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基于转录组测序技术筛选影响蛋鸡产暗斑蛋候选基因的研究
1
作者
杜元军
韩海霞
+7 位作者
刘玮
李大鹏
雷秋霞
周艳
刘杰
王杰
李福伟
陈甫
《山东农业科学》
北大核心
2023年第12期143-149,共7页
本研究旨在利用转录组测序技术(RNA-seq)筛选鸡十二指肠中与暗斑蛋形成相关的功能基因和信号通路。选取连续产暗斑蛋率低和连续产暗斑蛋率高的济宁百日母鸡各10只分别作为对照组和暗斑组,采集十二指肠组织,测定钙代谢相关基因mRNA表达量...
本研究旨在利用转录组测序技术(RNA-seq)筛选鸡十二指肠中与暗斑蛋形成相关的功能基因和信号通路。选取连续产暗斑蛋率低和连续产暗斑蛋率高的济宁百日母鸡各10只分别作为对照组和暗斑组,采集十二指肠组织,测定钙代谢相关基因mRNA表达量,利用RNA-seq技术对差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)进行GO(gene ontology)功能注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)信号通路富集。结果表明,转录组获得高质量数据108.75 Gb且所有样本Q30>97%;共筛选得到471个DEGs,其中327个上调,144个下调,随机选取7个DEGs进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,表达趋势与转录组测序结果基本一致;GO功能注释分析筛选到SLC8A3、SLC24A4、SLC9A2等DEGs主要富集到线粒体钙离子稳态、钠离子跨膜转运和钙离子结合的过程;KEGG通路富集结果显示,GSTT1、GSTO2、GSTA3、CLDN2、CLDN10等DEGs主要富集到细胞色素P450介导的外源物代谢通路、药物代谢-细胞色素P450、钙信号通路等;与对照组相比,暗斑组十二指肠钙结合蛋白(CALB1)的mRNA表达量显著下降(P<0.05)。综上,蛋鸡十二指肠中GSTT1、GSTO2、GSTA3基因的上调和SLC8A3、SLC24A4等基因的下调是影响暗斑蛋形成的关键因素,钙信号通路在暗斑形成中发挥了重要作用。本研究为暗斑蛋的机理研究提供了基础材料。
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关键词
蛋鸡
蛋壳暗斑
十二指肠
差异表达基因
转录组测序
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职称材料
品种、周龄龄、保存时间及保存条件对鸡蛋胶护膜品质的影响
被引量:
7
2
作者
时学锋
李文博
+3 位作者
李兴正
陈霞
徐桂云
郑江霞
《中国家禽》
北大核心
2018年第17期35-39,共5页
为探讨品种、周龄、保存时间、保存条件等因素对鸡蛋胶护膜品质的影响。试验测定了中国农业大学实验牧场的矮小褐壳蛋鸡、白来航蛋鸡、丝羽乌骨鸡、北京油鸡和东乡绿壳蛋鸡5个蛋鸡品种在不同周龄时的胶护膜品质,并设置不同的保存时间和...
为探讨品种、周龄、保存时间、保存条件等因素对鸡蛋胶护膜品质的影响。试验测定了中国农业大学实验牧场的矮小褐壳蛋鸡、白来航蛋鸡、丝羽乌骨鸡、北京油鸡和东乡绿壳蛋鸡5个蛋鸡品种在不同周龄时的胶护膜品质,并设置不同的保存时间和保存条件对胶护膜品质的变化规律进行探究。结果显示:所测的5个蛋鸡品种中,北京油鸡的胶护膜品质较好(P<0.05)。随着产蛋周龄和保存时间增加,胶护膜品质呈下降趋势,但优质组胶护膜始终保持在较高水平。此外,同一湿度条件下,温度越高,胶护膜品质变差越明显。同一温度条件下,湿度越低,胶护膜品质变差越明显。表明不同品种、不同周龄的蛋鸡所产鸡蛋胶护膜品质也不同;相比湿度,温度更能影响胶护膜品质。
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关键词
胶护膜
品种
周龄
保存时间
保存条件
蛋壳暗斑
蛋鸡
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职称材料
题名
基于转录组测序技术筛选影响蛋鸡产暗斑蛋候选基因的研究
1
作者
杜元军
韩海霞
刘玮
李大鹏
雷秋霞
周艳
刘杰
王杰
李福伟
陈甫
机构
青岛农业大学动物医学院
山东省农业科学院家禽研究所
出处
《山东农业科学》
北大核心
2023年第12期143-149,共7页
基金
山东省家禽产业技术体系营养与饲料岗位项目(SDAIT-11-07)
现代农业产业技术体系专项资金(CARS-40)
+2 种基金
山东省农业科学院农业科技创新工程项目(CXGC2022D04)
山东省重点研发计划(农业良种工程)项目(2022LZGC013,2020LZGC013)
家禽绿色低碳高效健康养殖技术集成与协同推广项目(SDNYXTTG-2023-24)。
文摘
本研究旨在利用转录组测序技术(RNA-seq)筛选鸡十二指肠中与暗斑蛋形成相关的功能基因和信号通路。选取连续产暗斑蛋率低和连续产暗斑蛋率高的济宁百日母鸡各10只分别作为对照组和暗斑组,采集十二指肠组织,测定钙代谢相关基因mRNA表达量,利用RNA-seq技术对差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)进行GO(gene ontology)功能注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)信号通路富集。结果表明,转录组获得高质量数据108.75 Gb且所有样本Q30>97%;共筛选得到471个DEGs,其中327个上调,144个下调,随机选取7个DEGs进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,表达趋势与转录组测序结果基本一致;GO功能注释分析筛选到SLC8A3、SLC24A4、SLC9A2等DEGs主要富集到线粒体钙离子稳态、钠离子跨膜转运和钙离子结合的过程;KEGG通路富集结果显示,GSTT1、GSTO2、GSTA3、CLDN2、CLDN10等DEGs主要富集到细胞色素P450介导的外源物代谢通路、药物代谢-细胞色素P450、钙信号通路等;与对照组相比,暗斑组十二指肠钙结合蛋白(CALB1)的mRNA表达量显著下降(P<0.05)。综上,蛋鸡十二指肠中GSTT1、GSTO2、GSTA3基因的上调和SLC8A3、SLC24A4等基因的下调是影响暗斑蛋形成的关键因素,钙信号通路在暗斑形成中发挥了重要作用。本研究为暗斑蛋的机理研究提供了基础材料。
关键词
蛋鸡
蛋壳暗斑
十二指肠
差异表达基因
转录组测序
Keywords
Laying hen
Eggshell translucence
Duodenum
Differentially expressed genes
Transcrip-tome sequencing
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
品种、周龄龄、保存时间及保存条件对鸡蛋胶护膜品质的影响
被引量:
7
2
作者
时学锋
李文博
李兴正
陈霞
徐桂云
郑江霞
机构
中国农业大学动物科技学院
出处
《中国家禽》
北大核心
2018年第17期35-39,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31672408)
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-41)
+1 种基金
公益性行业(农业)科研专项基金(201303084)
教育部“创新团队发展计划”(IRT_15R62)
文摘
为探讨品种、周龄、保存时间、保存条件等因素对鸡蛋胶护膜品质的影响。试验测定了中国农业大学实验牧场的矮小褐壳蛋鸡、白来航蛋鸡、丝羽乌骨鸡、北京油鸡和东乡绿壳蛋鸡5个蛋鸡品种在不同周龄时的胶护膜品质,并设置不同的保存时间和保存条件对胶护膜品质的变化规律进行探究。结果显示:所测的5个蛋鸡品种中,北京油鸡的胶护膜品质较好(P<0.05)。随着产蛋周龄和保存时间增加,胶护膜品质呈下降趋势,但优质组胶护膜始终保持在较高水平。此外,同一湿度条件下,温度越高,胶护膜品质变差越明显。同一温度条件下,湿度越低,胶护膜品质变差越明显。表明不同品种、不同周龄的蛋鸡所产鸡蛋胶护膜品质也不同;相比湿度,温度更能影响胶护膜品质。
关键词
胶护膜
品种
周龄
保存时间
保存条件
蛋壳暗斑
蛋鸡
Keywords
cuticle
breeds
hen age
storage time
storage condition
translucent spots in eggshell
layer
分类号
S831 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序技术筛选影响蛋鸡产暗斑蛋候选基因的研究
杜元军
韩海霞
刘玮
李大鹏
雷秋霞
周艳
刘杰
王杰
李福伟
陈甫
《山东农业科学》
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
品种、周龄龄、保存时间及保存条件对鸡蛋胶护膜品质的影响
时学锋
李文博
李兴正
陈霞
徐桂云
郑江霞
《中国家禽》
北大核心
2018
7
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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引证文献
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