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云南萝芙木异胡豆苷合成酶基因的克隆与分析
被引量:
8
1
作者
许若娴
曹福祥
+1 位作者
彭继庆
司书斌
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期128-131,共4页
以云南萝芙木叶片为材料,通过RT-PCR方法首次克隆了云南萝芙木萜类吲哚生物碱(terpenoid indole alkaloids,TIAs)次生代谢的合成途径中重要的限速酶——异胡豆苷合成酶(strictosidine synthase,STR)的基因并进行了生物信息学分析。生物...
以云南萝芙木叶片为材料,通过RT-PCR方法首次克隆了云南萝芙木萜类吲哚生物碱(terpenoid indole alkaloids,TIAs)次生代谢的合成途径中重要的限速酶——异胡豆苷合成酶(strictosidine synthase,STR)的基因并进行了生物信息学分析。生物信息学分析表明,该基因的编码区长度为1 038 bp,编码345个氨基酸的多肽,等电点为5.06,N-端有一长度为27个氨基酸参与分泌的信号肽。二级结构预测指出,延伸链和不规则盘绕是STR蛋白质最大量的结构元件,而α-螺旋和β-转角则散布于整个蛋白质。同源性分析则表明,云南萝芙木中的STR和其它植物来源的STR同源,使用MEGA5.1构建了植物的STR分子系统进化树。
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关键词
云南萝芙木
萜类引哚生物碱
异胡豆苷合成酶
RT-PCR
生物
信息学分析
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职称材料
题名
云南萝芙木异胡豆苷合成酶基因的克隆与分析
被引量:
8
1
作者
许若娴
曹福祥
彭继庆
司书斌
机构
中南林业科技大学
出处
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期128-131,共4页
基金
云南2007年度产业化重大关键技术开发项目[云发改高科(2007)1718号]
文摘
以云南萝芙木叶片为材料,通过RT-PCR方法首次克隆了云南萝芙木萜类吲哚生物碱(terpenoid indole alkaloids,TIAs)次生代谢的合成途径中重要的限速酶——异胡豆苷合成酶(strictosidine synthase,STR)的基因并进行了生物信息学分析。生物信息学分析表明,该基因的编码区长度为1 038 bp,编码345个氨基酸的多肽,等电点为5.06,N-端有一长度为27个氨基酸参与分泌的信号肽。二级结构预测指出,延伸链和不规则盘绕是STR蛋白质最大量的结构元件,而α-螺旋和β-转角则散布于整个蛋白质。同源性分析则表明,云南萝芙木中的STR和其它植物来源的STR同源,使用MEGA5.1构建了植物的STR分子系统进化树。
关键词
云南萝芙木
萜类引哚生物碱
异胡豆苷合成酶
RT-PCR
生物
信息学分析
Keywords
Rauvolfia yunnanensis Tsiang
TIAs
STR
RT-PCT
bio-information
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南萝芙木异胡豆苷合成酶基因的克隆与分析
许若娴
曹福祥
彭继庆
司书斌
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
8
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参考文献
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