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基于网络药理学和分子对接技术探讨药桑总黄酮治疗肝癌的作用机制
1
作者
张子豪
刘忠义
马红梅
《癌症进展》
2023年第18期1994-1998,2002,共6页
目的基于网络药理学和分子对接技术探讨药桑总黄酮治疗肝癌的作用机制。方法通过中国知网、万方数据知识服务平台、维普中文期刊服务平台、PubMed以及SwissADME等数据库预测并筛选药桑总黄酮活性成分及靶点信息。通过在线人类孟德尔遗...
目的基于网络药理学和分子对接技术探讨药桑总黄酮治疗肝癌的作用机制。方法通过中国知网、万方数据知识服务平台、维普中文期刊服务平台、PubMed以及SwissADME等数据库预测并筛选药桑总黄酮活性成分及靶点信息。通过在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和GeneCards数据库获取肝癌疾病靶点及药桑有效黄酮类成分与肝癌的交集基因,将交集基因导入STRING数据库后构建蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.9.1软件预测核心蛋白并构建“药物-药效成分-靶点”网络图。通过Metascape数据库和微生信对作用靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用AutoDockTools软件将核心成分与关键靶点进行分子对接。结果药桑有效黄酮类成分共21种,基于主要活性成分筛选获得293个靶点,肝癌疾病靶点8949个,取交集获得270个靶点,其中关键靶点为非受体酪氨酸激酶SRC、磷脂酰肌醇-3激酶调节亚基1(PIK3R1)、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、蛋白激酶B(AKT)、淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK)、表皮生长因子受体(EGFR)、Janus激酶2(JAK2)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、蛋白酪氨酸激酶2(PTK2)。飞燕草色素、木犀草素、山奈酚可能是药桑总黄酮治疗肝癌的关键成分。GO功能富集分析显示,交集基因主要参与蛋白质磷酸化、细胞对各物质的反应、酶活性、酶结合、蛋白质结合等。KEGG通路富集分析显示,磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/AKT、Ras、erb-b2受体酪氨酸激酶(ERBB)、细胞衰老等信号通路可能是药桑总黄酮治疗肝癌的重要信号通路。结论药桑总黄酮治疗肝癌的核心靶点是SRC、PIK3R1、PIK3CA、HSP90AA1、AKT等,药桑总黄酮可能通过多靶点、多成分、多途径治疗肝癌。
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关键词
药桑总黄酮
肝癌
网络
药
理学
分子对接技术
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题名
基于网络药理学和分子对接技术探讨药桑总黄酮治疗肝癌的作用机制
1
作者
张子豪
刘忠义
马红梅
机构
新疆医科大学中医学院
出处
《癌症进展》
2023年第18期1994-1998,2002,共6页
基金
新疆维吾尔自治区“十四五”重点学科(中医学)(1005)
新疆医科大学大学生创新创业训练计划项目(S202210760045)。
文摘
目的基于网络药理学和分子对接技术探讨药桑总黄酮治疗肝癌的作用机制。方法通过中国知网、万方数据知识服务平台、维普中文期刊服务平台、PubMed以及SwissADME等数据库预测并筛选药桑总黄酮活性成分及靶点信息。通过在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和GeneCards数据库获取肝癌疾病靶点及药桑有效黄酮类成分与肝癌的交集基因,将交集基因导入STRING数据库后构建蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.9.1软件预测核心蛋白并构建“药物-药效成分-靶点”网络图。通过Metascape数据库和微生信对作用靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用AutoDockTools软件将核心成分与关键靶点进行分子对接。结果药桑有效黄酮类成分共21种,基于主要活性成分筛选获得293个靶点,肝癌疾病靶点8949个,取交集获得270个靶点,其中关键靶点为非受体酪氨酸激酶SRC、磷脂酰肌醇-3激酶调节亚基1(PIK3R1)、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、蛋白激酶B(AKT)、淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK)、表皮生长因子受体(EGFR)、Janus激酶2(JAK2)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、蛋白酪氨酸激酶2(PTK2)。飞燕草色素、木犀草素、山奈酚可能是药桑总黄酮治疗肝癌的关键成分。GO功能富集分析显示,交集基因主要参与蛋白质磷酸化、细胞对各物质的反应、酶活性、酶结合、蛋白质结合等。KEGG通路富集分析显示,磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/AKT、Ras、erb-b2受体酪氨酸激酶(ERBB)、细胞衰老等信号通路可能是药桑总黄酮治疗肝癌的重要信号通路。结论药桑总黄酮治疗肝癌的核心靶点是SRC、PIK3R1、PIK3CA、HSP90AA1、AKT等,药桑总黄酮可能通过多靶点、多成分、多途径治疗肝癌。
关键词
药桑总黄酮
肝癌
网络
药
理学
分子对接技术
Keywords
total flavonoids of Morus nigra L.
liver cancer
network pharmacology
molecular docking technology
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接技术探讨药桑总黄酮治疗肝癌的作用机制
张子豪
刘忠义
马红梅
《癌症进展》
2023
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