分子动力学模拟探讨Annexin A5的N-末端对其结构的影响

研究ANX A5的N-末端存在与否对其核心区域结构以及四级结构的影响。ANX家族蛋白的显著特征是含有高度保守的C-端核心序列以及多变的N-末端结构,核心序列由4个重复的同源序列构成,具有明显的同源性,而N-末端的序列及长度在进化过程中表现出很大的多样性。为了研究N-末端对ANX蛋白的意义,文章以ANX A5为例,采用分子动力学模拟的手段分别对ANX A5单体和三聚体进行了模拟,研究N-末端对ANX A5的核心区域结构以及四级结构的影响。模拟结果显示,N-末端存在与否并不影响ANX A5单体/亚基的结构,对钙离子的结合也没有大的影响;但是N-末端存在与否对ANX A5核心序列四级结构造成了很大的影响,三聚体有加速分散的趋势,从而猜测N-末端对ANX A5的亚基之间聚合有重要作用。综上可得,N-末端存在与否不会对其核心区域的结构稳定以及与Ca^(2+)的结合造成大的影响,但是对于ANX A5三聚体结构的形成是必不可少的。