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莴苣SBP转录因子基因家族鉴定及其在茎用莴苣茎膨大期的表达分析
1
作者
张雨
马文娟
+3 位作者
丁怡如
柳天义
廉荣齐
黄莹
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第10期1923-1932,共10页
SBP家族基因在植物生长发育过程中具有重要作用。为明确茎用莴苣SBP家族基因染色体分布、启动子顺式作用元件、茎膨大期表达特征及其编码蛋白质的理化性质,本研究以拟南芥SBP蛋白氨基酸序列为参考筛选鉴定莴苣SBP家族基因,进行莴苣SBP...
SBP家族基因在植物生长发育过程中具有重要作用。为明确茎用莴苣SBP家族基因染色体分布、启动子顺式作用元件、茎膨大期表达特征及其编码蛋白质的理化性质,本研究以拟南芥SBP蛋白氨基酸序列为参考筛选鉴定莴苣SBP家族基因,进行莴苣SBP家族基因的染色体定位、进化树构建、启动子顺式作用元件分析,构建其编码蛋白质的互作网络,并利用转录组测序技术及实时荧光定量PCR分析茎用莴苣茎膨大期SBP家族基因的表达模式。结果表明,在莴苣基因组中共鉴定到27个SBP基因,可分为7个亚族,不均匀分布于8条染色体上。多个SBP转录因子与植物开花相关蛋白LFY、乙烯响应转录因子(TOE2、TOE3、SMZ、SNZ)存在互作。在茎用莴苣茎膨大过程中,13个SBP基因的表达模式存在差异。随着茎用莴苣茎的膨大,LsSBP25的表达量呈增加趋势,而LsSBP10、LsSBP22的表达量逐步降低。本研究结果可为进一步探究莴苣SBP家族基因在莴苣生长发育过程中的作用提供基础。
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关键词
莴苣
SBP家族转录因子
茎膨大期
表达模式
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职称材料
题名
莴苣SBP转录因子基因家族鉴定及其在茎用莴苣茎膨大期的表达分析
1
作者
张雨
马文娟
丁怡如
柳天义
廉荣齐
黄莹
机构
临沂大学农林科学学院
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第10期1923-1932,共10页
基金
山东省自然科学基金项目(ZR2020QC156)
国家自然科学基金青年项目(32102405)
大学生创新创业训练计划项目(X202310452399、X202110452278)。
文摘
SBP家族基因在植物生长发育过程中具有重要作用。为明确茎用莴苣SBP家族基因染色体分布、启动子顺式作用元件、茎膨大期表达特征及其编码蛋白质的理化性质,本研究以拟南芥SBP蛋白氨基酸序列为参考筛选鉴定莴苣SBP家族基因,进行莴苣SBP家族基因的染色体定位、进化树构建、启动子顺式作用元件分析,构建其编码蛋白质的互作网络,并利用转录组测序技术及实时荧光定量PCR分析茎用莴苣茎膨大期SBP家族基因的表达模式。结果表明,在莴苣基因组中共鉴定到27个SBP基因,可分为7个亚族,不均匀分布于8条染色体上。多个SBP转录因子与植物开花相关蛋白LFY、乙烯响应转录因子(TOE2、TOE3、SMZ、SNZ)存在互作。在茎用莴苣茎膨大过程中,13个SBP基因的表达模式存在差异。随着茎用莴苣茎的膨大,LsSBP25的表达量呈增加趋势,而LsSBP10、LsSBP22的表达量逐步降低。本研究结果可为进一步探究莴苣SBP家族基因在莴苣生长发育过程中的作用提供基础。
关键词
莴苣
SBP家族转录因子
茎膨大期
表达模式
Keywords
lettuce
SBP family transcription factor
stem expansion stage
expression patterns
分类号
S636.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
莴苣SBP转录因子基因家族鉴定及其在茎用莴苣茎膨大期的表达分析
张雨
马文娟
丁怡如
柳天义
廉荣齐
黄莹
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024
0
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