基于受体和配体的虚拟筛选整合平台研究

虚拟筛选是计算机辅助药物设计的最重要方法之一,可分为基于受体虚拟筛选和基于配体虚拟筛选两种方法.根据蛋白靶标结构是否已知,选择基于配体的虚拟筛选方法和基于受体的虚拟筛选方法进行筛选.近几年随着药物研究的新方法和新技术的发展,分子对接和药效团搜索,以及定量构效关系模型成为虚拟筛选的几个重要方法,目前已经有一些软件平台发布并且应用到虚拟筛选过程中.比如Dock6.5、Pharmar Gist、Autodock等等.该文整合并开发了一个既基于受体又可以基于配体进行虚拟筛选的平台,设计的总体思想是基于一个分子图形界面,整合Dock6.5、Pharmar Gist、聚类方法,以及定量关系模型等辅助软件,实现并完成了基于受体和配体的虚拟筛选流程.