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题名药物-疾病关系预测:一种推荐系统模型
被引量:6
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作者
汪浩
王海平
吴信东
刘琦
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机构
合肥工业大学计算机与信息学院
同济大学生命科学与技术学院
佛蒙特大学计算机系
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出处
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期1770-1774,共5页
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基金
国家自然科学基金资助项目(No 31100956,61173117)
国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(No2012AA020405)
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文摘
目的药物重定位是指发掘已有药物新的治疗作用,然而具有潜在治疗作用的药物-疾病往往隐藏在数以百万计的关系对中。该研究基于医疗大数据分析,预测具有潜在治疗关系的药物-疾病关系对。方法将社交网络中推荐系统模型应用于药物重定位研究,并假设具有相似化学结构的药物可能具有相似的适应症。从开源数据库收集已知药物-疾病的治疗关系、副作用关系以及药物和疾病特征描述符,计算得到药物-药物的相似度和疾病-疾病相似度,再构建推荐模型将上述信息融合,并预测具有潜在治疗关系的药物-疾病,最终得到预测关系对的排序列表。结果列表排名前500的关系对中,有12.8%得到临床实验支持或综述报道,20%得到模式生物实验或细胞实验支持。结论相比于已有分类模型和随机抽样结果,本模型可明显提高具有潜在治疗作用药物-疾病的富集程度。
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关键词
药物重定位
医药大数据
推荐系统
相似性度量
协同过滤
药物和疾病关系预测
机器学习
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Keywords
drug repositioning
biomedical big data
recommendation system
similarity measures
collaborative filtering
drugdisease relationships prediction
machine learning
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分类号
R-05
[医药卫生]
R195
[医药卫生—卫生统计学]
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