约有100家德国制药公司签约参加新的药物警戒文献搜索数据库Vigilit,提供不良药物事件(ADR)最新的有关药物安全性的参考文献及定期的最新安全性报告(PSUR)。该数据库是由Yes Pharma ceutical Development Service与德国制药业协会BAH...约有100家德国制药公司签约参加新的药物警戒文献搜索数据库Vigilit,提供不良药物事件(ADR)最新的有关药物安全性的参考文献及定期的最新安全性报告(PSUR)。该数据库是由Yes Pharma ceutical Development Service与德国制药业协会BAH合作经办的,迄今已有约165种活性物质及50种草药的信息。展开更多
药物靶标作用关系预测是一种重要的辅助药物研发手段,而生物实验验证药物靶标作用关系耗钱耗时,因此,在数据库中查询验证预测的药物靶标作用关系是对预测方法的重要评价.基于KEGG,DrugBank,ChEMBL这3个数据库,利用爬虫获取信息的方式设...药物靶标作用关系预测是一种重要的辅助药物研发手段,而生物实验验证药物靶标作用关系耗钱耗时,因此,在数据库中查询验证预测的药物靶标作用关系是对预测方法的重要评价.基于KEGG,DrugBank,ChEMBL这3个数据库,利用爬虫获取信息的方式设计开发了药物靶标作用关系查询验证方法DTcheck(drug-target check),实现了对于提供KEGG DRUG ID及KEGG GENES ID的药物靶标对的高效查询验证功能,并利用DTcheck分别为Enzyme,IC(ion channel),GPCR(G-protein-coupled receptor),NR(nuclear receptor)四个标准数据集扩充新增药物靶标作用关系907,766,458,40对.此外,结合DTcheck查询验证,以BLM(bipartite local models)方法为例分析了预测结果的评价问题,结果表明,采用AUC(area under curve)值评价药物靶标作用关系预测方法没有Top N 评价合理,且AUC值低的BLMd方法在预测新的药物靶标作用关系时优于AUC值高的BLMmax方法.展开更多
文摘约有100家德国制药公司签约参加新的药物警戒文献搜索数据库Vigilit,提供不良药物事件(ADR)最新的有关药物安全性的参考文献及定期的最新安全性报告(PSUR)。该数据库是由Yes Pharma ceutical Development Service与德国制药业协会BAH合作经办的,迄今已有约165种活性物质及50种草药的信息。
文摘药物靶标作用关系预测是一种重要的辅助药物研发手段,而生物实验验证药物靶标作用关系耗钱耗时,因此,在数据库中查询验证预测的药物靶标作用关系是对预测方法的重要评价.基于KEGG,DrugBank,ChEMBL这3个数据库,利用爬虫获取信息的方式设计开发了药物靶标作用关系查询验证方法DTcheck(drug-target check),实现了对于提供KEGG DRUG ID及KEGG GENES ID的药物靶标对的高效查询验证功能,并利用DTcheck分别为Enzyme,IC(ion channel),GPCR(G-protein-coupled receptor),NR(nuclear receptor)四个标准数据集扩充新增药物靶标作用关系907,766,458,40对.此外,结合DTcheck查询验证,以BLM(bipartite local models)方法为例分析了预测结果的评价问题,结果表明,采用AUC(area under curve)值评价药物靶标作用关系预测方法没有Top N 评价合理,且AUC值低的BLMd方法在预测新的药物靶标作用关系时优于AUC值高的BLMmax方法.