为了筛选与繁殖性能相关的显著差异表达蛋白及信号通路,试验采用TMT(tandem mass tag)标记蛋白定量技术与生物信息学分析方法,对高产(产仔数在11只以上)与低产(产仔数在7只以下)乌苏里貉卵巢组织进行差异表达蛋白筛选,GO功能注释、KEGG...为了筛选与繁殖性能相关的显著差异表达蛋白及信号通路,试验采用TMT(tandem mass tag)标记蛋白定量技术与生物信息学分析方法,对高产(产仔数在11只以上)与低产(产仔数在7只以下)乌苏里貉卵巢组织进行差异表达蛋白筛选,GO功能注释、KEGG信号通路富集分析。结果表明:在乌苏里貉卵巢组织中共鉴定到4915种蛋白,其中372种为显著差异表达蛋白(P≤0.05,差异倍数≥1.2或≤0.83),上调307种,下调65种。差异表达蛋白主要参与了羧酸代谢过程、胞内氨基酸代谢过程、转录起始、胞内脂代谢过程、磷脂代谢过程、GTP生物合成过程、UTP生物合成过程、CTP生物合成过程等生物学过程,主要参与了组氨酸代谢、氨酰-tRNA生物合成、N-聚糖生物合成、β-丙氨酸新陈代谢、PI3K-Akt信号通路、mTOR信号通路等16条信号通路;有11种差异表达蛋白与卵泡发育和排卵相关。蛋白网络互作分析获得10种核心蛋白,参与了蛋白折叠和蛋白合成。说明试验筛选到的显著差异表达蛋白可能与乌苏里貉的产仔数相关。展开更多
目的分析单核细胞增生李斯特氏菌(简称单增李斯特菌)感染人绒毛膜滋养层细胞HTR-8/Svneo过程中引起的细胞蛋白质组变化。从宿主细胞分子水平对单增李斯特菌感染胎盘的机制进行研究。方法运用TMT(Tandem Mass Tags)蛋白质组学技术对HTR-8...目的分析单核细胞增生李斯特氏菌(简称单增李斯特菌)感染人绒毛膜滋养层细胞HTR-8/Svneo过程中引起的细胞蛋白质组变化。从宿主细胞分子水平对单增李斯特菌感染胎盘的机制进行研究。方法运用TMT(Tandem Mass Tags)蛋白质组学技术对HTR-8/Svneo感染组和非感染组蛋白质组进行定量分析,运用GO(Gene Ontology)、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库对差异表达蛋白进行分子功能、生物过程及代谢途径富集分析。结果共鉴定肽段76285个,可定量蛋白6979个。HTR-8/Svneo感染过程中356个蛋白发生了显著性差异表达。153个表达量上调,203个表达量下调。差异表达量倍数最高的蛋白为微管马达蛋白(B4DYE2),最低为翻译起始因子1(Q6IAV3)。GO功能富集和KEGG代谢途径富集结果表明,上调蛋白参与的生物过程和代谢途径集中在微管、微丝运动,细胞自噬等方面,下调蛋白集中在碳代谢、氮代谢、氨基酸生物合成、核酸代谢等初级代谢途径和泛素介导的蛋白质水解等方面。结论单增李斯特菌侵袭HTR-8/Svneo过程中,宿主细胞的基础代谢可能发生了显著降低,并处于较高的自噬水平。细胞迁移诱导透明质酸酶CEMIP(Q8WUJ3)的显著上调说明该蛋白可能在调节滋养层细胞迁移、侵袭能力进而造成不良妊娠方面具有重要作用,为单增李斯特菌感染胎盘分子机制研究提供新的思路。展开更多
目的基于蛋白质组学技术筛选正常组、疏肝调神针刺组月经性偏头痛患者血清差异表达蛋白,为疏肝调神针法治疗月经性偏头痛患者提供参考依据。方法收集6例女性健康体检者血清(A组),6例月经性偏头痛患者为疏肝调神针刺组(B组),并在治疗前...目的基于蛋白质组学技术筛选正常组、疏肝调神针刺组月经性偏头痛患者血清差异表达蛋白,为疏肝调神针法治疗月经性偏头痛患者提供参考依据。方法收集6例女性健康体检者血清(A组),6例月经性偏头痛患者为疏肝调神针刺组(B组),并在治疗前后分别取血,治疗前为Bq组,治疗后为Bh组。按标号最终得到18个混样。通过蛋白提取、酶切、液相色谱-质谱串联分析、生物信息分析等对样本进行定量蛋白组的研究。对差异表达蛋白进行GO富集、Reactome通路分析以及蛋白互作网络分析。结果Bq/Bh:上调蛋白10个,下调蛋白7个;A/Bh:上调蛋白18个,下调蛋白51个。GO富集分析显示,A/Bh中,最显著富集的20个亚类中生物学过程有14个亚类,细胞元件有2个亚类,分子功能有4个亚类。Bq/Bh中,最显著富集的20个亚类中生物学过程有12个亚类,细胞元件有6个亚类,分子功能有2个亚类。Reactome通路富集分析结果显示:Bq与Bh相比,O-linked glycosylation of mucins(R-HAS-913709)通路和Cellular response to chemical stress(R-HAS-9711123)通路在富集程度及差异蛋白的数量上最为显著。蛋白互作网络分析显示:A/Bh中FN1(fibronectin-1)、UBB(Polyubiquitin-B)、TXN(Thioredoxin)等在月经性偏头痛患者的血液中表达下调,DPP4(Recombinant human dipeptidyl peptidase 4)、SLPI、DNPEP(aspartyl aminopeptidase)等上调。结论疏肝调神针法治疗月经性偏头痛可能通过调控黏蛋白的O-糖基化通路及O型糖基化转移酶GALNT2的表达发挥作用。展开更多
文摘为了筛选与繁殖性能相关的显著差异表达蛋白及信号通路,试验采用TMT(tandem mass tag)标记蛋白定量技术与生物信息学分析方法,对高产(产仔数在11只以上)与低产(产仔数在7只以下)乌苏里貉卵巢组织进行差异表达蛋白筛选,GO功能注释、KEGG信号通路富集分析。结果表明:在乌苏里貉卵巢组织中共鉴定到4915种蛋白,其中372种为显著差异表达蛋白(P≤0.05,差异倍数≥1.2或≤0.83),上调307种,下调65种。差异表达蛋白主要参与了羧酸代谢过程、胞内氨基酸代谢过程、转录起始、胞内脂代谢过程、磷脂代谢过程、GTP生物合成过程、UTP生物合成过程、CTP生物合成过程等生物学过程,主要参与了组氨酸代谢、氨酰-tRNA生物合成、N-聚糖生物合成、β-丙氨酸新陈代谢、PI3K-Akt信号通路、mTOR信号通路等16条信号通路;有11种差异表达蛋白与卵泡发育和排卵相关。蛋白网络互作分析获得10种核心蛋白,参与了蛋白折叠和蛋白合成。说明试验筛选到的显著差异表达蛋白可能与乌苏里貉的产仔数相关。
文摘目的分析单核细胞增生李斯特氏菌(简称单增李斯特菌)感染人绒毛膜滋养层细胞HTR-8/Svneo过程中引起的细胞蛋白质组变化。从宿主细胞分子水平对单增李斯特菌感染胎盘的机制进行研究。方法运用TMT(Tandem Mass Tags)蛋白质组学技术对HTR-8/Svneo感染组和非感染组蛋白质组进行定量分析,运用GO(Gene Ontology)、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库对差异表达蛋白进行分子功能、生物过程及代谢途径富集分析。结果共鉴定肽段76285个,可定量蛋白6979个。HTR-8/Svneo感染过程中356个蛋白发生了显著性差异表达。153个表达量上调,203个表达量下调。差异表达量倍数最高的蛋白为微管马达蛋白(B4DYE2),最低为翻译起始因子1(Q6IAV3)。GO功能富集和KEGG代谢途径富集结果表明,上调蛋白参与的生物过程和代谢途径集中在微管、微丝运动,细胞自噬等方面,下调蛋白集中在碳代谢、氮代谢、氨基酸生物合成、核酸代谢等初级代谢途径和泛素介导的蛋白质水解等方面。结论单增李斯特菌侵袭HTR-8/Svneo过程中,宿主细胞的基础代谢可能发生了显著降低,并处于较高的自噬水平。细胞迁移诱导透明质酸酶CEMIP(Q8WUJ3)的显著上调说明该蛋白可能在调节滋养层细胞迁移、侵袭能力进而造成不良妊娠方面具有重要作用,为单增李斯特菌感染胎盘分子机制研究提供新的思路。
文摘目的基于蛋白质组学技术筛选正常组、疏肝调神针刺组月经性偏头痛患者血清差异表达蛋白,为疏肝调神针法治疗月经性偏头痛患者提供参考依据。方法收集6例女性健康体检者血清(A组),6例月经性偏头痛患者为疏肝调神针刺组(B组),并在治疗前后分别取血,治疗前为Bq组,治疗后为Bh组。按标号最终得到18个混样。通过蛋白提取、酶切、液相色谱-质谱串联分析、生物信息分析等对样本进行定量蛋白组的研究。对差异表达蛋白进行GO富集、Reactome通路分析以及蛋白互作网络分析。结果Bq/Bh:上调蛋白10个,下调蛋白7个;A/Bh:上调蛋白18个,下调蛋白51个。GO富集分析显示,A/Bh中,最显著富集的20个亚类中生物学过程有14个亚类,细胞元件有2个亚类,分子功能有4个亚类。Bq/Bh中,最显著富集的20个亚类中生物学过程有12个亚类,细胞元件有6个亚类,分子功能有2个亚类。Reactome通路富集分析结果显示:Bq与Bh相比,O-linked glycosylation of mucins(R-HAS-913709)通路和Cellular response to chemical stress(R-HAS-9711123)通路在富集程度及差异蛋白的数量上最为显著。蛋白互作网络分析显示:A/Bh中FN1(fibronectin-1)、UBB(Polyubiquitin-B)、TXN(Thioredoxin)等在月经性偏头痛患者的血液中表达下调,DPP4(Recombinant human dipeptidyl peptidase 4)、SLPI、DNPEP(aspartyl aminopeptidase)等上调。结论疏肝调神针法治疗月经性偏头痛可能通过调控黏蛋白的O-糖基化通路及O型糖基化转移酶GALNT2的表达发挥作用。