橡胶树膜系统酵母双杂交cDNA文库构建及HbSRPP7互作蛋白筛选

橡胶树橡胶粒子上的蛋白质在橡胶生物合成一系列反应过程中起着关键作用,它们直接决定着橡胶烃分子的数量和大小,影响天然橡胶的产量和质量。小橡胶粒子蛋白(small rubber particle protein,SRPP)是丰度仅次于橡胶延伸因子(rubber elongation factor,REF)的橡胶粒子蛋白组分,与橡胶粒子发育和橡胶生物合成密切相关。目前已知橡胶粒子上存在多种SRPP家族蛋白,但大部分成员的功能尚不清楚。SRPP可能通过与其他橡胶粒子蛋白相互作用发挥功能。为了筛选SRPP蛋白家族成员之一Hb SRPP7的互作蛋白,本研究利用位点特异性重组技术构建了原始库容为1.5×10^(7)CFU的均一化橡胶树胶乳膜蛋白酵母双杂交系统(membrane yeast two-hybrid system,MYTH)cDNA文库,该文库插入片段平均长度大于1500 bp,重组率约为100%。构建了用于MYTH系统筛选HbSRPP7互作蛋白的pBT3STE-SRPP7和pBT3SUC-SRPP7诱饵载体并确认其能在NMY32酵母菌株中正确表达,无自激活活性。使用pBT3STE-SRPP7诱饵质粒对胶乳MYTHcDNA文库进行筛选,获得21个HbSRPP7候选互作的蛋白,包括3个REF家族蛋白(HbREF1、HbREF3和HbREF8)、2个SRPP家族蛋白(HbSRPP1、HbSRPP2)、2个活性氧清除相关蛋白(thioredoxin H-type-like、L-ascorbate peroxidase 2)以及5个胁迫相关蛋白(high mobility group Bprotein 2-like、RPM1-interacting protein 4-like、stress-related protein-like、salt stress-induced hydrophobic peptide ESI3-like和F-box/kelch-repeat protein)。结果显示HbSRPP7除了可能通过与橡胶生物合成相关的橡胶粒子蛋白互作参与橡胶生物合成,也可能通过与生物和非生物逆境胁迫相关蛋白互作,响应橡胶树乳管生物和非生物逆境胁迫系统信号,参与橡胶粒子上的橡胶生物合成调控。该研究结果有助于了解SRPP家族蛋白的功能,为揭示橡胶粒子上参与橡胶生物合成的蛋白复合体组成,阐明橡胶生物合成及其调控的分子机制奠定基础。

蛋白免疫印迹杂交法研究葛根素对成骨细胞TGF-β1及Smad2/3蛋白表达的影响

目的:观察采用蛋白免疫印迹杂交(Western Bloting)法探讨葛根素通过TGF-β1及其信号转导蛋白Smad 2/3对于促进成骨细胞增殖分化机制的研究。方法:原代培养新生小鼠成骨细胞,分别用空白对照组(含10%DMEM)及3种不同浓度分别为1μg/mL,0.1μg/mL,0.01μg/mL的葛根素干预液处理成骨细胞。采用MTT实验法检测葛根素对成骨细胞生长的影响,Western Bloting法检测葛根素对成骨细胞TGF-β1及其信号转导蛋白Smad 2/3表达的影响。结果:不同浓度的葛根素有促进成骨细胞生长的作用,并可以提高TGF-β1及其信号转导蛋白Smad 2/3的表达,呈浓度依赖性,分别与空白对照组相比有统计学意义(P<0.05)。结论:葛根素可以通过TGF-β1及Smad 2/3信号转导途径促进成骨细胞增殖与分化。

MNS杂交糖蛋白GP. Mur的高分辨率熔解曲线(HRM)基因分型

目的采用高分辨率熔解曲线（HRM）基因分型方法对MNS杂交糖蛋白GP.Mur做基因分型并验证HRM基因分型方法的可靠性。方法收集254例献血者全血标本（广州地区献血者104例,澳大利亚华裔献血者150例）,利用DNA提取试剂盒抽提基因组DNA;以HRM基因分型方法对MNS杂交糖蛋白GP.Mur做基因分型;以多重连接依赖的探针扩增技术（MLPA）或血清学方法对GP.Mur阳性标本做确证试验,同时采用直接测序法对HRM检出的变异曲线标本确证。结果 HRM基因分型254例标本中杂合的GP.Mur有14例,其中11例GP.Mur阳性标本均来自广州献血者,经MLPA基因分型方法证实其基因型为GYP＊Mur/GYPB,另外3例为澳大利亚华裔献血者标本,血清学试验证实红细胞表型为GP.Mur。此外,HRM方法还检出了4例变异曲线标本,测序结果显示这4例标本均在GYPB基因上携带有点突变。结论 HRM方法能准确地对GP.Mur糖蛋白做基因分型,该方法在突变扫描方面具有极大的优势。

垂体腺瘤P16蛋白质杂交分析

目的 探讨垂体腺瘤中P16蛋白的表达状况。方法 应用蛋白质杂交技术分析P16在垂体腺癌中的表达。结果 正常垂体中可见P16蛋白的表达,40例垂体腺瘤中未见P16蛋白的表达。结论 垂体腺瘤的发生与P16蛋白表达缺失有关。

发现蛋白质相互作用的新途径——酵母双杂交系统及其应用

生命中无时无刻不存在生物大分子之间的相互作用,其中包括核酸之间、核酸与蛋白质之间以及蛋白质之间的相互作用。以往研究蛋白质之间的相互作用通常采用生化技术,如偶联、免疫共沉淀等方法。1989年,Fields和Song创立了一种崭新的遗传学方法用于研究蛋白质之间的相互作用。

HuIFN－γ／HuTNF－β重组双功能杂交蛋白的分离和初步纯化

本文对Ｅ．ｃｏｌｉＨＢ１０１菌株的外源基因表达产物＂人γ－干扰素／人β－肿瘤坏死因子重组双功能杂交蛋白＂（ＨｕＩＦＮ－γ／ＨｕＴＮＦ－β简称γＴＮＦβ）进行了分离和初步纯化，并将产物作了抗病毒和细胞毒活性检测。结果表明，此初步纯化的γＴＮＦβ的细胞毒活性为１．４×１０６ｕ／ｍｇ·ｐ；抗病毒活性为１．７×１０６ｕ／ｍｇ·Ｐ。这一方法的建立，为进一步分离纯化γＴＮＦβ打下了基础。

杂交蛋白氧载体光动力治疗诱导免疫原性细胞死亡的研究

肿瘤细胞发生免疫原性细胞死亡能释放特定的信号分子,从而触发机体产生特异性抗肿瘤免疫应答,对评估肿瘤治疗方法的长期疗效具有重要意义。该研究以血红蛋白(Hb)和人血清白蛋白(HSA)为材料,采用二硫键共价偶联的方法构建了包载光敏剂二氢卟吩e6(Ce6)的杂交蛋白氧载体(C@Hb/HSA),并考察了C@Hb/HSA对结肠癌细胞(CT26.WT)的光动力治疗效果和诱导免疫原性细胞死亡的情况。结果显示,在激光照射下,低剂量的C@Hb/HSA能显著提升CT26.WT细胞内的活性氧水平,使其细胞存活率降低至(17.8±5.5)%。同时,基于C@Hb/HSA的光动力治疗能有效增加细胞表面钙网蛋白的暴露,从而增强CT26.WT细胞的免疫原性,促进树突状细胞的成熟。

利用膜蛋白酵母双杂交系统构建人尿道上皮细胞cDNA文库

利用基于分离的泛素介导的膜蛋白酵母双杂交技术,构建人永生尿道上皮细胞(SV-HUC-1) cDNA文库。Trizol法提取人尿道上皮细胞总RNA,并分离纯化其mRNA;以mRNA为模板,合成cDNA第一链、第二链;通过T4 DNA聚合酶将DNA链两端加上5'接头;并将其大于1 kbp的片段与膜蛋白酵母双杂交载体p PR3-N连接,经电转化大肠杆菌感受态细胞,以构建基于分离的泛素介导的膜蛋白酵母双杂交cDNA文库,并检测文库的库容量和随机性。本研究成功构建了人尿道上皮细胞的基于分离的泛素介导的膜蛋白酵母双杂交cDNA文库,为进一步研究泌尿生殖道感染病原体与宿主尿道上皮细胞的相互作用奠定了实验基础。

杂交蛋白治疗淋巴瘤

用基因工程的方法把白喉杆菌毒素的基因杂交于人白细胞介素-2(IL-2),其产品命名为DAB486IL-2。它在治疗无应答性淋巴肿瘤的一期临床试用中取得可喜的结果。 Fredorick LeMaistre用DAB486IL-2治疗18名患者(男性14例、女性4例)证明它有显著的抗肿瘤活性,可使肿瘤退缩。其中一例在治疗后1年半使肿瘤完全退缩;二例部分应答,肿瘤退缩60％以上,分别持续5个月和1年;四例肿瘤退缩小于50％,持续2～5个月。

水通道蛋白基因在胎肺发育过程中的表达

【目的】测定水通道蛋白基因(Aquaporins,AQPs)是否在中晚期妊娠羊胎肺中表达及其表达模式。【方法】应用荧光定量 PCR 技术对妊娠80d,100d,120d,140d 的羊胎外周肺组织各4例及4例成年羊外周肺组织行 AQP1,3,4和5基因的 mRNA 表达的定量检测;应用 Western 免疫蛋白杂交对妊娠100d,130d的羊胎的外周肺组织行 AQP1,3,4和5基因的蛋白表达的检测。【结果】AQP1,3,4,5基因 mRNA 及蛋白质均在妊娠中晚期羊胎肺中表达;AQP5mRNA 在胎肺的表达显著高于成羊肺。【结论】AQPs 基因在胎肺中表达及 AQP5在胎肺中高于成年肺的特定表达模式提示 AQPs 在胎肺液体产生及吸收中发挥一定作用。

大白猪骨桥蛋白基因的克隆、表达及功能分析

应用RT-PCR方法克隆了全长909 bp的大白猪Osteopontin(OPN)基因。运用生物信息学工具进行的分析显示:OPN蛋白一级结构中天冬氨酸、谷氨酸、丝氨酸所占比例最高,含有特异的Arg-Gly-Asp序列(RGD),二级结构中α螺旋占很大比例,并且亲水性较强,OPN信号标签位于第一个同源区,共有的保守性序列为[KQ]-x-[TA]-x(2)-[GA]-S-S-E-E-K。基于蛋白序列所构建的2个分子进化树均表明猪与牛的亲缘关系最近,而与鸡最远。在mRNA水平上,OPN基因在猪体各组织中广泛表达,胃、肾、肺、小肠和卵巢相对较高,而心、脾和大肠则相对较低;在蛋白水平上,不同组织内该蛋白的大小不同,出现了70 ku,70和45 ku,70、45和24 ku 3种蛋白。

酵母双杂交及其衍生系统

酵母双杂交系统是一种研究蛋白质相互作用的分子生物学方法,过去20多年里,大量衍生系统的出现使得这套双杂交技术体系更加完善和高效,成为研究蛋白质-配体相互作用的重要技术手段,广泛应用于功能基因组学、蛋白质组学、病理学等研究领域。对酵母双杂交及其衍生系统的基本原理和应用进展进行综述。

人肝细胞癌中整合素α5、β1亚基和纤维连接蛋白mRNA表达的生物学意义

用Ｎｏｒｔｈｅｒｎ印迹杂交对１５份人肝细胞癌（ＨＣＣ）、５例癌旁肝硬变和３例正常肝组织标本中整合素α５、β１亚基和纤维连接蛋白（ＦＮ）ｍＲＮＡ表达作杂交分析。结果：低分化ＨＣＣ癌组织中整合素α５、β１亚基和ＦＮｍＲＮＡ表达水平明显低于高分化ＨＣＣ及癌旁和正常肝组织（Ｐ＜０．０１）；ＨＣＣ伴肝内浸润和（或）转移组癌组织内３种ｍＲＮＡ水平较无浸润转移组低，差异有显著性意义（Ｐ＜０．０５）；５例伴肝内转移的ＨＣＣ癌组织ＦＮｍＲＮＡ呈异质性表达（５．０ｋｂ位置）。提示：ＦＮ及其受体整合素α５、β１基因转录水平的改变与ＨＣＣ细胞分化、浸润和转移密切相关；异质性ＦＮｍＲＮＡ及其编码的ＦＮ蛋白可能在ＨＣＣ转移中有意义。

草履虫类核纤层蛋白的初步研究

本文以DGD包埋去包埋技术对草履虫的核纤层通过透射电镜和免疫荧光、分子杂交等技术进行了观察。结果显示 ,在核周存在由 10nm纤维组成的核纤层 ;免疫荧光结果表明 ,在核周呈阳性反应 ,并在其表皮、口器等部位呈交叉的阳性反应 ;蛋白分子杂交的反应带在

对虾白斑综合症病毒核衣壳蛋白VP664的鉴定研究

对虾白斑综合症病毒核衣壳蛋白VP664是至今知道的分子量最大的结构蛋白,全长18 234bp,预计编码6 077个氨基酸.从编码vp664基因的两端各选600bp,分别命名为vp664n、vp664c进行原核表达,成功表达纯化了目的蛋白并制备抗体.蛋白印记杂交(Western blot)实验中蛋白特异抗体只与完整的病毒和核衣壳裂解蛋白中的VP664蛋白反应,而不和膜蛋白反应,证明VP664基因所编码的蛋白在完整病毒颗粒上定位于核衣壳.

水稻OsVDAC4诱饵蛋白载体的构建及鉴定

[目的]获得可用于筛选膜蛋白酵母双杂交文库的诱饵蛋白载体。[方法]在对Os VDAC4进行生物信息学分析的基础上,将Os VDAC4全长ORF分别与p BT3-N和p BT3-SUC连接,构建2个诱饵蛋白载体p BT3-Os VDAC4-N-Cub和p BT3-SUC-Os VDAC4-C-Cub,利用膜蛋白酵母双杂交技术鉴定出可用于筛库的诱饵蛋白载体。[结果]p BT3-Os VDAC4-N-Cub和p BT3-SUC-Os VDAC4-C-Cub都可以与目标蛋白互作,但由于Os VDAC4的N端有约50个可自由伸展的氨基酸残基导致p BT3-Os VDAC4-N-Cub本底反应非常强,Os VDAC4的C端存在于膜中而没有可自由伸展的氨基酸残基,p BT3-SUC-Os VDAC4-C-Cub的本底反应很弱。[结论]p BT3-SUC-Os VDAC4-CCub可用于文库筛选,这为获取Os VDAC4的互作蛋白提供了基础。

链状亚历山大藻组蛋白H3基因克隆与生长过程中的表达分析

链状亚历山大藻(Alexandrium catenella)是一种典型的产毒赤潮甲藻。甲藻曾被认为没有组蛋白,但近年来在多种甲藻中检测到全部四个核心组蛋白的活跃转录,而目前对甲藻中组蛋白表达模式与具体功能还缺乏深入的研究。本文报道了链状亚历山大藻组蛋白H3变体之一H3.c的全长ORF序列的克隆和分析;分析了链状亚历山大藻生长过程中组蛋白H3在基因和蛋白水平的表达。目前研究发现的链状亚历山大藻H3变体共三个,其中H3.b在N末端序列与其他物种差异最大,为链状亚历山大藻特有的H3变体。对数生长期的组蛋白H3在基因与蛋白水平上均活跃表达,但表达量并不会随着爆发性增长而显著变化,其中H3.b的基因表达在对数末期呈现上调;培养至衰亡期,各H3变体表达均下调,尤其在蛋白水平上呈现明显衰减。结合前期研究,本文认为链状亚历山大藻三个H3均为复制非依赖型(RI)变体,一些变体可响应伴随藻不断生长而逐渐增强的细胞密度等复杂胁迫,推测其参与某些表观遗传修饰,调控生长进程;而衰亡期基于H3的表观遗传调控受到抑制。