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基于PCPA大鼠下丘脑蛋白互作网络分析挖掘失眠发病的分子机制
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作者 张红石 曲子涵 +1 位作者 矫俊东 张野 《云南中医中药杂志》 2024年第12期82-87,共6页
目的采用蛋白质组学技术对PCPA失眠大鼠模型下丘脑蛋白质表达差异进行分析,探讨失眠模型大鼠在失眠过程中下丘脑的差异蛋白互作网络关系。方法将SD大鼠随机分为空白组、模型A组、模型B组,除空白组外全都给予PCPA造模,模型A组造模成功后... 目的采用蛋白质组学技术对PCPA失眠大鼠模型下丘脑蛋白质表达差异进行分析,探讨失眠模型大鼠在失眠过程中下丘脑的差异蛋白互作网络关系。方法将SD大鼠随机分为空白组、模型A组、模型B组,除空白组外全都给予PCPA造模,模型A组造模成功后立即取下丘脑,空白组与模型B组饲养7 d,待PCPA药效减退后取下丘脑。运用蛋白质组学技术检测各组大鼠下丘脑蛋白差异,以差异表达量上调或下调超过1.5倍作为变化阈值,筛选差异蛋白并分析其互作用关系。结果戊巴比妥钠翻正反射试验显示,模型A组、模型B组与空白组的大鼠睡眠潜伏期时间比较,潜睡眠时间均延长(P<0.01),睡眠持续时间均缩短(P<0.01);自发活动试验显示造模后模型A组、模型B组与空白组比较,自发举爪次数均增加(P<0.05)。根据蛋白互作关系网络分析,模型A组与空白组之间蛋白网络中有16个蛋白有较重要作用,其中Map1(T-kininogen 1)、Mfge8(Lactadherin)、P4hb(Protein disulfide-isomerase)与失眠关系较为密切。模型B组与模型A组之间蛋白网络中有12个蛋白具有重要作用,其中Apoa1(Apolipoprotein A-I)、Mfge8(Lactadherin)、Sympk(Symplekin)、Plg(Plasminogen)与失眠关系密切。结论通过PCPA大鼠下丘脑的蛋白互作网络分析挖掘,失眠的发生发展可能与HPA轴的应激反应下神经变性保护、血管内皮细胞、内分泌调节、免疫系统平衡、学习记忆能力以及衰老具有相关性。 展开更多
关键词 失眠 PCPA模型 下丘脑 蛋白质组学 蛋白互作关系 差异蛋白
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基于组学数据构建基因调控网络
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作者 束永俊 李勇 朱延明 《生物信息学》 2010年第3期223-227,共5页
在生命体内,基因以及其它分子间相互作用形成复杂调控网络,生命过程都是以调控网络的形式存在,如从代谢通路网络到转录调控网络,从信号转导网络到蛋白质相互作用网络等等。因此,网络现象是生命现象的复杂本质和主要特征。本文系统地介... 在生命体内,基因以及其它分子间相互作用形成复杂调控网络,生命过程都是以调控网络的形式存在,如从代谢通路网络到转录调控网络,从信号转导网络到蛋白质相互作用网络等等。因此,网络现象是生命现象的复杂本质和主要特征。本文系统地介绍了基于表达谱数据构建基因调控网络的布尔网络模型,线性模型,微分方程模型和贝叶斯网络模型,并对各种网络构建模型进行了深入的分析和总结。同时,文章从基因组序列信息、蛋白质相互作用信息和生物医学文献信息等方面讨论了基因调控网络方面构建的研究,这对从系统生物学水平揭示生命复杂机制具有重要的参考价值。 展开更多
关键词 基因调控网络 基因表达谱 布尔网络 贝叶斯网络 蛋白关系
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