基于ProteinGoggle 2.0的组蛋白H4蛋白质变体的自上而下表征（英文）

由于大量可能蛋白质变体以及每一个翻译后修饰大量可能位点的存在,核心组蛋白上密集的组合式翻译后修饰的自上而下表征一直是一个巨大的分析挑战。结合高分辨串级质谱,基于同位素质荷比和轮廓指纹比对的整体蛋白质数据库搜索引擎ProteinGoggle 2.0在组蛋白翻译后修饰的自上而下鉴定方面拥有诸多独特的优势。该文报道ProteinGoggle 2.0对HeLa核心组蛋白H4的数据库搜索及蛋白质变体的鉴定结果。基于从UniProt网站下载的人类核心组蛋白H4的纯文本文件和"鸟枪法"注释,ProteinGoggle 2.0首先创建包含所有可能蛋白质变体的理论数据库;从纯文本文件中提取的信息主要是氨基酸序列、可能的翻译后修饰(单甲基化、二甲基化、三甲基化、乙酰化和磷酸化)及氨基酸变异(A77→P)。在控制质谱水平假阳性率低于1%的前提下,共鉴定到426个蛋白质变体,这是目前为止H4蛋白质变体的最全报道。这些ProteinGoggle 2.0鉴定到的H4蛋白质变体也与之前报道的ProSightPC 2.0的鉴定结果进行了肩并肩比较。总而言之,ProteinGoggle 2.0可以对具有复杂组合修饰及氨基酸变异的蛋白质组进行数据库搜索和蛋白质变体鉴定。

蛋白质变体活性预测模型及其在肿瘤坏死因子分子设计中的应用

提出了一种预测蛋白质变体活性的简单模型.这种模型不涉及复杂的理论运算,而是试图通过分析蛋白质疏水核心和疏水表面区域的氨基酸定点突变后分子结构的变化,来预测变体的活性变化,以肿瘤坏死因子的两处亮氨酸残基(L29,L157)突变后的活性变化为例,验证了该模型的可靠性.在此基础上,提出了提高肿瘤坏死因子活性的分子设计方案并进行了实验验证.

Der f2重组蛋白用于变应性鼻炎患者血清ELISA检测

目的:以重组表达的野生型粉尘螨变应原蛋白质第2组(Derf2)分作为固相包被抗原,建立间接酶联免疫吸附试验(ELISA)法,检测粉尘螨致敏的持续性变应性鼻炎患者血清中的特异性IgE浓度。方法:经过皮肤点刺试验证明的24例粉尘螨反应阳性血清和2例阴性血清作为IgE血清样本。以粉尘螨变应原蛋白质第2组分固相包被酶标板,辣根过氧化物酶(HRP)标记的抗人IgE单抗作为第2抗体组成测试系统分析特异性IgE。结果:间接ELISA系统检测灵敏度为0.73U.mL-1。在4.0U.mL-1、12.0U.mL-1、22.0U.mL-1浓度,批内重复性和批间重复性分别为9.5%,7%,6.1%和12.8%,9.1%,7.2%。24例皮试阳性患者血清经ELISA分析,有22例阳性。结论:以粉尘螨变应原蛋白质第2组分作为固相包被抗原的间接ELISA法可用来对患者血清sIgE作定量或定性分析,有助于持续性变应性鼻炎的实验诊断。

豆腐致荨麻疹性接触性皮炎

荨麻疹性接触性皮炎是对蛋白质变应原过敏而引发的接触性过敏性疾病,常发生于食品从业人员。现将一因接触豆腐致尊麻疹性接触性皮炎的病例报告如下。 患者女性,是食堂炊事人员,几年来经常接触豆制品,并无异常表现。近期食用豆腐及含大豆的食品后出现恶心,手部湿疹、红斑,伴皮肤瘙痒。既往无异位性皮炎病史。就诊后。

牛角粉蒸汽闪爆处理及酶解效果筛选

为提高蒸汽闪爆处理后牛角蛋白酶解率和探究在不同溶剂中溶解度的条件,试验选取牛角粉(牦牛角)为原料,溶解度和酶解率为评价指标,在单因素试验基础上,采用响应面三因素三水平中心组和试验对酶解条件进行优化,最佳酶解工艺:酶添加量1.4%、底物浓度为6%、时间8.0 h、温度为60℃、pH=8.在此蒸汽闪爆处理酶解条件下压力4.0 MPa时溶解度最好,牛角蛋白酶解率达到21.07%.牛角蛋白在尿素溶液中的溶解率达到60.7%,在盐酸胍溶液中的溶解率为53.01%.结果表明,该酶解工艺合理可行,其牛角蛋白蒸汽闪爆处理后溶解度明显提高,具有较好的酶解效果.本研究可为屠宰副产物进行高效、经济、环保处理提供数据参考.