葡萄球菌核酸酶R型N端片段SNR141的1.9(?)分辨率晶体结构分析

葡萄球菌核酸酶R型(SNaseR)是葡萄球菌核酸酶(SNaseA)的类似物。SNR141是R型核酸酶N端片段系列中的一个,已在E.coli中高度表达和纯化,并且已用于新生肽链折叠的研究。采用悬滴气相扩散法,获得了适合X射线分析用的SNR141单晶体。晶体属于P4_1空间群,晶胞参数为α=b=48.2(?),c=63.8(?)。采用同晶差值Fourier技术,立体化学最小二乘方法和XPLOR程序并辅以电子密度图的人工拟合,测定并精化了SNR141的1.9(?)分辨率晶体结构。最终模型的R因子为19.8％,键长和键角与标准键长和键角的均方根偏差分别为0.016(?)和3.3°。晶体结构的结果表明,从SNaseRC端切除8个残基后,扰动了残基Tyr113的构象,妨碍了酶与底物的结合,使N端片段SNR141的生物酶活力下降为天然酶的80％。