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不同生长年限巴戟天蒽醌类含量差异比较及转录组学挖掘蒽醌类生物合成相关基因
1
作者
梁雪
黄鼎
+4 位作者
黄雪慧
黄勇
张超裕
王素娥
田慧
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期3845-3854,共10页
目的研究不同生长年限巴戟天Morinda officinalis根部蒽醌类化合物的含量差异及生物合成相关基因。方法采用HPLC测定1年生和6年生巴戟天根中蒽醌类化合物成分,并进行比较转录组分析,采用qRT-PCR验证基因表达结果。结果HPLC检测结果显示...
目的研究不同生长年限巴戟天Morinda officinalis根部蒽醌类化合物的含量差异及生物合成相关基因。方法采用HPLC测定1年生和6年生巴戟天根中蒽醌类化合物成分,并进行比较转录组分析,采用qRT-PCR验证基因表达结果。结果HPLC检测结果显示在6年生根中蒽醌类物质显著增加,通过比较转录组分析,从1年生和6年生巴戟天的根中筛选到8619条差异表达基因,KEGG分析表明差异基因主要富集在各种次生代谢物的生物合成、苯丙素生物合成、泛醌和其他萜类醌生物合成等通路中。此外,共鉴定到13条蒽醌生物合成途径相关的差异表达Unigenes,其中ICS、SK、CS、DHNA-CoA synthase均在6年生根中上调表达,而DXS、DXR、DAHPS、IDH均下调表达,DHQD/SDH既有上调表达的又有下调表达的Unigenes。进一步选择6个候选基因进行qRT-PCR验证,验证结果与转录组数据一致。结论为鉴别参与巴戟天蒽醌生物合成的相关基因提供参考,为后期进一步深入研究蒽醌类生物合成的累积规律分子机制提供基础数据。
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关键词
巴戟天
比较转录组
蒽醌类生物合成
差异表达基因
生长年限
原文传递
题名
不同生长年限巴戟天蒽醌类含量差异比较及转录组学挖掘蒽醌类生物合成相关基因
1
作者
梁雪
黄鼎
黄雪慧
黄勇
张超裕
王素娥
田慧
机构
广西中医药大学药学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期3845-3854,共10页
基金
国家自然科学基金资助项目(82160715)
中央本级重大增减支项目(2060302)
+1 种基金
2022年国家级广西大学生创新创业训练计划项目(202210600004)
广西研究生教育创新计划项目(YCSW2023393)。
文摘
目的研究不同生长年限巴戟天Morinda officinalis根部蒽醌类化合物的含量差异及生物合成相关基因。方法采用HPLC测定1年生和6年生巴戟天根中蒽醌类化合物成分,并进行比较转录组分析,采用qRT-PCR验证基因表达结果。结果HPLC检测结果显示在6年生根中蒽醌类物质显著增加,通过比较转录组分析,从1年生和6年生巴戟天的根中筛选到8619条差异表达基因,KEGG分析表明差异基因主要富集在各种次生代谢物的生物合成、苯丙素生物合成、泛醌和其他萜类醌生物合成等通路中。此外,共鉴定到13条蒽醌生物合成途径相关的差异表达Unigenes,其中ICS、SK、CS、DHNA-CoA synthase均在6年生根中上调表达,而DXS、DXR、DAHPS、IDH均下调表达,DHQD/SDH既有上调表达的又有下调表达的Unigenes。进一步选择6个候选基因进行qRT-PCR验证,验证结果与转录组数据一致。结论为鉴别参与巴戟天蒽醌生物合成的相关基因提供参考,为后期进一步深入研究蒽醌类生物合成的累积规律分子机制提供基础数据。
关键词
巴戟天
比较转录组
蒽醌类生物合成
差异表达基因
生长年限
Keywords
Morinda officinalis How
comparative transcriptomics
anthraquinone biosynthesis
differential expression gene
growth years
分类号
R286.2 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同生长年限巴戟天蒽醌类含量差异比较及转录组学挖掘蒽醌类生物合成相关基因
梁雪
黄鼎
黄雪慧
黄勇
张超裕
王素娥
田慧
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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