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H3、H9亚型禽流感病毒双重荧光定量PCR方法的建立及初步应用 被引量:7
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作者 申伟霞 田巧珍 +7 位作者 陈圆 胡涛 闫丽萍 李国新 李雪松 滕巧泱 赵宇军 李泽君 《中国动物传染病学报》 CAS 2014年第1期16-24,共9页
虽然H3、H9亚型禽流感病毒(Avian influenza virus, AIV)是低致病性禽流感病毒,但其具有跨宿主感染哺乳动物的能力,对社会公共卫生安全具有重大的潜在危害,因而对这些亚型病毒的监测极其重要。通过比对GenBank上H3、H9亚型禽流感病... 虽然H3、H9亚型禽流感病毒(Avian influenza virus, AIV)是低致病性禽流感病毒,但其具有跨宿主感染哺乳动物的能力,对社会公共卫生安全具有重大的潜在危害,因而对这些亚型病毒的监测极其重要。通过比对GenBank上H3、H9亚型禽流感病毒HA基因序列,设计了分别针对H3 AIV和H9 AIV的特异性探针。特异性试验和标准曲线试验的结果显示,这两个探针仅分别特异性识别H3、H9亚型AIV,且具有较好的扩增效率。通过重组质粒pMD19-T-H3HA和pMD19-T-H9HA 10倍梯度稀释液为模板,进行敏感性实验。结果表明,本研究所建立的荧光定量PCR方法能检测到100个DNA拷贝数H3 AIV和10个DNA拷贝数的H9 AIV,比传统PCR方法敏感性分别提高了100倍和1000倍。此外,本方法还能检测到10 EID50的H3亚型AIV或H9亚型AIV,比传统PCR方法检测敏感性均提高了1000倍。批间和批内试验的变异系数均小于3%,表明本研究建立的方法具有较好的重复性。此外,与传统PCR方法相比,用H3、H9亚型AIV双重荧光定量PCR方法检测人工感染动物的肺组织时,针对H3 AIV的敏感性提高了10~100倍,针对H9 AIV的敏感性提高了100倍。综上所述,本研究所建立的H3、H9亚型禽流感病毒双重荧光定量PCR方法具有较高的特异性和敏感性,对H3、H9亚型禽流感病毒监测具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 H3 H9 禽流感病毒
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乙型肝炎病毒SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法的建立及临床应用 被引量:6
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作者 何维娜 吕东月 +3 位作者 刘和录 韩杰辉 何玥 李培培 《现代检验医学杂志》 CAS 2016年第3期98-101,共4页
目的建立 SYBR Green I实时荧光定量 PCR检测乙型肝炎病毒 DNA的快速方法,并探讨其临床应用价值。方法根据GenBank公布的Hepatitis B virus gp1基因序列设计引物,建立SYBR Green I实时荧光定量PCR,并对反应体系和扩增程序进行优化。... 目的建立 SYBR Green I实时荧光定量 PCR检测乙型肝炎病毒 DNA的快速方法,并探讨其临床应用价值。方法根据GenBank公布的Hepatitis B virus gp1基因序列设计引物,建立SYBR Green I实时荧光定量PCR,并对反应体系和扩增程序进行优化。定量标准品通过基因克隆方法获得,同时以浙江省夸克公司 HBV DNA定量检测试剂盒作对照,应用于随机选取的100份乙型肝炎患者血清检测。结果 SYBR Green I 实时荧光定量 PCR 检出限范围为5&#215;102 copies/ml~5&#215;108 copies/ml,HBV DNA浓度与CT值有良好线性关系,无交叉反应,整个过程仅需2.5 h。在随机抽取的100份临床标本应用中,与浙江省夸克公司的 HBV荧光定量 PCR检测试剂相比,建立的 SYBR Green I实时荧光定量PCR体系灵敏度100%,特异度92.5%。结论 SYBR Green实时荧光定量PCR快速、简便、灵敏度高、特异度强,可用于乙型肝炎患者病情监测,有效指导临床用药,准确评价 HBV感染者的病情。 展开更多
关键词 SYBR Green I实时荧光PCR 乙型肝炎病毒DNA 快速检测 公司产品对比
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实时荧光定量PCR检测皱纹盘鲍Δ5脂肪酸去饱和酶基因表达方法的建立及应用 被引量:2
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作者 李明珠 麦康森 +3 位作者 何艮 艾庆辉 徐玮 张文兵 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期328-334,共7页
研究以皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai Ino)体内存在的2条Δ5 Fad(Hdhfad1和Hdhfad2)为目的基因,β-肌动蛋白(β-actin)和核糖体蛋白S9(Ribosomal protein S9,RPS9)为内参基因,应用2–ΔΔCt方法建立了实时荧光定量PCR(Real-Time quan... 研究以皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai Ino)体内存在的2条Δ5 Fad(Hdhfad1和Hdhfad2)为目的基因,β-肌动蛋白(β-actin)和核糖体蛋白S9(Ribosomal protein S9,RPS9)为内参基因,应用2–ΔΔCt方法建立了实时荧光定量PCR(Real-Time quantitative PCR,RT-qPCR)检测体系,并应用此体系分析了鲍鱼肌肉组织Δ5 Fad在不同饲料处理下的表达差异。实验饲料含有不同的脂肪源,分别是棕榈酸甘油酯(Tripalmitin,TP饲料)、富含二十碳四烯酸(Arachidonic acid,ARA)的油脂(AO饲料)和富含二十碳五烯酸(Eicosapentaenoic acid,EPA)的油脂(EO饲料)。结果表明:针对Hdhfad1、Hdhfad2、β-actin和RPS9所设计的引物特异性强。各引物对的PCR扩增效率(Efficiency,E)分别为1.05、0.99、0.97和0.98,满足2–ΔΔCt方法对E的要求。当退火温度为52℃,反应体积为25μL时,RT-qPCR的扩增效果最好。所建立的体系能够准确定量Δ5 Fad的基因表达。利用该方法分析Δ5 Fad在不同饲料处理下的表达结果显示,与TP对照组相比,EO和AO饲料显著降低了鲍鱼肌肉组织Δ5 Fad(Hdhfad1和Hdhfad2)的表达量。 展开更多
关键词 脂肪酸去饱和酶 鲍鱼 基因表达
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鹿布鲁氏菌实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:3
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作者 郝俊伟 张云 +6 位作者 杨宇航 刘红娜 王文玉 张秀丽 时坤 李建明 杜锐 《中国动物检疫》 CAS 2014年第2期71-76,共6页
本研究依据布鲁氏菌的特异性基因Omp25c的部分片段作为靶基因,设计探针引物,且优化了反应体系,筛选出引物、探针的最优浓度配比。将扩增产物连接到PGEM-T载体上,制备标准品及标准曲线,建立鹿布鲁氏菌荧光定量PCR检测方法,并对其特异性... 本研究依据布鲁氏菌的特异性基因Omp25c的部分片段作为靶基因,设计探针引物,且优化了反应体系,筛选出引物、探针的最优浓度配比。将扩增产物连接到PGEM-T载体上,制备标准品及标准曲线,建立鹿布鲁氏菌荧光定量PCR检测方法,并对其特异性、稳定性、敏感性进行评价。由标准曲线可知该方法的最低检测浓度可达到36拷贝/μL,比常规PCR灵敏度高出很多。 展开更多
关键词 鹿 布鲁氏菌
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多通道Taqman-探针荧光定量PCR鉴定MRSA方法的建立
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作者 陈昌国 李艳君 +5 位作者 郭建巍 陈秋圆 刘敏 马志家 郝秀红 赵强元 《现代检验医学杂志》 CAS 2016年第3期22-25,共4页
目的建立基于mec A/nuc/fem B三基因联合的 Taqman-探针荧光定量 PCR鉴定耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的方法。方法以常规检验标本中分离和采用 VITEK 2 Compact微生物分析仪鉴定为凝固酶阳性的 MRSA为研究对象,通过PrimerPremi... 目的建立基于mec A/nuc/fem B三基因联合的 Taqman-探针荧光定量 PCR鉴定耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的方法。方法以常规检验标本中分离和采用 VITEK 2 Compact微生物分析仪鉴定为凝固酶阳性的 MRSA为研究对象,通过PrimerPremier5.0和Beacon Designer 7软件设计针对mec A/nuc/fem B特异性PCR引物及Taqman荧光探针,荧光探针5’端分别采用 FAM,HEX及 ROX标记,3’端采用BHQ1标记,在荧光定量PCR仪进行检测。结果①1 g/dl凝胶电泳结果显示mec A/nuc/fem B三个基因引物特异性较好,扩增出的条带分子量与预期分子量一致且未见非特异性扩增;②在单管单通道及单管多通道的 PCR检测中 mec A/nuc/fem B均获得特异性扩增,且三个基因在单管多通道的PCR扩增效果与单管单通道的相类似。结论成功建立了多通道 Taqman-探针荧光定量 PCR鉴定 MRSA的方法, mec A/nuc/fem B三种基因联合检测可有效区分凝固酶阴性和阳性的 MRSA,提高鉴定 MRSA的准确率。 展开更多
关键词 Taqman-探针 耐甲氧西里金黄色葡萄球菌 基因 联合检测
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不同荧光定量PCR对于HBVcccDNA水平的检测差异对比
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作者 肖春花 张春兰 +1 位作者 陈伟烈 魏绍静 《安徽医药》 CAS 2015年第6期1103-1106,共4页
目的研究对比不同荧光定量聚合酶链反应PCR对于乙型肝炎病毒HBVccc DNA水平的检测差异。方法选择20例从2007—2008年在广州市第八人民医院接受住院治疗的乙肝患者作为研究对象。提取其血清及肝组织进行实验分析,另取2份不含HBV感染的患... 目的研究对比不同荧光定量聚合酶链反应PCR对于乙型肝炎病毒HBVccc DNA水平的检测差异。方法选择20例从2007—2008年在广州市第八人民医院接受住院治疗的乙肝患者作为研究对象。提取其血清及肝组织进行实验分析,另取2份不含HBV感染的患者血清和肝组织作阴性对照组。将其中经或未经脱氧核糖核酸酶DNase处理的样本分别使用HBVccc DNA跨单缺口PCR和跨双缺口PCR检测。分析Taq Man探针跨单缺口PCR测定HBVccc DNA的结果,对比跨单、双缺口PCR测定结果以及不同荧光定量PCR的测定结果。分析血清和肝组织中HBVDNA与HBVccc DNA病毒载量的关系。结果血清及肝组织经过DNase消化后的有关拷贝数显著低于未消化者。血清和肝组织跨双缺口PCR测定结果较跨单缺口PCR测定结果均显著降低。血清中的HBVDNA及ccc DNA实验结果均显著低于在肝组织中的测定结果,差异均有统计学意义(均P<0.05)。阴性对照组经四种荧光定量PCR检测后均呈阴性。20例E抗原呈阳性的乙肝病人,其机体病毒载量总体趋势为血清HBVDNA的载量较肝组织更低,差异显著。结论 DNase可有效减少HBVccc DNA在检测过程中的假阳性情况,经DNase处理后的跨双缺口PCR检测特异性最高。同时,血清中基本不含ccc DNA。 展开更多
关键词 荧光PCR HBVcccDNA水平 检测差异 对比
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荧光定量PCR检测志贺菌方法的建立 被引量:1
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作者 高春燕 高庆双 +3 位作者 刘树平 许林骥 王晶晶 郑建霞 《转化医学电子杂志》 2014年第4期38-40,共3页
目的:建立一种检测志贺菌属快速敏感的荧光定量PCR方法.方法:根据志贺菌属侵袭性质粒抗原H (ipaH)编码基因序列,设计1对PCR引物特异性靶基因片段,通过检测3株志贺菌属菌株和9株非志贺菌属菌株来评价该方法的特异性;对福氏志贺... 目的:建立一种检测志贺菌属快速敏感的荧光定量PCR方法.方法:根据志贺菌属侵袭性质粒抗原H (ipaH)编码基因序列,设计1对PCR引物特异性靶基因片段,通过检测3株志贺菌属菌株和9株非志贺菌属菌株来评价该方法的特异性;对福氏志贺菌菌液做一系列10倍稀释后进行荧光定量PCR分析敏感性,PCR 扩增产物经电泳和测序鉴定.结果:3株志贺菌属菌株出现特定大小的目的条带,9株非志贺菌属菌株未出现目的条带;测序也证实了PCR产物的特异性;荧光定量PCR检测福氏志贺菌ipaH基因的下限为200拷贝/mL.结论:本研究建立的方法快速、特异、敏感. 展开更多
关键词 志贺菌属
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实时荧光定量PCR在食品致病菌及转基因成分检测中应用 被引量:1
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作者 卢付青 唐善虎 +2 位作者 白菊红 闫利国 水旭亭 《粮食与油脂》 北大核心 2014年第12期16-19,共4页
与传统定性PCR技术相比,实时荧光定量PCR有更多的优点,其速度快,特异性更强、灵敏度更高、无污染性、自动化水平高等,且能对DNA模板进行定量。本文综述了实时荧光定量PCR技术原理、分类及其应用,并对其存在的问题和发展前景进行了展望。
关键词 致病菌 转基因成分 原理 应用
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应用荧光定量RT-PCR检测J亚群禽白血病病毒 被引量:4
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作者 屈素洁 邹联斌 +6 位作者 陈芳芳 张步娴 胡杰 莫胜兰 施开创 李军 尹彦文 《中国动物检疫》 CAS 2015年第6期56-59,63,共5页
针对J亚群禽白血病病毒(ALV-J)基因序列保守区域设计一对特异性引物和一条特异性探针,通过构建重组阳性标准质粒作为阳性标准品,建立了检测ALV-J核酸的荧光定量PCR方法。优化反应体系和条件后进行特异性、敏感性、重复性试验。结果显示... 针对J亚群禽白血病病毒(ALV-J)基因序列保守区域设计一对特异性引物和一条特异性探针,通过构建重组阳性标准质粒作为阳性标准品,建立了检测ALV-J核酸的荧光定量PCR方法。优化反应体系和条件后进行特异性、敏感性、重复性试验。结果显示,该检测方法特异性强,与其它禽源病毒如A亚群禽白血病病毒(ALV-A)、B亚群禽白血病病毒(ALV-B)、新城疫病毒(NDV)、禽流感病毒(AIV)、鸡传染性贫血病毒(CIAV)和马立克病病毒(MDV)均不发生交叉反应;该方法可检测到3.2×102拷贝/μL的病毒核酸,与常规RT-PCR相比,敏感性高100倍;重复性试验的变异系数小于2%。研究结果表明,建立的Real-time RT-PCR检测方法特异性强、灵敏度高、可重复性好,可用于ALV-J的定量检测。 展开更多
关键词 J亚群禽白血病病毒 TAQMAN探针
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水杨基荧光酮─CTMAB荧光熄灭法测定痕量锰的研究
10
作者 郭智煊 黄宁芳 夏道沛 《冶金分析》 CAS CSCD 北大核心 1995年第1期42-43,共2页
水杨基荧光酮─CTMAB荧光熄灭法测定痕量锰的研究郭智煊,黄宁芳,夏道沛(中国地质大学应化系,武汉,430074)有关水杨基荧光酮(SAF)与金属离子的研究已有不少报道[1,2]。本文用荧光熄灭法详细研究了Mn(Ⅱ)... 水杨基荧光酮─CTMAB荧光熄灭法测定痕量锰的研究郭智煊,黄宁芳,夏道沛(中国地质大学应化系,武汉,430074)有关水杨基荧光酮(SAF)与金属离子的研究已有不少报道[1,2]。本文用荧光熄灭法详细研究了Mn(Ⅱ)─SAF─CTMAB体系的最佳测定... 展开更多
关键词 水杨基荧光 荧光熄灭法痕 测定
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急性心肌梗死患者血浆游离线粒体DNA拷贝数定量分析及临床意义 被引量:5
11
作者 周双艳 杜建明 +2 位作者 杜怡清 赵克斌 杨泽华 《检验医学与临床》 CAS 2017年第9期1268-1270,共3页
目的探究急性心肌梗死(AMI)后血浆游离线粒体DNA拷贝数变化及其临床意义。方法采集50例健康体检者血浆标本为对照组,50例AMI患者为AMI组,应用荧光定量PCR法测定其循环游离线粒体DNA拷贝数。结果对照组血浆游离线粒体DNA拷贝数为4×1... 目的探究急性心肌梗死(AMI)后血浆游离线粒体DNA拷贝数变化及其临床意义。方法采集50例健康体检者血浆标本为对照组,50例AMI患者为AMI组,应用荧光定量PCR法测定其循环游离线粒体DNA拷贝数。结果对照组血浆游离线粒体DNA拷贝数为4×10~4(2.5×10~4,9.5×10~4)copies/mL;AMI组血浆游离线粒体DNA拷贝数为2.2×10~5(4.9×10~5,0.8×10~5)copies/mL,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 AMI患者血浆游离线粒体DNA拷贝数升高,血浆游离线粒体DNA拷贝数检测可能成为辅助诊断心肌梗死的生物学标志。 展开更多
关键词 急性心肌梗死 线粒体DNA 荧光PCR
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银屑病患者应用5-氨基乙酰丙酸后的荧光异质性:一项免疫组化研究
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作者 Kleinpenning M.M. Smits T. +1 位作者 Ewalds E. 党倩丽 《世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册)》 2006年第12期5-5,共1页
Background: Psoriasis has been shown to highly accumulate protoporphyrin IX (PpIX), but a variable distribution within plaques after fluorescence diagnosis is seen. It is unknown what causes this heterogeneity of fluo... Background: Psoriasis has been shown to highly accumulate protoporphyrin IX (PpIX), but a variable distribution within plaques after fluorescence diagnosis is seen. It is unknown what causes this heterogeneity of fluorescence in psoriatic skin, despite adequate keratolytic treatment. Variations in fluorescence might explain the variable and the mostly partial clinical response of psoriasis seen after photodynamic therapy (PDT).Objectives: This study examines morphological and immunohistochemical differences in inhomogeneous PpIX-induced fluorescence in stable plaque psoriasis. Materials and methods: Fourteen patients with stable plaque psoriasis were included in this study. In each patient one psoriatic plaque was incubated with 20%5-aminolaevulinic acid (ALA) ointment for 3 h after keratolytic treatment. Fluorescence diagnosis with ALA induced porphyrins (FDAP) was performed and subsequently high-and low-fluorescent psoriatic skin samples were biopsied. Biopsies were investigated with respect to histologicalhyperkeratosis (thickness of stratum corneum), proliferation (Ki-67 antigen), keratinization (K10, filaggrin) and inflammation (CD3). Digital images acquired with FDAP were analysed using image analysis software. Results: Inhomogeneous fluorescence was seen in 12 of the 14 plaques. A significantly thicker stratum corneum was found in low-fluorescent psoriatic skin compared with highly fluorescent skin. Fluorescence intensity and thickness of the stratum corneum proved to be negatively correlated. The variable-fluorescent parts of the lesional psoriatic skin showed no differences in epidermal proliferation, keratinization or inflammation. Conclusions: Heterogeneous ALA-induced fluorescence in psoriasis plaques related to inhomogeneous distribution of PpIX in the epidermis may result from differences in penetration of ALA and/or light within a plaque caused by differences in stratum corneum thickness. The variable clinical response seen after PDT in psoriasis could be explained by this. These findings are consistent with the general assumption that optimal desquamation prior to FDAP or PDT is required for the most favourable results. 展开更多
关键词 银屑病 皮损 白疮 免疫组化 荧光量 异质性 患者 氨基乙酰丙酸
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From Phenotypes to Molecules: Revolutionizing Gut Microbiota Identification Methods
13
作者 WANG Xuan LV Chang-Long ZHAI Jing-Bo 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1065-1077,共13页
The gut microbiota is a complex ecosystem composed of many bacteria and their metabolites.It plays an irreplaceable role in human digestion,nutrient absorption,energy supply,fat metabolism,immune regulation,and many o... The gut microbiota is a complex ecosystem composed of many bacteria and their metabolites.It plays an irreplaceable role in human digestion,nutrient absorption,energy supply,fat metabolism,immune regulation,and many other aspects.Exploring the structure and function of the gut microbiota,as well as their key genes and metabolites,will enable the early diagnosis and auxiliary diagnosis of diseases,new treatment methods,better effects of drug treatments,and better guidance in the use of antibiotics.The identification of gut microbiota plays an important role in clinical diagnosis and treatment,as well as in drug research and development.Therefore,it is necessary to conduct a comprehensive review of this rapidly evolving topic.Traditional identification methods cannot comprehensively capture the diversity of gut microbiota.Currently,with the rapid development of molecular biology,the classification and identification methods for gut microbiota have evolved from the initial phenotypic and chemical identification to identification at the molecular level.This review integrates the main methods of gut microbiota identification and evaluates their application.We pay special attention to the research progress on molecular biological methods and focus on the application of high-throughput sequencing technology in the identification of gut microbiota.This revolutionary method for intestinal flora identification heralds a new chapter in our understanding of the microbial world. 展开更多
关键词 gut microbiota 16S rRNA real-time fluorescent qPCR high-throughput sequencing mass spectrum
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磺化酞菁在甲醇-水溶液中的二聚作用研究(英文) 被引量:7
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作者 刘剑波 赵瑜 +4 位作者 张复实 赵福群 唐应武 宋心琦 姚光庆 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1996年第2期163-168,共6页
研究了不同磺化度的酞菁在甲醇-水混合溶剂中的聚集行为.通过紫外-可见光谱测定,发现磺化度在1.0以上时染料在稀溶液中主要以单体和二聚体的形式存在,并可用简便的方法计算出聚集平衡常数和平衡时单体所占的百分比,得到磺化度越... 研究了不同磺化度的酞菁在甲醇-水混合溶剂中的聚集行为.通过紫外-可见光谱测定,发现磺化度在1.0以上时染料在稀溶液中主要以单体和二聚体的形式存在,并可用简便的方法计算出聚集平衡常数和平衡时单体所占的百分比,得到磺化度越低越易聚集的结论.有关激发态的实验表明,增加酞菁磺化度有助于提高表观荧光量子产率,但对荧光寿命影响较小. 展开更多
关键词 酞菁 磺化 二聚 磺化度 荧光量产率 染料
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嗜热四膜虫两类不同金属硫蛋白的功能补偿分析 被引量:5
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作者 卢剑功 许静 +1 位作者 张鹏幸 王伟 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期249-256,共8页
为了分析嗜热四膜虫两类金属硫蛋白之间的关系,研究分别构建了MTT1-MTT3和MTT2-MTT4的基因敲除载体,通过同源重组获得敲除大核MTT1-MTT3和MTT2-MTT4的两种嗜热四膜虫突变体细胞株△MTT1-MTT3和△MTT2-MTT4。两种突变体细胞株暴露在Cd2+... 为了分析嗜热四膜虫两类金属硫蛋白之间的关系,研究分别构建了MTT1-MTT3和MTT2-MTT4的基因敲除载体,通过同源重组获得敲除大核MTT1-MTT3和MTT2-MTT4的两种嗜热四膜虫突变体细胞株△MTT1-MTT3和△MTT2-MTT4。两种突变体细胞株暴露在Cd2+、Cu2+和H2O2的生长表现出显著不同,△MTT1-MTT3突变体细胞对Cd2+的耐受性显著下降,而△MTT2-MTT4突变体细胞对Cu2+和H2O2的耐受性均显著下降。实时荧光定量PCR分析不同突变体中其他MTT基因的表达变化,在△MTT2-MTT4突变体细胞株中,MTT5的表达水平下调,在500μmol/L Cu2+处理后,△MTT2-MTT4突变体细胞中MTT1、MTT3和MTT5表达相对野生型分别上调6.1、9.5和8.5倍。在△MTT1-MTT3突变体细胞中,MTT2、MTT4和MTT5的表达水平下调,当5μmol/L Cd2+处理后,△MTT1-MTT3突变体细胞株MTT5表达水平相对野生型上调2.9倍,而MTT2和MTT4表达水平相对野生型分别下降了4.9倍和2.5倍。结果表明嗜热四膜虫中的金属硫蛋白MTT1、MTT3和MTT5主要参与细胞的重金属解毒功能;而MTT2和MTT4主要参与细胞内正常的新陈代谢功能,不同的金属硫蛋白基因之间的表达存在相互调控和功能补偿。 展开更多
关键词 嗜热四膜虫 金属硫蛋白 基因敲除
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贵州地方猪骨骼肌中3种microRNAs的表达差异 被引量:3
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作者 刘畅 罗志宇 +1 位作者 冉雪琴 王嘉福 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2014年第3期112-116,共5页
为探明miR-1、miR-133、miR-206基因在不同品种猪肌肉组织中的表达及其与屠宰性能间的关系,以6月龄大白猪、糯谷猪、关岭猪及黔南黑猪的背最长肌为材料,采用实时荧光定量PCR方法,研究了3种microRNAs(miRNAs)在贵州地方猪种和大白猪背最... 为探明miR-1、miR-133、miR-206基因在不同品种猪肌肉组织中的表达及其与屠宰性能间的关系,以6月龄大白猪、糯谷猪、关岭猪及黔南黑猪的背最长肌为材料,采用实时荧光定量PCR方法,研究了3种microRNAs(miRNAs)在贵州地方猪种和大白猪背最长肌中的表达差异。结果表明:成年期miR-133的表达量高于另外2种miRNA分子。miR-133在糯谷猪中的表达量是大白猪的1.58倍(P<0.05),与其眼肌面积、花油重高度负相关,与屠宰率高度正相关。miR-206在糯谷猪中的表达量是大白猪的2.23倍(P<0.05),与其瘦肉率高度负相关,与板油重中度正相关。在关岭猪背最长肌中miR-133的表达量最高,是大白猪的2.67倍(P<0.05),miR-133和miR-206的表达量与眼肌面积、胴体重高度正相关,与花油重、板油重和脂肪比负相关;但miR-206的表达量明显低于其他猪种。不同品种猪中miR-133和miR-206存在差异表达,对地方猪品种的骨骼肌生长和脂肪沉积有一定的调节作用。 展开更多
关键词 MIR-1 miR-133 miR-206 贵州地方猪种 MIR-1 miR-133 miR-206
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荧光定量RT-PCR检测柯萨奇病毒A组6和10型的方法建立及应用 被引量:4
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作者 苏旭 吕莉琨 +3 位作者 李力 杨东靖 李佳萌 谭昭麟 《国际病毒学杂志》 2015年第6期372-375,共4页
目的 建立柯萨奇病毒A组6(Coxsackievirus A6,CVA6)和10型(CVA10)的SYBRGreen Ⅰ荧光定量RT-PCR方法并进行评价及初步应用.方法 根据GenBank上的CVA6和CVA10序列,分别设计特异性引物,建立SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR方法体系,并分... 目的 建立柯萨奇病毒A组6(Coxsackievirus A6,CVA6)和10型(CVA10)的SYBRGreen Ⅰ荧光定量RT-PCR方法并进行评价及初步应用.方法 根据GenBank上的CVA6和CVA10序列,分别设计特异性引物,建立SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR方法体系,并分别进行灵敏度,重复性和特异性检测,然后利用该方法对649份2014年天津市未明确分型的肠道病毒阳性标本进行检测.结果 成功建立CVA6和CVA10的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR方法及定量标准曲线,其检出限均为101 copies/μL,重复性实验的变异系数均小于2%.该方法特异性强,与柯萨奇病毒(A组2、4、5、16型)、肠道病毒EV71型、诺如病毒、轮状病毒、麻疹病毒和乙型流感病毒均无交叉反应.利用该方法检测649份未分型标本,发现136份为CVA6阳性和174份为CVA10阳性,分别占未分型阳性标本的20.96%和26.81%.结论 本研究建立的检测CVA6和CVA10荧光定量RT-PCR方法灵敏度高、重复性好、特异性强,应用于2014年天津市手足口病监测,发现C VA6和CVA10已成为优势型病原体. 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A组6型 柯萨奇病毒A组10型 荧光RT-PCR
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Cloning of Rabbit Bone Morphogenetic Protein 15 and Its Expression During in vitro Maturation of Rabbit Oocytes 被引量:3
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作者 尹萍 季金强 +1 位作者 李霖 丁家桐 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期603-607,共5页
Partial cDNA sequence of rabbit BMP15 was cloned by RT-PCR from rabbit ovaries, showing a similarity of 83%-90% with the BMP15 nucleotide sequences in humans, mice, ovine, sheep, cows and pigs. The expression of BMP15... Partial cDNA sequence of rabbit BMP15 was cloned by RT-PCR from rabbit ovaries, showing a similarity of 83%-90% with the BMP15 nucleotide sequences in humans, mice, ovine, sheep, cows and pigs. The expression of BMP15 in rabbit cumulus-oocyte complexs during oocytes in vitro maturation (IVM) was measured by fluorescent quantitative RT-PCR method. BMP 15 was expressed at low levels in immature oocytes and increased to the highest level at 16h of IVM, which coincides with the time of cumulus cell expansion, then declined slowly under IVM cultivation. The expression pattern of BMP 15 suggested that it might be important in cumulus expansion in rabbits. 展开更多
关键词 RABBIT Bone morphogenetic protein 15 OOCYTE Gene cloning Fluorescent quantitative RT-PCR
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VEGFR-1和VEGFR-2在氧诱导视网膜病变小鼠视网膜中表达的变化 被引量:4
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作者 朱丹 新吉夫 郭凯 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期42-46,共5页
背景 早产儿视网膜病变(ROP)是氧动力学异常导致严重视网膜血管病变的致盲眼病.血管内皮生长因子(VEGF)在ROP发病机制中发挥重要作用,但VEGF受体(VEGFR)在ROP发病中的作用研究较少. 目的 研究不同鼠龄氧诱导视网膜病变(OIR)小... 背景 早产儿视网膜病变(ROP)是氧动力学异常导致严重视网膜血管病变的致盲眼病.血管内皮生长因子(VEGF)在ROP发病机制中发挥重要作用,但VEGF受体(VEGFR)在ROP发病中的作用研究较少. 目的 研究不同鼠龄氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠视网膜中VEGFR-1和VEGFR-2的表达变化.方法 将60只SPF级出生后7 d(P7)的C57BL/6J小鼠与哺乳母鼠一起在体积分数(75&#177;2)%O2条件下饲养5d,建立OIR小鼠模型(OIR组),以60只正常环境饲养的同品系同龄小鼠作为正常对照组.分别于P8、P11、P12、P13、P14、P18鼠龄时摘取2个组小鼠双侧眼球,制备视网膜切片,采用苏木精-伊红染色法检测小鼠视网膜血管的发育情况;采用实时荧光定量PCR法检测不同鼠龄小鼠视网膜中VEGFR-1和VEGFR-2 mRNA的相对表达水平;采用免疫组织化学法观察小鼠视网膜中VEGFR-1和VEGFR-2蛋白的表达.结果 组织病理学结果显示,OIR组P13、P14、P18小鼠有较多的血管内皮细胞核突破内界膜,光学显微镜下内界膜下的细胞增生,排列紊乱,视网膜表面或视网膜前有新生血管芽,但正常对照组各鼠龄小鼠视网膜结构正常.OIR组P12、P13、P14和P18小鼠视网膜中VEGFR-1 mRNA的平均相对表达水明显高于正常对照组,差异均有统计学意义(P=0.046、0.000、0.000、0.042);OIR组P8、P11、P12、P13、P14和P18小鼠视网膜中VEGFR-2mRNA的平均相对表达水平明显高于正常对照组,差异均有统计学意义(均P<O.01).两个组间P8、P11、P12、P13、P14、P18小鼠视网膜中VEGFR-1蛋白阳性表达强度的差异均无统计学意义(M=50.00、36.00、41.00、31.00、28.00、36.00,均P>0.05);正常对照组与OIR组间P8和P11小鼠视网膜中VEGFR-2蛋白阳性反应强度的差异无统计学意义(均P>0.05),正常对照组P12、P13小鼠视网膜中VEGFR-2蛋白的表达减弱,但OIR组同鼠龄小鼠视网膜中VEGFR-2蛋白的表达增强,2组间差异均有统计学意义(均P<0.01);2个组P14小鼠视网膜中VEGFR-2蛋白表达均明显增强,但OIR组的表达强度仍显著高于正常对照组,差异有统计学意义(P<0.01).正常对照组P18小鼠视网膜中VEGFR-2蛋白表达减弱,OIR组VEGFR-2表达强度达峰(M=20.11,P<0.01). 结论 VEGFR参与OIR小鼠视网膜新生血管的形成,VEGFR-2的促新生血管新生作用强于VEGFR-1. 展开更多
关键词 早产儿视网膜病变 氧诱导视网膜病变 血管内皮生长因子 受体 免疫组织化学 C57BL/6J小鼠
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Analysis of Seed-specificity of Silencing fad_2 Gene Expression in Transgenic Rapeseed Line W-4(Brassica napus L.) 被引量:3
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作者 陈松 彭琦 +5 位作者 周晓婴 高建芹 张维 张洁夫 浦惠明 戚存扣 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2014年第8期1308-1311,1316,共5页
This study was to investigate the efficiency and specificity of RNAi silencing on the expression of endogenous fad2 gene in transgenic line W-4. [Method] The relative expression of fad2 gene in seeds at different deve... This study was to investigate the efficiency and specificity of RNAi silencing on the expression of endogenous fad2 gene in transgenic line W-4. [Method] The relative expression of fad2 gene in seeds at different developmental stages of 7th, 14th, 21st and 28th day after flowering (DAF) as wel as the root, stem, leaf at winter seedling stages of both the transgenic line W-4 and non-transgenic control Westar by real-time fluorescence quantitative PCR. [Results] The results showed the relative expression of fad2 gene was gradual y increasing with the days after flowering in the seeds of the control Westar, while it was found decreasing significantly since the 21st DAF in the seeds of the line W-4. The decline was up to 60% in comparison with the control Westar. However, no significant difference in the relative expression of fad2 gene in other organs like root, stem and leaf was observed between transgenic line W-4 and non-transgenic control Westar. Fatty acid composition analysis showed the oleic acid desaturation parameter(ODP) in seeds of the line W-4 was 0.07 in average, decreased by nearly 75% than control Westar which was 0.24 in average, while no significant difference in the seedling root, stem and leaf was measured between transgenic rapeseed and control. [Conclusion] The results above validated that RNA interference in transgenic rapeseed W-4 is at a seed-specific manner, not interfering with fad2 gene expression in organs such as the root, stem and leaf. The study also found that the period of fad2 gene expres-sion decline was wel coincided with the expression of napin gene, both appeared at the 21st DAF, indicating that the expression of dsRNA of fad2 gene is precisely control ed by the napin promoter. 展开更多
关键词 Transgenic rapeseed Real-time fluorescence quantitative PCR fad2gene Specific expression
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