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生物信息学筛选催化茶黄素合成的多酚氧化酶
被引量:
13
1
作者
周仲华
张达
+1 位作者
倪贺
李海航
《华南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2017年第3期59-67,共9页
利用生物信息学方法从天然植物中筛选天然PPO酶源.用PPO保守序列从Uniport中检索到529条植物源PPO,除去重复的和不完整的序列后,得到178条PPO序列.用同源建模法,以甘薯PPO晶体结构(1BUG)为模板,构建各PPO的三维结构模型,经Procheck和Ver...
利用生物信息学方法从天然植物中筛选天然PPO酶源.用PPO保守序列从Uniport中检索到529条植物源PPO,除去重复的和不完整的序列后,得到178条PPO序列.用同源建模法,以甘薯PPO晶体结构(1BUG)为模板,构建各PPO的三维结构模型,经Procheck和Verify3D评价后,获得163个优质的PPO三维结构.用TM-score(空间拓扑)和RMSD(结构叠合)对163个PPO与茶PPO(A6N8J4)的三维结构进行了相似性比较.用Autodock Vina将163个PPO与茶中4种主要儿茶素进行分子对接,根据酶与底物结合的亲和力(Binding Affinity)预测各PPO的活性,发现酶与底物的亲和力与酶的一级结构序列同源性和酶的三维结构的重叠度之间无直接关系.从潜在的10种高PPO活性的植物材料中提取PPO、测定其茶黄素转化活性.10种植物材料中均有不同程度的PPO活性,其中沙梨和甘薯的PPO活性最高,且高于茶叶PPO活性.甘薯资源极其丰富,可从甘薯生产淀粉的废水中大量回收PPO,用于茶黄素的工业合成.本研究表明,利用生物信息学法可以从大量酶的序列信息中成功筛选出高活性的酶,与传统的酶活性筛选法比,可大大提高筛选范围和效率.
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关键词
多酚氧化酶
茶黄素合成
生物信息学
同源建模
分子对接
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职称材料
HPLC分析Cu^(2+)对茶酶源酶促氧化合成茶黄素的影响
被引量:
4
2
作者
张元
钱文俊
+1 位作者
韩永涛
肖斌
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第10期118-123,共6页
为比较不同浓度Cu2+处理下茶树鲜叶多酚氧化酶对酶性合成茶黄素效率的影响。通过测定茶叶样品中多酚氧化酶的质量分数,并对氧化产品进行HPLC分析。结果表明,不同浓度Cu2+处理下茶黄素合成效率呈线性变化。n(Cu2+)/n(PPO)=0.2时,茶黄素...
为比较不同浓度Cu2+处理下茶树鲜叶多酚氧化酶对酶性合成茶黄素效率的影响。通过测定茶叶样品中多酚氧化酶的质量分数,并对氧化产品进行HPLC分析。结果表明,不同浓度Cu2+处理下茶黄素合成效率呈线性变化。n(Cu2+)/n(PPO)=0.2时,茶黄素合成率最高,为35.193%,乙酸乙酯层茶黄素质量分数为45.738%。n(Cu2+)/n(PPO)=0.8时,茶鲜叶多酚氧化酶氧化效果与n(Cu2+)/n(PPO)=0时相当。n(Cu2+)/n(PPO)>0.8时,Cu2+增加可抑制茶树鲜叶多酚氧化酶活性。分析儿茶素转化率可知,n(Cu2+)/n(PPO)=0.4时,儿茶素转化率最高,达99.05%;n(Cu2+)/n(PPO)>0.4时,儿茶素转化率呈下降趋势。总体而言,n(Cu2+)/n(PPO)=0.2时,茶多酚氧化酶氧化合成茶黄素有最优值。
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关键词
茶黄素合成
CU^2+
HPLC
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职称材料
题名
生物信息学筛选催化茶黄素合成的多酚氧化酶
被引量:
13
1
作者
周仲华
张达
倪贺
李海航
机构
华南师范大学生命科学学院
出处
《华南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2017年第3期59-67,共9页
基金
2015年中央农业技术推广项目(粤农财2015,No.60-43)
广东省科技计划项目(2014A010107026)
文摘
利用生物信息学方法从天然植物中筛选天然PPO酶源.用PPO保守序列从Uniport中检索到529条植物源PPO,除去重复的和不完整的序列后,得到178条PPO序列.用同源建模法,以甘薯PPO晶体结构(1BUG)为模板,构建各PPO的三维结构模型,经Procheck和Verify3D评价后,获得163个优质的PPO三维结构.用TM-score(空间拓扑)和RMSD(结构叠合)对163个PPO与茶PPO(A6N8J4)的三维结构进行了相似性比较.用Autodock Vina将163个PPO与茶中4种主要儿茶素进行分子对接,根据酶与底物结合的亲和力(Binding Affinity)预测各PPO的活性,发现酶与底物的亲和力与酶的一级结构序列同源性和酶的三维结构的重叠度之间无直接关系.从潜在的10种高PPO活性的植物材料中提取PPO、测定其茶黄素转化活性.10种植物材料中均有不同程度的PPO活性,其中沙梨和甘薯的PPO活性最高,且高于茶叶PPO活性.甘薯资源极其丰富,可从甘薯生产淀粉的废水中大量回收PPO,用于茶黄素的工业合成.本研究表明,利用生物信息学法可以从大量酶的序列信息中成功筛选出高活性的酶,与传统的酶活性筛选法比,可大大提高筛选范围和效率.
关键词
多酚氧化酶
茶黄素合成
生物信息学
同源建模
分子对接
Keywords
Polyphenol oxidase, theaflavin synthesis, bioinformatics, homology modeling, molecular docking
分类号
Q819 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
HPLC分析Cu^(2+)对茶酶源酶促氧化合成茶黄素的影响
被引量:
4
2
作者
张元
钱文俊
韩永涛
肖斌
机构
西北农林科技大学园艺学院
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第10期118-123,共6页
基金
国家茶叶产业技术体系(CARS-23)
陕西省科技统筹创新项目(2013KTZB02-01-01)~~
文摘
为比较不同浓度Cu2+处理下茶树鲜叶多酚氧化酶对酶性合成茶黄素效率的影响。通过测定茶叶样品中多酚氧化酶的质量分数,并对氧化产品进行HPLC分析。结果表明,不同浓度Cu2+处理下茶黄素合成效率呈线性变化。n(Cu2+)/n(PPO)=0.2时,茶黄素合成率最高,为35.193%,乙酸乙酯层茶黄素质量分数为45.738%。n(Cu2+)/n(PPO)=0.8时,茶鲜叶多酚氧化酶氧化效果与n(Cu2+)/n(PPO)=0时相当。n(Cu2+)/n(PPO)>0.8时,Cu2+增加可抑制茶树鲜叶多酚氧化酶活性。分析儿茶素转化率可知,n(Cu2+)/n(PPO)=0.4时,儿茶素转化率最高,达99.05%;n(Cu2+)/n(PPO)>0.4时,儿茶素转化率呈下降趋势。总体而言,n(Cu2+)/n(PPO)=0.2时,茶多酚氧化酶氧化合成茶黄素有最优值。
关键词
茶黄素合成
CU^2+
HPLC
Keywords
Thea-flavins synthesis
Cu^2+
HPLC
分类号
Q946 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
生物信息学筛选催化茶黄素合成的多酚氧化酶
周仲华
张达
倪贺
李海航
《华南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2017
13
下载PDF
职称材料
2
HPLC分析Cu^(2+)对茶酶源酶促氧化合成茶黄素的影响
张元
钱文俊
韩永涛
肖斌
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
4
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职称材料
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