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蛋白质组学在评价人子宫内膜容受性中的应用进展
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作者 马丽娜 漆海宁 +5 位作者 秦莹 刘洋 罗凤娟 罗蓉 吴效科 邢建红 《现代妇产科进展》 2024年第6期473-476,共4页
良好的子宫内膜容受性是胚胎着床的必要条件,容受期子宫内膜组织的特异性蛋白表达与容受性密切相关。通过蛋白组测序技术可获得月经不同时期子宫内膜组织的蛋白表达图谱,结合生物信息学分析,可更好地了解容受期子宫内膜特异蛋白表达,并... 良好的子宫内膜容受性是胚胎着床的必要条件,容受期子宫内膜组织的特异性蛋白表达与容受性密切相关。通过蛋白组测序技术可获得月经不同时期子宫内膜组织的蛋白表达图谱,结合生物信息学分析,可更好地了解容受期子宫内膜特异蛋白表达,并为其调控机制研究提供技术支持。蛋白质组学技术的发展为生理病理条件下的子宫内膜功能特征研究提供了便捷有效的分析方法。同时,对于准确判断不孕症患者及反复植入失败患者的子宫内膜容受性,进一步指导患者的个体化胚胎移植,具有非常重要的临床应用价值。对蛋白质组学测序技术在人子宫内膜容受性相关研究中的应用进行系统综述,旨在深入了解子宫内膜容受性,以期提高辅助生殖技术周期中妊娠率和减少生育治疗费用。 展开更多
关键词 子宫内膜容受性 蛋白组学测序技术 种植窗 胚胎移植
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口腔肿瘤干细胞样细胞中锌指蛋白750的潜在靶蛋白筛选
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作者 姜博 于水 +3 位作者 杨一昆 徐聪 杨红莉 陈海英 《山东医药》 CAS 2023年第15期38-42,共5页
目的筛选锌指蛋白750(ZNF750)在口腔肿瘤干细胞样细胞(CSC-like cell)中的潜在靶蛋白。方法(1)CSC-like cell的富集:采用肿瘤球形成实验富集口腔鳞癌(OSCC)细胞系TCA-83及CAL-27细胞中CSC-like cell细胞。(2)CSC-like cell细胞中ZNF750... 目的筛选锌指蛋白750(ZNF750)在口腔肿瘤干细胞样细胞(CSC-like cell)中的潜在靶蛋白。方法(1)CSC-like cell的富集:采用肿瘤球形成实验富集口腔鳞癌(OSCC)细胞系TCA-83及CAL-27细胞中CSC-like cell细胞。(2)CSC-like cell细胞中ZNF750潜在靶蛋白筛选:将CSC-like cell分为oe-Con组(转导空载体慢病毒)及oeZNF750组(转导过表达ZNF750慢病毒),采用TMT标记定量蛋白质组学技术筛选两组差异表达蛋白,对差异表达蛋白进行生物信息学分析[GO、KEGG及IPR(结构域)分析],从差异表达蛋白中选择与ZNF750关系密切的候选蛋白[角鲨烯合酶(FDFT1)、与糖代谢相关的糖原合成酶(GYS1)、与核糖体相关的核糖体蛋白RPL15及40S核糖体蛋白RPS7以及具有结构分子活性的角蛋白6A、17(KRT6A、KRT17)]进行实时荧光定量PCR(qPCR)验证。从与ZNF750关系密切的候选蛋白中选择FDFT1(与类固醇生物合成有关兼具酶转运活性)作为兴趣蛋白,采用qPCR检测CSC-like cell、口腔鳞癌(OSCC)细胞、正常口腔上皮细胞中FDFT1 mRNA的相对表达量,蛋白质印迹法检测过表达或敲减ZNF750基因的CSC-like cell中FDFT1蛋白相对表达量。结果(1)转导过表达ZNF750基因的CSC-like cell细胞中差异表达蛋白的筛选结果:与oe-Con组相比,oe-ZNF750组中差异表达蛋白共26个,其中上调9个,下调17个。(2)差异表达蛋白生信分析结果及其中与ZNF750关系密切的差异表达蛋白验证结果:GO分析结果显示,差异表达蛋白主要位于细胞内和细胞内非膜结合细胞器,参与生物合成及生物大分子的合成过程;涉及的生物功能包含结构分子活性、糖原合成酶活性、糖脂转运及糖脂结合功能;KEGG信号通路分析结果显示,差异表达蛋白显著富集在类固醇生物合成及糖代谢过程中;IPR分析证明富集的结构域包含糖脂转移蛋白结构域。qPCR结果显示,ZNF750可降低FDFT1、GYS1、RPL15、RPS7、KRT6A、KRT17基因的表达(P均<0.05)。(3)CSC-like cell及过表达或敲减ZNF750基因的CSC-like cell中FDFT1蛋白表达变化:与正常口腔上皮细胞比较,OSCC及CSC-like cell中FDFT1的表达上调,以CSC-like cell为著(P均<0.05)。分别与各自匹配的阴性对照组比较,过表达ZNF750的CSClike cell中FDFT1蛋白表达下调,敲减ZNF750的CSC-like cell中FDFT1蛋白表达上调(P均<0.05)。结论过表达ZNF750的CSC-like cell中差异表达蛋白共26个,其中上调9个、下调17个;差异表达蛋白主要与生物大分子合成及类固醇生物合成有关;FDFT1可能是ZNF750的潜在靶蛋白。 展开更多
关键词 锌指蛋白750 角鲨烯合酶 胆固醇代谢 肿瘤干细胞 蛋白组学测序技术 同位素标记定量技术 口腔鳞癌
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补肾活血法预防芳香化酶抑制剂所致骨丢失的机制
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作者 浦冬青 刘志勇 +4 位作者 冯丹丹 张梦棣 刘炳蔚 时光喜 李静蔚 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1127-1132,共6页
目的探讨补肾活血法预防芳香化酶抑制剂(aromatase inhibitors,AIs)所致骨丢失的关键靶标和通路。方法将小鼠随机分为假手术组、模型组和给药组,模型组和给药组去势后予以10μg/d来曲唑溶液皮下注射构建绝经后AIs所致骨质疏松动物模型,... 目的探讨补肾活血法预防芳香化酶抑制剂(aromatase inhibitors,AIs)所致骨丢失的关键靶标和通路。方法将小鼠随机分为假手术组、模型组和给药组,模型组和给药组去势后予以10μg/d来曲唑溶液皮下注射构建绝经后AIs所致骨质疏松动物模型,给药组同时予以黄芪补肾活血汤(HQD)19.24 g/(kg·d)灌胃预防骨丢失,假手术组与模型组予以等量生理盐水灌胃。给药三个月后取小鼠股骨进行骨密度检测验证造模效果,并借助TMT蛋白组学测序分析获取其组学特征。结果与假手术组相比,模型组小鼠骨小梁结构疏松紊乱,数量减少,证明造模成功。与模型组相比,给药组骨小梁粗大致密,数量增多,证明补肾活血法预防作用显著。模型组与假手术组相比,上调蛋白275个,下调189个;给药组与模型组相比,上调蛋白286个,下调蛋白898个。三组对比后共有18个交集蛋白,分别为Ptbp1、Epx、Ear1、Ear2、Col6a5、Mta2、Alox15、Lztfl1、Ccl6、Diaph2、Wfdc21、Smarcb1、Strip1、C19orf12、Pex14、Akr1b7、Fahd1、Nr1d2。差异蛋白主要参与了细胞发育和分化的调节、脂质代谢、核酸内切酶活性等生物过程,并在铁死亡、花生四烯酸代谢通路、肌钙蛋白细胞骨架调节、PI3K-AKT等信号通路显著富集。结论补肾活血法可有效预防AIs所致骨丢失的发生,其关键靶标和作用机制可能与Ptbp1、Alox15及铁死亡、PI3K-AKT等通路相关。 展开更多
关键词 补肾活血法 芳香化酶抑制剂 骨丢失 蛋白组学测序
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A systematic survey of PRMT interactomes reveals the key roles of arginine methylation in the global control of RNA splicing and translation 被引量:4
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作者 Huan-Huan Wei Xiao-Juan Fan +9 位作者 Yue Hu Xiao-Xu Tian Meng Guo Miao-Wei Mao Zhao-Yuan Fang Ping Wu Shuai-Xin Gao Chao Peng Yun Yang Zefeng Wang 《Science Bulletin》 SCIE EI CSCD 2021年第13期1342-1357,M0004,共17页
Thousands of proteins undergo arginine methylation,a widespread post-translational modification catalyzed by several protein arginine methyltransferases(PRMTs).However,global understanding of their biological function... Thousands of proteins undergo arginine methylation,a widespread post-translational modification catalyzed by several protein arginine methyltransferases(PRMTs).However,global understanding of their biological functions is limited due to the lack of a complete picture of the catalytic network for each PRMT.Here,we systematically identified interacting proteins for all human PRMTs and demonstrated their functional importance in mRNA splicing and translation.We demonstrated significant overlapping of interactomes of human PRMTs with the known methylarginine-containing proteins.Different PRMTs are functionally redundant with a high degree of overlap in their substrates and high similarities between their putative methylation motifs.Importantly,RNA-binding proteins involved in regulating RNA splicing and translation contain highly enriched arginine methylation regions.Moreover,inhibition of PRMTs globally alternates alternative splicing(AS)and suppresses translation.In particular,ribosomal proteins are extensively modified with methylarginine,and mutations in their methylation sites suppress ribosome assembly,translation,and eventually cell growth.Collectively,our study provides a global view of different PRMT networks and uncovers critical functions of arginine methylation in regulating mRNA splicing and translation. 展开更多
关键词 Post-translational modification Protein arginine methyltransferase RNA-binding protein Ribosomal proteins Alternative splicing mRNA translation
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