目的:基于网络药理学探讨“黄芪-白术-茯苓-当归”组方治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis ...目的:基于网络药理学探讨“黄芪-白术-茯苓-当归”组方治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索黄芪、白术、茯苓、当归的化学成分和作用靶点。借助OMIM数据库检索DKD的靶点,进而获取药物与疾病的交集靶点。采用Cytoscape 3.7.2软件绘制“药物-活性成分-靶点”网络图,并筛选关键成分。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并筛选核心靶点。通过Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。结果:“黄芪-白术-茯苓-当归”组方的活性成分44种,其中黄芪20种,白术7种,茯苓15种,当归2种。黄芪靶点413个,白术靶点20个,茯苓靶点26个,当归靶点64个。DKD靶点1024个,疾病与药物的交集靶点19个。槲皮素、刺芒柄花素、山柰酚、异鼠李素可能是关键成分。白细胞介素(interleukin)-6、IL-10、IL-1A、IL-1β、信号传导与转录激活因子1(signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)、C-反应蛋白(C-reactive protein,CRP)等可能是核心靶点。GO分析主要涉及血管生成调节、活性氧代谢过程、细胞因子受体结合等。KEGG通路主要包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、Th17细胞分化、JAK-STAT信号通路等。结论:“黄芪-白术-茯苓-当归”组方可能通过槲皮素、刺芒柄花素等活性成分,调控AGE-RAGE、MAPK等信号通路,作用于IL-6、IL-1A、IL-1β、STAT1、CRP等靶点,从而发挥治疗DKD的作用。展开更多
目的:基于网络药理学探讨"白术-茯苓"治疗代谢综合征(metabolic syndrome, MS)的作用机制。方法:结合中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, T...目的:基于网络药理学探讨"白术-茯苓"治疗代谢综合征(metabolic syndrome, MS)的作用机制。方法:结合中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)和文献检索,筛选"白术-茯苓"药对的活性成分。通过PharmMapper数据库预测各成分作用靶点,并使用Universal Protein(UniProt)数据库规范靶点名称。从人类基因数据库(GeneCards)、治疗靶标数据库(therapeutic target database, TTD)、DisGeNET三个数据库中筛选MS相关靶点后,与"白术-茯苓"各成分作用靶点合并取交集得到"白术-茯苓"治疗MS的潜在靶点,导入Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-成分-靶点"网络。通过String平台和Cytoscape软件构建蛋白质互相作用网络,并用插件CytoHubba筛选核心靶点。用R软件对"白术-茯苓"治疗MS的潜在靶点进行基因本体(gene ontology, GO)分子功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析。结果:筛选得到"白术-茯苓"活性成分26种,治疗MS的重要成分为茯苓新酸A、14-乙酰基-12-千里光酰基-8-顺式白术三醇、茯苓新酸B、7,9(11)-去氢茯苓酸、茯苓新酸C等;潜在治疗靶点47个,核心靶点包括血清白蛋白(albumin, ALB)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶1 (mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、雌激素受体1 (estrogen receptor, ESR1)、MAPK8、MAPK14等;分子功能主要涉及调节类固醇激素受体活性、类固醇结合、核受体活性等;信号通路主要涉及雌激素信号通路、晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end product-receptor, AGE-RAGE)信号通路、叉头转录因子(forkhead box O,FoxO)信号通路、受体酪氨酸激酶(receptor tyrosine-protein kinase, ErbB)信号通路、白细胞介素-17(interleukin17,IL-17)信号通路等。结论:"白术-茯苓"药对可通过多成分、多靶点、多途径发挥对MS的治疗作用,为实验研究提供一定理论参考。展开更多
文摘目的:基于网络药理学探讨“黄芪-白术-茯苓-当归”组方治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索黄芪、白术、茯苓、当归的化学成分和作用靶点。借助OMIM数据库检索DKD的靶点,进而获取药物与疾病的交集靶点。采用Cytoscape 3.7.2软件绘制“药物-活性成分-靶点”网络图,并筛选关键成分。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并筛选核心靶点。通过Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。结果:“黄芪-白术-茯苓-当归”组方的活性成分44种,其中黄芪20种,白术7种,茯苓15种,当归2种。黄芪靶点413个,白术靶点20个,茯苓靶点26个,当归靶点64个。DKD靶点1024个,疾病与药物的交集靶点19个。槲皮素、刺芒柄花素、山柰酚、异鼠李素可能是关键成分。白细胞介素(interleukin)-6、IL-10、IL-1A、IL-1β、信号传导与转录激活因子1(signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)、C-反应蛋白(C-reactive protein,CRP)等可能是核心靶点。GO分析主要涉及血管生成调节、活性氧代谢过程、细胞因子受体结合等。KEGG通路主要包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、Th17细胞分化、JAK-STAT信号通路等。结论:“黄芪-白术-茯苓-当归”组方可能通过槲皮素、刺芒柄花素等活性成分,调控AGE-RAGE、MAPK等信号通路,作用于IL-6、IL-1A、IL-1β、STAT1、CRP等靶点,从而发挥治疗DKD的作用。
