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云南蔓草虫豆丛枝植原体16S rDNA和secY基因序列分析
被引量:
5
1
作者
王柱华
刘俊男
+3 位作者
杨子祥
赵宇
蔡红
陈海如
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018年第5期826-835,共10页
【目的】为确定在云南元谋地区蔓草虫豆上发生的疑似丛枝病的病原种类。【方法】利用植原体16S rDNA基因及secY基因通用引物对蔓草虫豆感病植株总DNA进行直接PCR和巢式PCR扩增、克隆和测序,分别获得1.8 kb和1.7 kb的16S rDNA、secY基因...
【目的】为确定在云南元谋地区蔓草虫豆上发生的疑似丛枝病的病原种类。【方法】利用植原体16S rDNA基因及secY基因通用引物对蔓草虫豆感病植株总DNA进行直接PCR和巢式PCR扩增、克隆和测序,分别获得1.8 kb和1.7 kb的16S rDNA、secY基因片段。【结果】16S rDNA片段i PhyClassifier在线虚拟RFLP及系统进化分析表明:蔓草虫豆丛枝植原体属于16SrII-A亚组成员(相似系数为1.00),与候选种Candidatus Phytoplasma australasiae相关。基于secY基因同源性比对及构建的系统进化树,表明该株系与来源于云南、台湾的花生丛枝植原体组各株系的亲缘关系最近,确定了该株系属于16SrII-A亚组成员。该分类结果与基于16S rDNA基因的分析结果一致。【结论】本研究首次采用分子生物技术确定了云南元谋蔓草虫豆丛枝病的病原是植原体,明确了其分类地位,该结果可为该病害的早期诊断、检测提供理论依据。
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关键词
蔓草虫豆丛枝病
植原体
16S
rDNA
secY基因
序列分析
下载PDF
职称材料
题名
云南蔓草虫豆丛枝植原体16S rDNA和secY基因序列分析
被引量:
5
1
作者
王柱华
刘俊男
杨子祥
赵宇
蔡红
陈海如
机构
云南农业大学
云南省农业科学院热区生态农业研究所
出处
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018年第5期826-835,共10页
基金
云南省高校科技创新团队支持计划(云科教[2014]22号)
国家自然科学基金项目(31060239)。
文摘
【目的】为确定在云南元谋地区蔓草虫豆上发生的疑似丛枝病的病原种类。【方法】利用植原体16S rDNA基因及secY基因通用引物对蔓草虫豆感病植株总DNA进行直接PCR和巢式PCR扩增、克隆和测序,分别获得1.8 kb和1.7 kb的16S rDNA、secY基因片段。【结果】16S rDNA片段i PhyClassifier在线虚拟RFLP及系统进化分析表明:蔓草虫豆丛枝植原体属于16SrII-A亚组成员(相似系数为1.00),与候选种Candidatus Phytoplasma australasiae相关。基于secY基因同源性比对及构建的系统进化树,表明该株系与来源于云南、台湾的花生丛枝植原体组各株系的亲缘关系最近,确定了该株系属于16SrII-A亚组成员。该分类结果与基于16S rDNA基因的分析结果一致。【结论】本研究首次采用分子生物技术确定了云南元谋蔓草虫豆丛枝病的病原是植原体,明确了其分类地位,该结果可为该病害的早期诊断、检测提供理论依据。
关键词
蔓草虫豆丛枝病
植原体
16S
rDNA
secY基因
序列分析
Keywords
Cajanus scarabaeoides witches’-broom
phytoplasma
16S rDNA
secY
sequence analysis
分类号
S435.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南蔓草虫豆丛枝植原体16S rDNA和secY基因序列分析
王柱华
刘俊男
杨子祥
赵宇
蔡红
陈海如
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018
5
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