及其相互作用,分析了吸烟和性别对身体质量指数的影响.研究的基因型和表型数据取自慢性阻塞性肺病研究数据库.结果检测到与身体质量指数有关的20个基因以及2对上位性基因,并发现了受吸烟影响及与性别有关的特定基因及其作用方式.检测到与吸烟无关的9个基因,对BMI有较大影响(遗传率为31.23%),并且影响肥胖、糖尿病等7种疾病.吸烟导致的5个基因都能增加BMI,但并不导致肥胖、糖尿病等疾病.生物信息学分析揭示了与身体质量指数相关的基因存在复杂的遗传网络.研究结果表明,吸烟等生活行为的个性化检测对肥胖等复杂疾病的预防及治疗至关重要.

TWEAK基因多态性与中国江苏地区急性心肌梗死的相关性研究

目的:探讨江苏地区急性心肌梗死与肿瘤坏死因子样凋亡微弱诱导剂(tumor necrosis factor-like weak inducer of apoptosis,TWEAK)基因多态性rs12937543、rs4968211、rs11552708位点单核苷酸基因多态性的相关性。方法:收集本院2016-07-2017-07收住急性心肌梗死患者267例为病例组,另选取健康体检者281例为对照组,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测TWEAK基因多态位点rs12937543、rs4968211、rs11552708的基因型和等位基因分布频率。结果:TWEAK基因多态性位点rs12937543基因频率在病例组与对照组中分布差异具有统计学意义(P<0.05);T等位基因能显著增加急性心肌梗死的危险,且与TWEAK血浆表达水平相关(P<0.05)。rs4968211、rs11552708位点均无统计学差异。结论:TWEAK基因多态性位点rs12937543与江苏地区急性心肌梗死存在相关性。

冠心病合并2型糖尿病发病与CCL21基因rs2812377多态相关性研究

目的探讨冠心病合并2型糖尿病的发病与CCL21基因rs2812377多态位点基因频率的改变是否存在相关关系,进一步分析CCL21基因rs2812377多态与冠心病合并2型糖尿病患者血浆中CCL21表达水平是否相关。方法选取自2009年3月至2011年9月北部战区总医院心血管内科收治的225例冠心病合并2型糖尿病患者为研究对象,并设为冠心病合并2型糖尿病组。另纳入同期因胸痛入院但冠状动脉造影证实其冠状动脉主支无狭窄且不满足糖尿病诊断标准的95例患者设为正常对照组。应用酶联免疫吸附实验检测两组研究对象血浆中趋化因子CCL21的表达水平。应用Mass array飞行质谱分析仪对CCL21基因rs2812377单核苷酸多态位点3个基因型TT/GT/GG特点进行分析验证。结果两组研究对象的趋化因子基因CCL21基因rs2812377多态位点TT型、GT型和GG型3种基因型频率比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。CCL21基因rs2812377多态位点T等位基因在冠心病合并2型糖尿病人群的分布频率为33.78%,低于对照人群的44.21%;而G等位基因在冠心病合并2型糖尿病的分布频率为66.22%,高于对照人群的55.79%,差异均有统计学意义(P<0.05)。冠心病合并2型糖尿病组血浆中CCL21水平为(844.73±146.82)pg/ml,高于正常对照组的(507.77±103.62)pg/ml,差异有统计学意义(P<0.05)。冠心病合并2型糖尿病组血浆中TT+GT基因型携带者血浆CCL21水平为(800.31±120.21)pg/ml,低于GG型基因型携带者的(925.79±129.90)pg/ml,差异有统计学意义(P<0.05)。结论趋化因子CCL21表达水平在冠心病合并2型糖尿病患者血浆中明显上调,CCL21基因rs2812377多肽位点G等位基因可能是冠心病合并2型糖尿病发病的危险因素。