茶树紫阳种RbcL基因片段的克隆与序列分析

RbcL基因是绿色植物进行光合作用的关键基因,其序列是分子系统学研究中使用最为广泛的分子标记之一。利用PCR扩增和测序,获得了茶树紫阳种RbcL基因744 bp的序列。对来自山茶科7个样品的RbcL序列进行比对和系统聚类分析。结果显示,山茶属的白毛变种、金花茶和丹寨秃茶首先与紫阳茶聚合,其他山茶科植物位于核心聚类群的外围。以大头茶RbcL基因为参照,进行山茶属植物SNP位点的分析,结果显示,在所比对的744 bp的序列中,山茶属共存在10个SNP位点,其中,同义替换4个,非同义替换6个。