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家蚕中肠组织在变态发育不同时期的蛋白表达差异分析 被引量:5
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作者 黄志君 邓小娟 +5 位作者 陈芳艳 母培强 杨婉莹 钟仰进 夏庆友 曹阳 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期207-215,共9页
分析了家蚕在变态期不同发育时段中肠组织蛋白表达差异的信息。SDS-PAGE电泳分析显示,从家蚕吐丝前1 d到化蛹72 h的中肠蛋白分离到相对明显的16条泳带,其中分子量约为30、45、70 kD的蛋白组分含量较大,且比较稳定,分子量约为50、60、62... 分析了家蚕在变态期不同发育时段中肠组织蛋白表达差异的信息。SDS-PAGE电泳分析显示,从家蚕吐丝前1 d到化蛹72 h的中肠蛋白分离到相对明显的16条泳带,其中分子量约为30、45、70 kD的蛋白组分含量较大,且比较稳定,分子量约为50、60、62 kD的蛋白组分在不同时期存在着显著的表达差异。进而通过聚丙烯酰胺双向凝胶电泳分析,发现家蚕中肠组织蛋白的表达种类和差异蛋白数目的变化在化蛹1~3 d非常明显:蛋白表达种类的变化呈现2个高峰,分别为化蛹0 h和化蛹41 h;差异蛋白数目的变化呈现3个波峰,分别在吐丝98 h至化蛹0 h、化蛹30~41 h和化蛹41~58 h。在化蛹1~3 d,这种显著峰值变化的时期刚好与家蚕中肠组织发生旧肠壁细胞退化死亡和新生肠壁细胞分化增殖的盛期相吻合,从一个侧面反映了家蚕中肠组织在变态期活跃的发育进程。 展开更多
关键词 家蚕 变态期 中肠组织 蛋白表达差异
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基于iTRAQ技术探究不同毒力猫杯状病毒感染宿主细胞后蛋白表达差异的研究 被引量:3
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作者 李帅 臧铭慧 周振雷 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1261-1268,共8页
为研究不同毒力猫杯状病毒(FCV)感染宿主细胞后蛋白表达的差异,并分析差异表达蛋白的特征和潜在关键蛋白。本实验将FCV强毒株2280与弱毒株F9分别接种猫肾细胞(F81)24 h后,收获细胞裂解液,利用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ)分析... 为研究不同毒力猫杯状病毒(FCV)感染宿主细胞后蛋白表达的差异,并分析差异表达蛋白的特征和潜在关键蛋白。本实验将FCV强毒株2280与弱毒株F9分别接种猫肾细胞(F81)24 h后,收获细胞裂解液,利用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ)分析不同毒力FCV感染细胞后差异表达的蛋白,并经基因本体论(GO)分析差异表达蛋白的功能,利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析差异表达蛋白参与的信号通路及其相互作用。从差异表达蛋白中选取2个蛋白通过western blot验证。结果显示,共筛选出103个核心差异蛋白,其中表达上调蛋白39个,表达下调蛋白64个。GO分析结果显示,核心差异蛋白主要参与细胞凋亡、肿瘤坏死因子应答、活性氧代谢调控等生物过程;KEGG分析结果显示,核心差异蛋白显著富集于NF-κB、IL-17、p53、细胞凋亡等信号通路。Western blot验证IVNS1ABP和EIF4B两个差异表达蛋白的表达变化与iTRAQ结果一致,证明iTRAQ技术结果可靠。上述结果表明,致炎和凋亡相关蛋白表达水平的显著改变与FCV 2280株与F9株毒力差异相关。本实验为进一步探究FCV毒力差异机制及该病毒感染的防制奠定基础。 展开更多
关键词 猫杯状病毒 ITRAQ 差异表达蛋白
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大理野茄M239响应黄萎病病菌侵染的差异表达蛋白分析
3
作者 蔚亚楠 黎志彬 +5 位作者 龚亚菊 鲍锐 桂敏 杜光辉 刘家迅 吴丽艳 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期165-174,共10页
为了探索植物响应黄萎病病原菌侵染的作用机制,以黄萎病高感野茄材料大理野茄(M239)为研究对象,通过人工接种黄萎病病原菌大丽轮枝菌的方法,首先测定M239在接种大丽轮枝菌后0,6,12,24,48 h的根部4个关键生理指标,即过氧化物酶(POD)、过... 为了探索植物响应黄萎病病原菌侵染的作用机制,以黄萎病高感野茄材料大理野茄(M239)为研究对象,通过人工接种黄萎病病原菌大丽轮枝菌的方法,首先测定M239在接种大丽轮枝菌后0,6,12,24,48 h的根部4个关键生理指标,即过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)、苯丙氨酸解氨酶(PAL)的活性和可溶性蛋白(SP)含量的变化。结果确定接种大丽轮枝菌后12,24 h为蛋白组分析取样的关键时间点;在此基础上,利用iTRAQ技术分析M239在接种大丽轮枝菌后根部蛋白的变化。结果发现,与清水接种(CK)相比,M239接种大丽轮枝菌后12 h有463个差异表达蛋白(DEPs),其中305个下调,158个上调;接种后24 h,有456个DEPs被病原菌诱导表达,包括296个下调,160个上调。这些蛋白主要富集在碳代谢、乙醛酸和二羧酸代谢、次生代谢物的生物合成、丙酮酸代谢、新陈代谢等途径。通过与已报道的黄萎病抗性材料的研究结果进行对比分析发现,M239在响应大丽轮枝菌的侵染过程中,参与防御响应的蛋白数量和代谢通路较少,未能形成有效的防御网络,最终表现为感病。 展开更多
关键词 野茄 黄萎病 大丽轮枝菌 iTRAQ技术 差异表达蛋白
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原料乳冷藏过程中差异表达蛋白的表征与比较分析
4
作者 庄姣 剧柠 +6 位作者 朱晓雪 李亚凤 丁雨红 高岩 陈彦辉 齐瑾 杨秉坤 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第5期225-232,共8页
采用数据独立采集蛋白质组学技术分析4℃冷藏6 d的原料乳差异蛋白质组成及其生物学功能。冷藏过程中,共鉴定到902种蛋白质。其中,冷藏前期(d 0 vs d 3)和冷藏后期(d 3 vs d 6)分别筛选出70种和71种差异表达蛋白。生物信息学分析发现冷... 采用数据独立采集蛋白质组学技术分析4℃冷藏6 d的原料乳差异蛋白质组成及其生物学功能。冷藏过程中,共鉴定到902种蛋白质。其中,冷藏前期(d 0 vs d 3)和冷藏后期(d 3 vs d 6)分别筛选出70种和71种差异表达蛋白。生物信息学分析发现冷藏前期差异蛋白具有对神经生长因子的刺激反应和细胞组织的调控等功能,主要参与了细胞的生物学过程;冷藏后期差异蛋白具有碳水化合物代谢过程和RNA代谢过程的调节等功能,主要参与了糖代谢途径。蛋白-蛋白互作网络分析表明,细胞分裂控制蛋白42同源物(CDC42)是两个冷藏阶段共有的关键节点蛋白,该蛋白与细胞的吞噬作用密切相关。上述结果揭示了冷藏过程中的蛋白质组成差异和功能的多样性,为原料乳的冷藏提供了理论依据,对原料乳的质量控制具有重要意义。 展开更多
关键词 原料乳 冷藏 蛋白组学 差异表达蛋白 生物信息学
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炎症性肠病合并皮肤损害患者外泌体差异表达蛋白质及发病机制研究
5
作者 吴俊俊 李珍 +3 位作者 李华铭 李春霞 朱伟琴 王宇芳 《浙江医学》 CAS 2024年第1期57-61,I0007,共6页
目的探讨炎症性肠病(IBD)合并皮肤损害患者外泌体差异表达蛋白质及发病机制。方法选取杭州市第三人民医院2020年1月至2021年12月收治的5例IBD以及5例IBD合并皮肤损害患者为研究对象,分别为IBD组、IBD+皮肤损害组;另选取本院同期体检的5... 目的探讨炎症性肠病(IBD)合并皮肤损害患者外泌体差异表达蛋白质及发病机制。方法选取杭州市第三人民医院2020年1月至2021年12月收治的5例IBD以及5例IBD合并皮肤损害患者为研究对象,分别为IBD组、IBD+皮肤损害组;另选取本院同期体检的5名年龄和性别匹配的健康志愿者为对照组。提取3组对象血清外泌体,检测差异表达蛋白质;采用基因本论(GO)和京都基因和基因组数据库(KEGG)对差异表达蛋白质进行生物信息学分析。结果共鉴定829种蛋白质,其中包含定量信息的蛋白质726种。与对照组比较,IBD组有15种蛋白质表达上调,21种蛋白质表达下调;IBD+皮肤损害组有24种蛋白质表达上调,25种蛋白质表达下调;与IBD组比较,IBD+皮肤损害组有12种蛋白质表达上调和8种蛋白质表达下调。GO分析显示,IBD组与对照组、IBD+皮肤损害组与对照组、IBD+皮肤损害组与IBD组差异表达蛋白质涉及的生物过程包括刺激反应、细胞过程、单有机过程、生物调节等,细胞组成主要包括细胞、细胞膜外域、细胞器等,分子功能主要包括结合、催化活性等。KEGG分析显示,IBD组与对照组差异表达蛋白质主要与细胞黏附、离子跨膜运输调控、细胞形态分化等有关;IBD+皮肤损害组与对照组差异表达蛋白质主要与细胞分泌、细胞分解代谢、分泌调节有关;IBD+皮肤损害组与IBD组差异表达蛋白质主要与细胞胺代谢、NIK/NF-κB信号通路、细胞周期过程的负调控等有关。结论本研究基于TMT蛋白质组学分析筛选出IBD+皮肤损害患者血清外泌体差异表达蛋白质,这些蛋白质参与IBD合并皮肤损害的代谢相关通路及病变的发生。 展开更多
关键词 炎症性肠病 皮肤损害 外泌体 差异表达蛋白 信号通路
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显微介导中国对虾基因鲤肌肉蛋白差异表达分析
6
作者 闫学春 张颖 栾培贤 《水产学杂志》 CAS 北大核心 2023年第3期10-16,共7页
本文通过显微注射方法,将中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)总DNA直接导入鲤(Cyprinus carpio L.)受精卵内,获得显微介导中国对虾基因鲤。为了研究显微介导中国对虾基因鲤蛋白质的表达变化,利用iTRAQ技术定量蛋白质测序分析了未进... 本文通过显微注射方法,将中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)总DNA直接导入鲤(Cyprinus carpio L.)受精卵内,获得显微介导中国对虾基因鲤。为了研究显微介导中国对虾基因鲤蛋白质的表达变化,利用iTRAQ技术定量蛋白质测序分析了未进行显微介导和显微介导中国明对虾基因的2种鲤的肌肉组织,寻找与氨基酸和脂肪酸相关的差异表达蛋白,并分析了差异表达蛋白GO功能注释和KEGG代谢通路。结果共鉴定蛋白质999个,表达差异蛋白92个,其中上调蛋白58个,下调蛋白34个。差异蛋白Pathway富集分析表明,显著富集于脂肪酸和氨基酸等代谢通路上的差异蛋白有13个,其中在精氨酸和脯氨酸代谢通路中发现的上调7.51倍的肌酸激酶(creatine kinase)有促进鱼类肌肉发育的作用;而在脂肪酸代谢通路中发现的下调0.59倍的线粒体三功能蛋白(mitochondrial trifunctional protein),有提高鱼体内多种饱和与不饱和脂肪酸含量的作用。同时对筛选到的两个蛋白进行实时荧光定量PCR验证,证实了蛋白质组的分析结果。 展开更多
关键词 显微介导 中国明对虾 ITRAQ 差异蛋白表达
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应用非标记定量蛋白组学研究帕金森病差异表达蛋白 被引量:1
7
作者 龙云飞 肖飞 +2 位作者 李淑华 苏闻 陈海波 《中风与神经疾病杂志》 CAS 2023年第7期636-640,共5页
目的寻找帕金森病(PD)患者血清中差异表达的蛋白,探索PD生物学标志物。方法选择在北京医院临床确诊的PD患者24例,其中12例为仅有PD病史(P1组),另12例合并有高血压病、糖尿病基础疾病(P2组);筛选24例年龄、性别匹配的体检者(对照组C1和C2... 目的寻找帕金森病(PD)患者血清中差异表达的蛋白,探索PD生物学标志物。方法选择在北京医院临床确诊的PD患者24例,其中12例为仅有PD病史(P1组),另12例合并有高血压病、糖尿病基础疾病(P2组);筛选24例年龄、性别匹配的体检者(对照组C1和C2组),采集血清标本去除高丰度蛋白后,应用非标记定量蛋白组学技术检测各组血清中蛋白表达,采取双重对比将P1组与C1组、P2组与C2组比较,分别筛查出差异表达蛋白,再从中筛选出表达变化(上调或下调)一致的蛋白,确定为PD差异表达蛋白,并用生物信息学方法分析解释。结果各组对比后,共鉴定出4种差异表达的蛋白为PRG4、CFHR-3、ACTG1、HIST2H2BF,其中PD患者的血清中PRG4、CFHR-3表达上调,ACTG1、HIST2H2BF表达下调且存在一定的相互作用。结论应用非标记定量蛋白组学筛选出了帕金森差异表达的蛋白,可能对帕金森病的诊断具有一定的意义。 展开更多
关键词 帕金森病 非标记定量 蛋白组学 差异表达蛋白
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iTRAQ技术在颅内动脉瘤病人血浆差异表达蛋白检测中的应用 被引量:1
8
作者 王晨辰 韩雨薇 李晓明 《中国临床神经外科杂志》 2023年第6期386-389,共4页
目的探讨同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术在颅内动脉瘤血浆差异表达蛋白(DEPs)检测中的应用价值。方法收集2019年1~12月收治的10例颅内破裂动脉瘤病人血浆10份,同时收集年龄、性别、吸烟史、饮酒史、高血压以及动脉瘤位置等相匹配... 目的探讨同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术在颅内动脉瘤血浆差异表达蛋白(DEPs)检测中的应用价值。方法收集2019年1~12月收治的10例颅内破裂动脉瘤病人血浆10份,同时收集年龄、性别、吸烟史、饮酒史、高血压以及动脉瘤位置等相匹配的10例颅内未破裂动脉瘤血浆10份作为对照组。采用iTRAQ技术筛选血浆样本DEPs,应用生信分析方法GO分析和KEGG通路富集分析,并与GEO数据库的数据集进行交叉验证。结果经蛋白质组学分析鉴定出806个可定量蛋白,其中DEPs共122个,表达上调59个,表达下调63个。GO和KEGG分析结果显示,动脉瘤破裂主要与炎症和免疫反应相关。DEPs相互作用网络分析显示,白蛋白、血红蛋白β亚基、钙调蛋白1、转铁蛋白和载脂蛋白A1是网络核心蛋白。与GEO数据集交叉结果显示,血浆样本SLMAP、IQGAP3、PTPRJ、PEBP1、S100P、BASP1和AOC3等表达水平与GEO数据集的动脉瘤组织基因表达水平呈现相同变化趋势,而且破裂动脉瘤与未破裂动脉瘤之间具有统计学差异(P<0.05)。结论本文结果初步筛选出与颅内动脉瘤破裂相关的血浆DEPs,这些DEPs与炎症和免疫反应密切相关。这为研究颅内动脉瘤发病的分子机制和潜在的治疗靶点提供了新的线索。 展开更多
关键词 颅内动脉瘤 蛋白质组学 差异表达蛋白 同位素标记相对和绝对定量技术 生物信息学
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嗜盐古菌Haloferax sp. H4蛋白质表达差异研究 被引量:1
9
作者 刘杰 高凯 +1 位作者 陈晨 陈绍兴 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第13期7599-7600,共2页
[目的]研究嗜盐古菌Haloferax sp.H4在不同环境中的蛋白表达差异。[方法]采用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测不同NaCl浓度、pH、温度、有氧和无氧条件下的H4菌株蛋白表达差异。[结果]H4菌株在不同NaCl浓度、有氧和无氧条件下的... [目的]研究嗜盐古菌Haloferax sp.H4在不同环境中的蛋白表达差异。[方法]采用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测不同NaCl浓度、pH、温度、有氧和无氧条件下的H4菌株蛋白表达差异。[结果]H4菌株在不同NaCl浓度、有氧和无氧条件下的蛋白表达存在明显特异性;而在不同pH和温度条件下,其蛋白表达差异性不明显。[结论]嗜盐古菌对不同环境因子的调控方式可能存在差异。 展开更多
关键词 嗜盐古菌 HALOFERAX sp.H4 蛋白表达差异
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油松毛虫取食和剪叶刺激胁迫下油松的蛋白质表达差异分析 被引量:6
10
作者 王银翠 周国娜 +2 位作者 张斌 陈明叶 高宝嘉 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第8期68-75,共8页
【目的】研究自然环境条件下剪叶和油松毛虫不同取食刺激程度双重诱导对油松体内蛋白质表达的影响,揭示油松诱导防御反应的蛋白质基础。【方法】在河北省平泉县的油松-山杏混交林中,选取15年生左右生长势一致的油松,进行树上套笼饲养10... 【目的】研究自然环境条件下剪叶和油松毛虫不同取食刺激程度双重诱导对油松体内蛋白质表达的影响,揭示油松诱导防御反应的蛋白质基础。【方法】在河北省平泉县的油松-山杏混交林中,选取15年生左右生长势一致的油松,进行树上套笼饲养10头、30头油松毛虫和剪叶处理,以未处理油松为对照,采用双向电泳法测定油松体内蛋白质表达差异。【结果】通过蛋白质点表达量的计算,与对照相比,油松毛虫取食及剪叶刺激后,均有特异表达蛋白点、消失蛋白点、上调蛋白点及下调蛋白点,但不同处理间蛋白点的表达差异不同。对差异蛋白点进行质谱鉴定,数据库检索结果表明,油松毛虫取食后特异表达的蛋白点是叶绿体ATP合酶CF0β亚基、抗坏血酸过氧化物酶、噻唑生物合成酶、Lhcb5蛋白、ATP合酶β亚基以及蛋白类谷胱甘肽S-转移酶,下调表达的蛋白点是蛋白酶亚基和假定蛋白CL304Contig1_01;剪叶刺激后特异表达的蛋白点是tau蛋白类谷胱甘肽S-转移酶和Rubisco加氧酶,下调表达的蛋白点是磷酸甘油酸激酶Ⅰ和核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶大亚基。进一步分析表明,取食刺激处理后,胁迫和防御相关蛋白高度表达,并且30头松毛虫取食后,与蛋白合成相关的蛋白质也特异表达;剪叶处理后,胁迫和防御相关蛋白也有特异表达,而且能量代谢相关蛋白下调。说明取食和创伤刺激可明显诱导油松防御有关蛋白的表达、光合作用的增强、蛋白质的合成和能量代谢的降低等防御反应。【结论】取食和剪叶刺激可明显诱导油松防御有关蛋白的高表达、促进光合作用的增强和蛋白质的合成,降低能量代谢等,这些变化应是构成油松防御反应的蛋白质基础。 展开更多
关键词 油松 油松毛虫 诱导防御反应 取食 剪叶 蛋白表达差异
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应用iTRAQ结合质谱技术筛选冷应激大鼠血浆差异表达蛋白 被引量:10
11
作者 刘艳芝 郭景茹 +4 位作者 彭梦玲 马莉 甄莉 计红 杨焕民 《中国应用生理学杂志》 CAS CSCD 2015年第5期392-395,400,共5页
目的:应用同重同位素相对与绝对定量(iTRAQ)结合质谱技术筛选冷应激大鼠血浆差异表达蛋白。方法:将30只健康SPF级雄性Wistar大鼠随机分为冷应激组A和常温饲养组B,将A、B两组分别随机分为3组,即A1、A2、A3组和B1、B2、B3组(n=5)。常温饲... 目的:应用同重同位素相对与绝对定量(iTRAQ)结合质谱技术筛选冷应激大鼠血浆差异表达蛋白。方法:将30只健康SPF级雄性Wistar大鼠随机分为冷应激组A和常温饲养组B,将A、B两组分别随机分为3组,即A1、A2、A3组和B1、B2、B3组(n=5)。常温饲养温度为(24.0±0.1)℃,冷应激温度为(4.0±0.1)℃。两组实验大鼠经不同温度处理12 h后,用肝素钠抗凝负压管腹主动脉采血,分离血浆,提取血浆蛋白、定量、酶解、iTRAQ标记、强阳离子交换色谱(SCX分离)和质谱分析。结果:共鉴定出1 085个蛋白,筛出39个差异表达蛋白,其中29个表达上调蛋白,10个表达下调蛋白。经生物信息学分析,筛出3个与动物冷应激相关的重要差异表达蛋白,分别为:组织相容性蛋白HA-1、Ras相关蛋白Rap1b、整合蛋白β-1。结论:本实验成功筛出冷应激大鼠血浆差异表达蛋白,iTRAQ技术为筛选大鼠冷应激蛋白诊断标志物提供了一个良好的平台,为深入研究动物冷应激发生机制奠定了良好基础。 展开更多
关键词 冷应激 大鼠 ITRAQ 差异表达蛋白
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不同配穴针刺预防应激性胃溃疡的效应比较及差异表达蛋白的筛选 被引量:8
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作者 王朝辉 单纯筱 +2 位作者 周丹 严兴科 王富春 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期441-447,F0002,共8页
目的:观察不同配穴的预防性针刺对应激性胃溃疡大鼠胃组织损伤情况及蛋白质谱的影响,阐明不同配穴针刺预防应激性胃溃疡效果,获得相关差异表达蛋白。方法:120只雄性Wistar大鼠随机分为正常对照组、捆绑对照组、应激性胃溃疡模型组、募... 目的:观察不同配穴的预防性针刺对应激性胃溃疡大鼠胃组织损伤情况及蛋白质谱的影响,阐明不同配穴针刺预防应激性胃溃疡效果,获得相关差异表达蛋白。方法:120只雄性Wistar大鼠随机分为正常对照组、捆绑对照组、应激性胃溃疡模型组、募穴组、下合穴组、合募配穴组、背俞穴组和俞募配穴组,每组15只。各组大鼠针刺后采用水浸-束缚法制备应激性胃溃疡模型,观察各组大鼠胃黏膜损伤形态学表现,计算溃疡指数;提取胃组织蛋白,应用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳方法对胃组织匀浆上清液中的蛋白进行梯度分离,采用纳升级电喷雾高效液相仪联合LTQ线性离子阱质谱仪(Eksigent-Thermo LTQ-MS)检测蛋白表达水平。结果:合募配穴组大鼠溃疡指数低于募穴组、下合穴组、背俞穴组和俞募配穴组(P<0.05)。筛选出的感兴趣差异表达蛋白有以下几种:①酶类,包括甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、碳酸酐酶1(Car1)、碳酸酐酶3(Car3)、乌头合酶(Aco2)、α-烯醇化酶(Eno1)、β烯醇化酶(Eno3)和γ烯醇化酶;②运动(骨架)蛋白质,包括alpha 1肌动蛋白(Actc1)、β肌动蛋白(Actb)、α肌动蛋白(Acta1)和相对分子质量为43 000的蛋白质(Actg2);③运输蛋白质,包括血清铁传递蛋白(TF亚型1)和钙网蛋白(Calr);④热休克蛋白,包括相对分子质量为10 000的热休克蛋白(Hspe1)。结论:合募配穴预防应激性胃溃疡效果优于单穴组及俞募配穴组,机制可能与多种蛋白的表达变化有关。 展开更多
关键词 合募配穴 针刺 应激性胃溃疡 差异表达蛋白
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玉米杂交种与亲本雌穗花器官形成期蛋白差异表达谱分析 被引量:2
13
作者 郭宝健 宋方威 +3 位作者 冯万军 隋志鹏 孙其信 倪中福 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期845-854,共10页
为探讨玉米穗粒数杂种优势形成的分子机制,以玉米强优势杂交种豫玉22及其亲本综3和87-1的花器官形成期雌穗为材料,采用高通量的2-DE和MALDI TOF MS技术,建立蛋白差异表达谱,并对差异蛋白进行了质谱鉴定。结果显示,在检测到的1290个蛋白... 为探讨玉米穗粒数杂种优势形成的分子机制,以玉米强优势杂交种豫玉22及其亲本综3和87-1的花器官形成期雌穗为材料,采用高通量的2-DE和MALDI TOF MS技术,建立蛋白差异表达谱,并对差异蛋白进行了质谱鉴定。结果显示,在检测到的1290个蛋白点中,有114个(8.84%)在杂交种与亲本之间的表达差异达到显著水平,其中表现单亲沉默、偏高亲、中亲表达、偏低亲、杂种上调、杂种下调、亲本特异和杂种特异表达模式的蛋白点分别为27、25、15、13、11、11、10和2个。另外,成功鉴定出其中的104个差异表达蛋白点,涉及代谢、信号转导、能量、转录、蛋白质合成、蛋白运输与储藏、细胞生长与分裂、细胞结构、抗病防御、次生代谢、转座子及功能未知和假定蛋白等12个功能类别。玉米杂交种与亲本蛋白在丰度上的明显差异及涉及多个功能类别,可能与玉米穗粒数杂种优势的形成有关。 展开更多
关键词 玉米 雌穗 杂种优势 蛋白差异表达
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磷胁迫下油菜幼苗叶片差异蛋白表达的初步分析 被引量:8
14
作者 余永芳 赵丹丹 +3 位作者 李玉琴 牛银银 田保明 臧新 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第8期89-91,112,共4页
以油菜品种中油821为材料,利用双向电泳技术研究足磷和缺磷条件下油菜幼苗叶片差异表达的蛋白质,进而为揭示油菜耐低磷胁迫的分子机制奠定基础。结果表明:经电泳、PDQuest分析后,缺磷处理下差异显著的蛋白质点有38个,19个表达量显著上调... 以油菜品种中油821为材料,利用双向电泳技术研究足磷和缺磷条件下油菜幼苗叶片差异表达的蛋白质,进而为揭示油菜耐低磷胁迫的分子机制奠定基础。结果表明:经电泳、PDQuest分析后,缺磷处理下差异显著的蛋白质点有38个,19个表达量显著上调,19个显著下调。磷胁迫下蛋白表达量的差异说明逆境下植物体可通过多种蛋白的协调作用来适应外界环境的变化。 展开更多
关键词 油菜 磷胁迫 双向电泳 蛋白质组学 差异蛋白表达
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羊绒蛋白质组表达差异的国内外研究进展 被引量:2
15
作者 康慧琴 金梅 《安徽农学通报》 2007年第9期46-47,共2页
绒山羊以其独特的绒毛产品而成为重要的经济动物,在动物生产中享有重要的地位。绒毛的质地如柔软度、光泽度、保暖度等指标都与绒蛋白有直接的关系。本文主要阐述了近几年国内外在绒蛋白方面所做的主要研究,以便对今后的研究工作提供一... 绒山羊以其独特的绒毛产品而成为重要的经济动物,在动物生产中享有重要的地位。绒毛的质地如柔软度、光泽度、保暖度等指标都与绒蛋白有直接的关系。本文主要阐述了近几年国内外在绒蛋白方面所做的主要研究,以便对今后的研究工作提供一些有价值的参考。 展开更多
关键词 绒山羊 羊绒蛋白 蛋白表达差异
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玉米杂交种与亲本苗期叶片差异表达蛋白谱分析 被引量:4
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作者 郭宝健 隋志鹏 +5 位作者 李洋洋 冯万军 闫文文 李慧敏 孙其信 倪中福 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第14期3046-3054,共9页
【目的】建立玉米杂交种与亲本苗期叶片差异表达蛋白谱,探讨叶片大小杂种优势形成的分子机理。【方法】以玉米强优势杂交种Mo17/B73及其亲本发芽后第5天的第3片叶为材料,采用双向电泳技术(2-DE),结合MALDI TOF MS质谱技术,建立叶片细胞... 【目的】建立玉米杂交种与亲本苗期叶片差异表达蛋白谱,探讨叶片大小杂种优势形成的分子机理。【方法】以玉米强优势杂交种Mo17/B73及其亲本发芽后第5天的第3片叶为材料,采用双向电泳技术(2-DE),结合MALDI TOF MS质谱技术,建立叶片细胞分裂和生长关键区域的差异表达蛋白质谱,并对差异表达蛋白进行质谱鉴定。【结果】在检测到的630个蛋白质点中,有52个蛋白质点在杂交种与亲本之间的表达差异达到显著水平,表现为单亲沉默(15个)、偏高亲(13个)、偏低亲(8个)、杂种上调(6个)、杂种下调(7个)和杂种特异表达模式(3个)。另外,还成功鉴定出了其中的28个差异表达蛋白质点,涉及到代谢、胁迫响应、糖酵解、转录调控、蛋白折叠和降解、三羧酸循环、细胞骨架、发育及未知蛋白质等9个功能类别。【结论】玉米杂交种与亲本在蛋白丰度上存在明显的差异,并且差异表达蛋白涉及到多个功能类别,可能与玉米叶片大小杂种优势的形成有关。 展开更多
关键词 玉米 叶片大小 杂种优势 差异表达蛋白 分子机理
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筛选差异表达基因和蛋白质的方法进展 被引量:19
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作者 王吉村 药立波 赵忠良 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第1期33-36,共4页
分离和鉴定差异表达基因和蛋白质不仅有助于发现基因和蛋白质的功能 ,更有助于揭示某些疾病的发生机理 .目前筛选差异表达基因的方法主要有差异显示PCR方法 (differentialdisplayRT PCR ,DDRT PCR)、消减杂交法 (subtractivehybridizati... 分离和鉴定差异表达基因和蛋白质不仅有助于发现基因和蛋白质的功能 ,更有助于揭示某些疾病的发生机理 .目前筛选差异表达基因的方法主要有差异显示PCR方法 (differentialdisplayRT PCR ,DDRT PCR)、消减杂交法 (subtractivehybridization ,SH )、基因芯片技术 (DNAchiptechnique)和基因表达的系统分析 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)等 ,其中消减杂交法中又先后建立了代表性差异分析技术 (representationaldifferenceanalysis ,RDA)、抑制消减杂交法 (suppressionsubtractivehybridization ,SSH)和获得全长基因的消减杂交法 (full length gene obtainablesubtractivehybridization) .筛选差异表达蛋白质的方法主要有双向电泳技术(two dimentionalgelelectrophoresis)和噬菌体全套抗体库技术 (phagedisplayantibodyrepertoirelibrarytechnique) .这些方法各有特点 ,各有利弊 ,研究者可根据自己的需要选择适合于自己的方法 . 展开更多
关键词 筛选 差异表达基因 差异表达蛋白
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心功能衰竭大鼠模型心肌线粒体蛋白的差异表达分析 被引量:11
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作者 孙爱军 王克强 +4 位作者 李杰 王时俊 樊惠芝 杨原 葛均波 《中国动脉硬化杂志》 CAS CSCD 2004年第2期183-185,共3页
利用差异蛋白质组的方法识别心功能衰竭大鼠心肌代谢的异常 ,以期发现新的治疗靶点。对大鼠行冠状动脉左前降支结扎 ,术后 4周 ,左心室射血分数达 4 6 .4 %± 10 .9% ,成功建立心功能衰竭大鼠模型。实验动物分心功能衰竭组 (n =8)... 利用差异蛋白质组的方法识别心功能衰竭大鼠心肌代谢的异常 ,以期发现新的治疗靶点。对大鼠行冠状动脉左前降支结扎 ,术后 4周 ,左心室射血分数达 4 6 .4 %± 10 .9% ,成功建立心功能衰竭大鼠模型。实验动物分心功能衰竭组 (n =8)和对照组 (n =8) ,分别取左心室进行线粒体抽提。利用双向凝胶电泳技术显示差异蛋白的表达谱。再经胶内酶解 ,行质谱鉴定和蛋白数据库分析。结果发现 ,双向电泳显示 3个蛋白位点表达有显著差异 ,其中一条蛋白被证实为乙醛脱氢酶 2 ,它在心功能衰竭心肌中的表达显著下降。在心肌梗死后 3、7、14及 2 8天心肌乙醛脱氢酶 2mRNA的表达呈逐渐下降趋势。结果提示 ,在心功能衰竭大鼠的心肌线粒体中乙醛脱氢酶 2表达显著下调 ,而乙醛脱氢酶与硝酸甘油的转化有关。这为临床心功能衰竭患者使用硝酸甘油提供了很有价值的依据。 展开更多
关键词 病理学 心功能衰竭大鼠心肌线粒体蛋白差异表达 双向凝胶电泳 线粒体 蛋白质组 质谱 乙醛脱氢酶
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基于蛋白质组学技术筛选葛根芩连汤防治胰岛素抵抗作用的血清差异表达蛋白 被引量:12
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作者 章常华 涂秀英 +4 位作者 熊淑平 盛军庆 关志宇 于梅 魏学鑫 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期81-85,共5页
目的采用蛋白质组学技术筛选鉴定2型糖尿病胰岛素抵抗模型大鼠模型组、葛根芩连汤组血清差异表达蛋白,推测葛根芩连汤防治胰岛素抵抗的机制。方法葛根芩连汤组和模型组通过体内高脂饲料联合链脲佐菌素建立大鼠胰岛素抵抗动物模型,连续... 目的采用蛋白质组学技术筛选鉴定2型糖尿病胰岛素抵抗模型大鼠模型组、葛根芩连汤组血清差异表达蛋白,推测葛根芩连汤防治胰岛素抵抗的机制。方法葛根芩连汤组和模型组通过体内高脂饲料联合链脲佐菌素建立大鼠胰岛素抵抗动物模型,连续灌胃给药3个月,于末次给药后1h,取血清,去除高丰度蛋白后,进行蛋白变性、还原、烷基化、酶解及脱盐后,利用液相Thermo EASY-nlc1000和质谱仪LTQ orbitrap Elite分析鉴定,利用Xcalibur软件和Thermo Proteome discoverer1,4进行数据处理,采用SIEVE v2.1×64进行无标定量分析寻找相关差异蛋白,筛选并鉴定差异表达蛋白,并对差异表达蛋白进行生物信息学分析。结果通过质谱鉴定分析,葛根芩连汤组与模型组差异表达蛋白76个,其中上调49个,下调27个。分析显示差异蛋白主要涉及细胞周期调控、炎症反应、信号通路调节等生物过程。其中上调蛋白磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)(Q63788)、胰岛素受体底物蛋白(IRS)(P35570)等以及下调蛋白载脂蛋白C-Ⅲ(APOC-Ⅲ)(P06759)、肝型脂肪酸结合蛋白(FABP1)(P02692)等差异蛋白可能参与了胰岛素信号转导等通路。结论通过有效的比较分析,得到了一些参与胰岛素信号转导等通路的差异表达蛋白,为研究葛根芩连汤防治胰岛素抵抗的分子机制提供了新靶点。 展开更多
关键词 葛根芩连汤 胰岛素抵抗 蛋白质组学 差异表达蛋白
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钝顶螺旋藻Spirulina platensis两种不同形态藻丝体的光合作用和蛋白质差异表达分析 被引量:8
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作者 林重阳 沈晓文 +2 位作者 赵振坤 吴韩志 徐虹 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第6期1152-1157,共6页
从钝顶螺旋藻Spirulina platensis中分离纯化获得了螺旋形和直线形两种不同形态的藻丝体.通过对二者光合作用的研究发现,螺旋形藻丝体具有较高的光饱和光合作用速率(PmChla)和光饱和点,比直线形藻丝体更能适应较高光强的环境;而直线形... 从钝顶螺旋藻Spirulina platensis中分离纯化获得了螺旋形和直线形两种不同形态的藻丝体.通过对二者光合作用的研究发现,螺旋形藻丝体具有较高的光饱和光合作用速率(PmChla)和光饱和点,比直线形藻丝体更能适应较高光强的环境;而直线形藻丝体具有较低的光补偿点,能在更低的光强下进行光合作用.通过双向凝胶电泳对两种不同形态藻丝体的总蛋白进行比较分析,从中找出了9个差异表达的蛋白点.应用基质辅助激光解吸电离质谱对差异表达的蛋白质点进行鉴定和数据库检索,结果表明,3个蛋白与肽聚糖代谢有关,2个蛋白与光合作用有关,1个蛋白与细胞分裂调控相关,1个蛋白为外膜通道蛋白,2个蛋白为功能未知的假想蛋白. 展开更多
关键词 钝顶螺旋藻 形态差异 光合作用 双向电泳 差异表达蛋白
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