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基于多通路神经网络模型预测药物敏感性响应
1
作者
李晴
闫效莺
靳艳春
《信息技术与信息化》
2024年第5期19-22,共4页
准确预测药物敏感性响应是当前个性化治疗的关键。利用深度学习强大的特征学习能力,提出一种基于多通道神经网络模型的预测方法。首先,采用深度学习算法对细胞系的多组学特征分别处理,采用多个图神经网络模块提取药物分子图的多级子结...
准确预测药物敏感性响应是当前个性化治疗的关键。利用深度学习强大的特征学习能力,提出一种基于多通道神经网络模型的预测方法。首先,采用深度学习算法对细胞系的多组学特征分别处理,采用多个图神经网络模块提取药物分子图的多级子结构特征;然后,引入共同注意力机制评价各通路特征组合对药物-细胞系敏感性响应的影响,优化细胞系和药物特征;最后,通过深层神经网络模型预测。通过基于GDSC和CCLE数据集的测试,并与RefDNN、DeepCDR和GraphCDR算法进行比较,验证算法性能。
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关键词
深度学习
药物-细胞系敏感性
基因表达
图同构网络
共同注意力
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题名
基于多通路神经网络模型预测药物敏感性响应
1
作者
李晴
闫效莺
靳艳春
机构
西安石油大学
出处
《信息技术与信息化》
2024年第5期19-22,共4页
基金
陕西省自然科学基础研究计划“可解释多通道药物响应预测模型研究及其在肺癌中的应用”(2023-JC-YB-591)
西安石油大学研究生创新与实践能力培养计划项目(YCS23213172)。
文摘
准确预测药物敏感性响应是当前个性化治疗的关键。利用深度学习强大的特征学习能力,提出一种基于多通道神经网络模型的预测方法。首先,采用深度学习算法对细胞系的多组学特征分别处理,采用多个图神经网络模块提取药物分子图的多级子结构特征;然后,引入共同注意力机制评价各通路特征组合对药物-细胞系敏感性响应的影响,优化细胞系和药物特征;最后,通过深层神经网络模型预测。通过基于GDSC和CCLE数据集的测试,并与RefDNN、DeepCDR和GraphCDR算法进行比较,验证算法性能。
关键词
深度学习
药物-细胞系敏感性
基因表达
图同构网络
共同注意力
分类号
TP183 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
R9 [医药卫生—药学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于多通路神经网络模型预测药物敏感性响应
李晴
闫效莺
靳艳春
《信息技术与信息化》
2024
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