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题名基于遗传算法预测2D三向的蛋白质结构
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作者
夏慧芳
郭雨珍
江宏昊
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机构
南京航空航天大学理学院数学系
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出处
《生物信息学》
2019年第1期24-30,共7页
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基金
国家自然科学基金青年科学基金(11601288)
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文摘
本文基于范德华力势能预测2D三向的蛋白质结构。首先,将蛋白质结构预测这一生物问题转化为数学问题,并建立基于范德华力势能函数的数学模型。其次,使用遗传算法对数学模型进行求解,为了提高蛋白质结构预测效率,我们在标准遗传算法的基础上引入了调整算子这一概念,改进了遗传算法。最后,进行数值模拟实验。实验的结果表明范德华力势能函数模型是可行的,同时,和规范遗传算法相比,改进后的遗传算法能够较大幅度提高算法的搜索效率,并且遗传算法在蛋白质结构预测问题上有巨大潜力。
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关键词
蛋白质结构预测
范德华力势能
遗传算法
调整算子
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Keywords
Protein structure prediction
Van der Waals potential energy
Genetic Algorithm
Adjustment operator
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分类号
Q518.3
[生物学—生物化学]
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