实时荧光环介导恒温扩增技术检测嗜麦芽窄食单胞菌方法的建立

目的建立嗜麦芽窄食单胞菌16S ribosomal RNA基因的实时荧光环介导恒温扩增(Real Amp)快速检测方法,为嗜麦芽窄食单胞菌的快速检测提供一种新的方法。方法针对嗜麦芽窄食单胞菌16S ribosomal RNA基因设计的特异性引物,利用链置换DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)恒温反应60 min,通过实时检测荧光信号来检测嗜麦芽窄食单胞菌16S ribosomal RNA基因的扩增。结果筛选实验发现:在使用引物4时,出峰时间最短,故选择引物4进行后续实验操作。在11株相关菌株的检测中,除嗜麦芽窄食单胞菌出现很好的阳性外,其余菌株均为阴性。本研究检测嗜麦芽窄食单胞菌DNA的灵敏度可达到4.07×10-5ng/μL。重复性分析表明:同一样品重复检测3次,几乎同时出峰,扩增曲线几乎重叠,说明Real Amp的重复性良好。结论嗜麦芽窄食单胞菌的Real Amp检测方法稳定性高,反应快速,特异性强,具有较大的推广及应用前景,可用于嗜麦芽窄食单胞菌的快速检测。

荧光环介导恒温扩增技术检测嗜肺军团菌方法的建立

目的探讨利用环介导恒温扩增技术(LAMP)建立可以准确快速检测嗜肺军团菌的方法。方法选取嗜肺军团菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞杆菌、大肠埃希氏菌、阪崎肠杆菌、单核细胞增生李斯特氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、福氏志贺氏菌、副溶血性弧菌菌株,根据嗜肺军团菌毒力mip基因的6个特殊区域,使用Primer Explorer Version 4软件设计LAMP引物(mip-1、mip-2、mip-3),提取病原菌基因组DNA进行LAMP,评价其特异性、最低检测限和稳定性。结果筛选出mip-3引物在测定嗜肺军团菌的LAMP反应体系中扩增约10min出峰且峰值较高;非嗜肺军团菌菌株没有扩增反应;LAMP检测限可达100fg/μL;mip-3引物在10次重复检测中几乎同时出峰,稳定性良好。结论建立的LAMP检测方法具有特异性强、稳定性高特点,能快速、准确检测出嗜肺军团菌,具有较大的推广及应用前景。

山羊支原体山羊肺炎亚种可视化实时荧光LAMP检测方法的建立及应用

为建立快速简便、灵敏度高、特异性强的山羊支原体山羊肺炎亚种(Mccp)核酸快速检测方法,选择Mccp的92.1基因序列为靶序列,设计2条外引物、2条内引物和2条环引物,并向反应体系中添加可视化染料羟基溴酚蓝(HNB)或荧光染料(Eva green),分别建立Mccp可视化环介导恒温扩增(V-LAMP)和实时荧光环介导恒温扩增(RF-LAMP)检测方法,并对比两种方法的敏感性、特异性、重复性以及两种方法在山羊组织样品中的检测效果。结果显示,两种方法均可检出1.0×10 copies/μL的核酸标准品,灵敏度高;与其他支原体及细菌,如丝状支原体山羊亚种、绵羊肺炎支原体、多杀性巴氏杆菌、肺炎克雷伯菌等类症病原体,均无交叉反应;V-LAMP、RF-LAMP的变异系数均小于1%;对人工感染的试验样品和临床样品进行检测,两种检测方法结果一致,阳性率为9.09%,并且与实时定量PCR检测结果一致。本试验建立的V-LAMP和RF-LAMP为Mccp流行病学调查和疾病诊断提供了新的临床快速检测方法。