用荧光探针定量PCR技术检测孕妇与胎儿乙肝病毒感染的研究

目的 :探讨孕妇血中乙肝病毒 (HBV)DNA数量与胎儿乙肝病毒感染的关系。方法 :对 71例孕妇乙肝病毒表面抗原 (HBsAg)阳性者 ,用荧光探针定量PCR(FQ -PCR)方法 ,检测血清、宫颈分泌物及乳汁中HBVDNA数量 ,HBVDNA阳性者肌注乙肝免疫球蛋白 ,分娩后新生儿取末梢静脉血进行HBVDNA定量测定。结果 :孕妇血中HBVDNA阳性者其宫内感染率为 32 .6 % ,宫内感染与孕妇血中HBVDNA数量有关 ,HBVDNA数量高易导致胎儿宫内感染 ,乙肝免疫球蛋白可阻断HBV宫内传播。结论 :FQ -PCR方法能快速、准确检测孕妇血中HBVDNA数量 ,孕妇血中HBVDNA数量高易导致胎儿宫内感染 。

荧光探针定量PCR技术

PCR技术是通过对基因的选择性片段进行体外高效扩增,实现目的基因的检测.荧光探针定量PCR(FQ-PCR)是一种新的基因定量检测技术,国外文献多用"实时定量PCR(real time quantitative PCR)"或"TaqMan PCR(以美国PE公司商标命名)".该技术是在常规PCR基础上加入荧光标记探针,巧妙地把核酸扩增(PCR)、杂交及光谱技术结合在一起,从而实现了对目的基因的准确定量检测,正发展成为临床实验诊断的常规技术.

荧光探针定量PCR及其临床应用

荧光探针定量PCR (FQ—PCR)由PCR与荧光素标记的探针杂交技术相结合,可用来检测临床标本中各种病原微生物的RNA/DNA。具有快速、简便、敏感、特异之优点。因其在单一试管内进行PCR扩增,可避免普通PCR由于污染所造成的假阳性,并可定量检测各种病原微生物的RNA/DNA含量。

荧光探针定量PCR在检测HBV-DNA的应用

目的 用荧光定量聚合酶链反应 (FQ PCR)方法准确地定量检测血清中的HBV DNA数量和免疫指标 ,以指导临床。方法 用FQ PCR方法和酶联免疫吸附试验 (ELISA)方法分别检测 184份临床血清标本的HBVDNA和免疫指标。结果 用 (ELISA)作对照 ,经FQ PCR检测 ,HBeAg(+)组 (82份 )的阳性率为 10 0 % ,HBV DNA阳性拷贝数范围在 10 5～ 10 10 /ml;HBeAb(+)组 (5 2份 )的阳性率为 5 5 8% ,HBV DNA阳性拷贝数范围在 10 4～ 10 7/ml;HBsAb(+)组 (2 0份 )的阳性率为 15 % ,HBV DNA阳性拷贝数范围在 10 4～ 10 5/ml;对照组 (30份 )的阳性率为 0。HBeAg(+)组血清中HBV DNA含量 (10 7 2± 1 13 )显著高于HBeAb(+)组 (10 5 8± 1 4)和HBsAb(+)组 (10 4 67± 0 58)。结论 FQ PCR检测HBV DNA具有较高的灵敏度和特异性 ,且能准确定量 ,FQ PCR可以检测HBV的真实感染和复制情况 ,对乙型肝炎临床诊断 ,治疗及疗后观察有重要意义。

实时荧光探针定量PCR在小儿沙眼衣原体肺炎诊断中的临床应用研究

目的观察荧光定量PCR在小儿沙眼衣原体肺炎诊断中的应用价值及探讨不同年龄阶段小儿沙眼衣原体（CT）肺炎的临床特点。方法将我院2004年1～12月份收治60例小儿CT肺炎做研究对象，根据年龄分组，对各组患儿均通过咽拭子或吸痰法获取标本，进行CT～DNA定量分析；回顾性总结分析60例CT肺炎。结果60例标本中，10^6拷贝数5例，10^5拷贝数6例，10^4拷贝数10例，10^3拷贝数39例；小婴儿CT肺炎往往无发热性肺炎，易合并细菌感染：3岁以上儿童则易出现发热、肺部体征大多阴性，而X线多表现为节段性肺炎，其临床经过类似支原体肺炎。结论1．实时荧光定量PCR检测CT～DNA是诊断小儿沙眼衣原体肺炎最直接、最客观的指标。2．CT肺炎在不同年龄阶段的临床表现存在显著差异。

关于解脲脲原体荧光探针定量PCR检测阳性培养阴性的问题探讨

对 915例荧光定量PCR解脲脲原体阳性的标本作解脲支原体培养 ,发现有 5 7例阴性 ,阴性率为 6 .2 %。通过重新取标本 ,对这 5 7例标本作第二次、第三次培养 ,有 5 4例为阳性 ,另 3例仍为阴性。

荧光探针定量法检测小儿肺炎支原体临床应用研究

目的:探讨荧光探针定量(FQ-PCR)法检测小儿肺炎支原体的临床应用价值。方法:用荧光探针定量(FQ-PCR)法对小儿肺炎支原体DNA进行定量测定。同时用ELISA法MP-IgM(1周内、1周后)进行比较。结果:150例受检患儿中,FQ-PCR法阳性57例,阳性率占38%,DNA平均拷贝数4.65×106;1周内MP-IgM阳性15例,占10%;1周后MP-IgM阳性42例,占28%。FQ-PCR与1周后MP-IgM之间差异有显著性,X2=3.39(P<0.05),FQ-PCR与1周内MP-IgM有显著差异X2=32.27(P<0.005),1周之内与1周之后MP-IgM之间有显著性差异X2=13.91(P<0.005)。结论:应用FQ-PCR技术具有特异性强,灵敏度高,是早期快速诊断小儿肺炎支原体感染的可靠方法,值得推广使用。

荧光定量PCR探针熔解曲线法在结核分枝杆菌耐药基因检测中的应用研究

探讨在结核分枝杆菌耐药基因检测中,对其予以荧光定量PCR探针熔解曲线法,观察分析应用价值。方法 本研究的时长段在2022年6月到2023年6月,统共1000例结核患者接受治疗,所有病患都拓展了抗结核药物的测验,且每一位患者的标本均予以荧光定量PCR探针熔解曲线法检测,药物敏感性测定结果为黄金基准,考察判辨荧光定量PCR探针熔解曲线法对利福平医药品、异烟肼医药品、乙胺丁醇医药品、链霉素医药品的诊断效能。结果 针对1000例的标本中,经过液体药敏试验检测显示对利福平药物耐药例数250例,役使溶解曲线观察耐药性包含了240例患者;对异烟肼医药有耐药性的液体药敏试验500例,应用溶解曲线检测耐药性包含了470例;经过液体药敏试验检测显示对乙胺丁醇药物耐药例数170例,予以熔解曲线法显示耐药140例。经过液体药敏试验检测显示对乙胺丁醇药物耐药例数300例,役使溶解曲线观察耐药性包含了240例患者。熔解曲线法对利福平医药品、异烟肼医药品、乙胺丁醇医药品、链霉素医药品的灵敏度分别为84.00%、84.00%、47.06%、66.67%;特异度分别为96.00%、90.00%、84.34%、94.29%;准确度分别为93.00%、97.00%、91.00%、86.00%。结论 在结核分枝杆菌耐药基因检测中,对其予以荧光定量PCR探针熔解曲线法,可得到较高的应用价值,灵敏度、特异度、准确度较高,可筛查结核病患者对利福平、异烟肼、乙胺丁醇等药物的耐药性,为临床治疗疾病提供可靠的依据。

猪流行性腹泻病毒锁核酸探针荧光定量PCR检测方法的建立

为建立一种快速、灵敏的猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)早期痕量检测方法,该研究以PEDV的M基因为靶基因,设计了特异性引物和锁核酸(Locked Nucleic Acid,LNA)-TaqMan探针,经过条件优化,建立了基于LNA-TaqMan探针的PEDV荧光定量PCR方法,并与常规TaqMan探针法进行了比对。结果显示,所建立的PEDV的LNA-Taq-Man探针荧光定量PCR方法最低检测限为3.2拷贝/微升,较常规TaqMan探针法提高了10倍;与猪传染性胃肠炎病毒、猪轮状病毒和猪德尔塔冠状病毒等多种病原不存在交叉反应,特异性良好;批内和批间重复性结果的变异系数均小于1%,重复性较好。应用该方法对103份临床样品进行检测,结果显示,共检出PEDV阳性样品47份,阳性率45.63%,与常规TaqMan探针法检测结果的阳性符合率为90.38%。本研究建立的基于LNA-TaqMan探针的荧光定量PCR方法为PEDV的精准检测和流行病学调查提供了一种新的技术选择。

布鲁菌Cycling探针荧光定量PCR检测方法的建立

根据布鲁菌BCSP31基因序列设计布鲁菌通用检测引物和探针,建立了布鲁菌Cycling探针荧光定量PCR检测方法。以构建的含BCSP31基因的质粒标准品10倍递进稀释为模板检测其敏感性,结果显示,本方法能检测约10个拷贝的阳性质粒,且标准曲线的线性关系良好。用本方法检测5株不同种的布鲁菌以及猪大肠杆菌K99、巴氏杆菌C48-1、猪链球菌ST171、绿脓杆菌等4株对照菌。结果显示,5株不同种的布鲁菌均出现典型的"S"型扩增曲线,4株对照菌40个循环内均无CT值出现。用本方法和B4/B5-PCR方法对来自布鲁菌病流行地区3个不同牛场的40份血样、奶样和血清样进行平行检测。结果显示,本方法和B4/B5-PCR方法的结果符合率为80.0%。B4/B5-PCR检测为阳性的27份样品经本方法检测均为阳性;B4/B5-PCR检测为阴性的13份样本,经本方法检测,其中8份呈阳性,5份为阴性。本方法的敏感性明显高于B4/B5-PCR方法。试验表明,所建立的Cycling探针荧光定量PCR方法具有敏感、特异、稳定等特点,可用于布鲁菌感染的快速检测。

犬瘟热病毒、犬细小病毒二重TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用

为建立一种特异、高通量检测犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)和犬细小病毒(canine parvovirus,CPV)的二重TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR方法,本研究选取高度保守且具有型特异性的CDV H基因和CPVVP2基因序列,设计CDV和CPV特异性引物对及TaqMan MGB探针;经反应条件优化,建立了检测CDV和CPV的二重TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR方法,并进行了敏感性、特异性和重复性试验。结果显示,该方法检测CDV、CPV的标准曲线线性相关系数(R^2)分别为0.997和0.993,最低检出限均为10拷贝/μL,具有较高的灵敏性;对犬副流感病毒等4种病原对照和阴性对照均未出现扩增,特异性良好;CDV、CPV标准品批间试验结果显示,该方法具有很好的重复性;对48份临床疑似CDV或CPV感染样品检测结果显示,14份为CDV阳性,19份为CPV阳性,4份为CDV/CPV双阳性,与CDV H基因、CPVVP2基因测序结果符合率为100%。本研究建立的二重TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR方法具有灵敏、特异、高通量和可准确定量等优点,可用于临床CDV/CPV病毒感染各个时期的快速鉴别检测。

牛传染性鼻气管炎gB基因TaqMan探针及SYBR Green 1荧光定量PCR方法的建立与比较

为建立牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)荧光定量PCR检测方法,本研究利用IBRV g B基因序列设计引物及相应探针,分别建立Taq Man探针与SYBR Green 1荧光定量PCR方法,并对两种方法的敏感性等综合比较。结果显示,SYBR Green 1荧光定量PCR方法的相关系数(R2)为0.998,扩增效率(E)为95.7%;Taq Man探针荧光定量PCR方法的R2为0.999,E为108.3%;两种方法的敏感性均为0.2 TCID50,变异系数均小于3%。综合结果显示,两种检测方法无显著差异。最后,本研究成功建立了检测IBRV的荧光定量PCR,将为IBRV的临床检测提供方法。

TaqMan-MGB探针荧光定量聚合酶链式反应法检测酸奶制品中动物双歧杆菌BB-12

目的建立一种TaqMan-小沟结合物(minor groove binder,MGB)探针荧光定量聚合酶链式反应法检测酸奶制品中动物双歧杆菌BB-12的分析方法。方法设计动物双歧杆菌BB-12的16SrRNA序列的MGB探针,利用荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)技术,构建目标序列的过表达载体,提取质粒进行标准曲线的绘制,最后进行市售酸奶样品检测,定量酸奶中BB-12菌株的数量。结果所有载体标准品均产生显著的荧光增幅,循环阈值(cycle threshold, Ct)介于16~20之间;而以其他酸奶制品添加菌及大肠杆菌样品DNA为模板则无荧光扩增信号。在检测灵敏度方面,BB-12载体可被稳定检出的质量浓度低至0.0000584 ng/μL, Ct值平均数为28.73,即检测灵敏度低至为0.05 pg。绘制的标准曲线线性良好,扩增效率E为0.39,判定系数R^(2)=0.9999。市售酸奶样品检测特异性好、灵敏度高、定量结果准确。结论本研究建立的TaqMan-MGB探针荧光定量PCR检测法可实现在酸奶中对BB-12菌种的检测及定量。

实时荧光定量PCR结合探针检测MP的临床价值及MP耐药情况分析

目的评价实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)结合探针检测对肺炎支原体(MP)的诊断价值,并分析MP的耐药突变情况,指导MP感染患儿的临床用药。方法选取2017年9月-2019年8月奉城医院收治并经诊断确诊的70例MP感染患儿及30例非MP感染患儿,对所有患儿咽拭子标本进行MP-DNA扩增,采用荧光探针法对MP与大环内酯类抗菌药物耐药突变率进行检测。收集所有患儿临床资料,并分析其与MP-DNA阳性检出及MP耐药突变的相关性。结果实时荧光定量PCR结合探针检测MP的敏感性和特异性分别为80.0%(56/70)和96.7%(29/30);双份血清MP-IgM抗体滴度呈4倍或4倍以上(升高或降低)变化组MP-DNA阳性检出率明显较单份血清滴度≥1∶160组高;患儿性别、年龄、入院时病程及入院前大环内酯类抗菌药物治疗史对于MP-DNA阳性的检出率均无显著影响;MP-DNA耐药突变率高达85.7%,入院前规律完成大环内酯类抗菌药物1个疗程组DNA耐药突变率为90.5%,明显高于未完成1个疗程组(80.0%)和未服用组(50.0%)。结论实时荧光定量PCR结合探针可作为检测MP的一种有效方法,为临床对MP感染患儿抗菌药物的使用提供依据,具有较高的临床应用价值。

荧光PCR定量检测乙型肝炎病毒的临床意义

目的 :对荧光定量 PCR(FQ- PCR)测定的 10 2例 HBV- DNA结果进行分析 ,以探讨其临床价值。方法 :对 10 2份临床血清标本用 FQ- PCR方法进行 HBV- DNA定量测定 ,并和 EL ISA两对半结果以及 AL T结果进行比较分析。结果 :2 5份 HBs Ag(+)、HBe Ag(+)、HBc Ab(+)的标本 HBV- DNA均为阳性 ,L og DNA平均值± 2 sd为 7.45± 2 .5 4;34份 HBs Ag(+)、HBe Ab(+)、HBc Ab(+)的标本 HBV- DNA阳性 15份 ,L og DNA平均值± 2 sd为 6 .33± 1.86 ;9份HBs Ag(+)、HBc Ab(+)的标本 HBV- DNA阳性 4例 ,L og DNA平均值± 2 sd为 5 .2 3± 4.6 0 ;14份 HBs Ab(+)的标本 HBV- DNA阳性 1例 ,18份全阴性的标本 HBV- DNA无阳性。以上五种两对半结果其相对应的 HBV- DNA值基本呈下降趋势 ,而且前二者之间有显著性差异 (P<0 .0 1)。急性乙型病毒性肝炎、慢性乙型病毒性肝炎、肝癌、肝硬化患者之间的 HVB- DNA定量结果无显著性差异。HBV- DNA和 AL T之间无相关性 (r=0 .17)。结论 :FQ- PCR定量测定HBV- DNA可以真实反应 HBV的感染和复制情况 ,可以用于临床治疗和疗效观察 ,但它在急性乙型病毒性肝炎、慢性乙型病毒性肝炎、肝癌、肝硬化的鉴别诊断上无帮助 ,和病情的轻重也无相关性。

牛冠状病毒荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用

目的建立特异灵敏的牛冠状病毒(bovine coronavirus,BCV)荧光定量PCR检测方法,并对牛源性样本进行筛查。方法根据Genbank中登录的BCV的N基因序列设计Taq Man引物探针,建立基于Taq Man探针法的BCV PCR检测方法,对收集到的牛源样本进行BCV筛查,并对部分阳性样本的PCR产物进行测序鉴定。结果建立了能够特异检测BCV的Taq Man探针法荧光定量PCR检测方法,其标准曲线相关系数Slope为-3.417,相关系数r2为0.999,,扩增效率Eff为96.195%。该方法检测BCV的敏感度为40 copies。使用该方法检测64份牛肛拭子样本检出率为1.5%,检测33份牛源生物制品检出率为6%,部分阳性样本的PCR产物经测序比对为BCV核酸序列,说明BCV在国内牛群中流行,牛源相关生物制品中有感染BCV的潜在风险。结论经测序验证,建立的方法能够灵敏的检测样本中的BCV核酸,应加强牛源相关生物制品中BCV的监测,避免人感染BCV的潜在风险。

TaqMan荧光定量RT-PCR快速检测西尼罗病毒的研究

目的建立特异、快速、灵敏的TaqMan实时荧光定量聚合酶链反应（TaqMan—based Real—timePCR）用于西尼罗病毒（WNV）核酸检测，为WNV的感染诊断和流行病学监测奠定技术基础。方法根据文献公开发表的WNV核酸检测引物和TaqMan探针，优选最佳引物探针。应用DNAWorks2．4在线软件设计8条寡核苷酸片段，基于PCR合成包含引物探针扩增区域的230个核苷酸作为WNV模拟核酸。并对TaqMan-based Real—timePCR条件进行优化，验证该方法的特异性、灵敏度。结果该方法对WNV核酸检测有高度特异性，与流行性乙型脑炎、登革热1～4型等虫媒病毒均无交叉反应，对构建的DNA检测灵敏度达100拷贝／反应。结论TaqMan—based Real—timePCR是一种快速检测WNV特异、敏感的方法，适用于WNV的早期感染诊断和流行病学监测。

双重荧光定量RT-PCR快速检测A、B型流感病毒的研究

目的:建立双重荧光定量RT-PCR技术同时快速检测A、B型流感病毒,并应用于临床样本的检测。方法:在A型流感病毒M基因和B型流感病毒NP基因的保守区序列分别设计特异性引物和Taqman探针,建立优化单一和双重荧光RT-PCR反应体系,评价所建双重RT-PCR反应体系的特异性、敏感性和稳定性,并应用于疑似流感含漱液标本检测。结果:该方法对A、B型流感病毒检测具有高度特异性,检出限分别为0.1TCID50和0.01TCID50,可从疑似流感患者含漱液中直接检测到流感病毒核酸。构建的体系定量标准曲线相关系数分别为0.998和0.999,具有较好的稳定性。结论:本研究建立的双重荧光定量RT-PCR可以同时准确分型A、B型流感病毒,灵敏度高,稳定性好,是一种快速检测流感病毒的新方法。

RHCE~* ce(308C>T)突变型等位基因Taqman实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

目的建立Rh血型系统RHCE＊ ce（308C〉T）突变型等位基因的Taqman探针实时荧光定量PCR检测方法,筛查携带该等位基因的个体,并对其Rh CE血型抗原进行鉴定分析。方法针对RHCE基因c. 308C〉T突变位点设计特异性引物及Taqman-MGB探针,采用已知携带该突变位点的标本作为阳性对照,建立实时荧光定量PCR方法。应用该方法对800例RhD阴性标本、1 000例RhD阳性标本以及400例D放散型标本进行突变筛查,同时随机抽取200例标本进行RHCE基因外显子2直接测序。对筛查出携带该突变型等位基因的标本进行RHCE基因外显子2测序确证,同时应用多重连接依赖式探针扩增（MLPA）基因检测结合测序方法对其进行Rh血型基因型鉴定,并进行Rh血型血清学检测。此外,采用6种针对不同抗原表位的单克隆抗体对Rhc抗原的表达进行血清学鉴定,并采用4种抗-c进行Rhc抗原的流式细胞检测。结果成功建立RHCE＊ ce（308C〉T）等位基因的Taqman探针实时荧光定量PCR方法。应用该方法从800例RhD阴性标本中筛查出2例携带该突变型等位基因标本,RHCE基因外显子2测序结果证实存在杂合点突变（c. 308C〉T,p. 103Pro〉Leu）,但在RhD阳性及D放散型标本中未检出此突变。此2例标本的Rh抗原表型均为CCdee,基因型均为Cde/c^vde[c^v表示RHCE＊ ce（308C〉T）突变型等位基因]。该2例标本的Rhc抗原血清学和流式细胞检测均为阴性,而Rh C抗原表达正常。结论 Taqman探针实时定量PCR方法进行RHCE＊ ce（308C〉T）等位基因检测快速准确,该等位基因可导致c抗原不表达。