基于遗传算法的蛋白质折叠模拟系统

在模拟蛋白质折叠的遗传算法基础上 ,采用晶格模型 ,设计了一个用于蛋白质折叠模拟的软件系统 ,并举例说明该系统的用法 .该蛋白质折叠模拟系统可用于蛋白质折叠预测和蛋白质进化研究 。

基于网格计算环境的蛋白质折叠模拟应用

利用当前网格计算和服务最新技术Web Service,设计并实现了基于网格计算环境的蛋白质折叠模拟的分布式计算模型,在生物计算领域有着重要的应用价值。同时,它整合了当前先进的网络计算技术,在算法上和平台建设上有着广泛的指导和示范意义。

模拟蛋白质折叠过程的新算法研究

蛋白质折叠过程模拟是当前蛋白质研究领域的一个难点问题。针对这一问题,提出了一个描述蛋白质折叠过程的算法-拟蛇算法,并且从分子振荡和分子动力学理论两个方面来证明该算法的核心函数是可行和正确的。经过实验总结出所有蛋白质空间结构都可以通过两种类型函数构造出来,提出了描述蛋白质折叠过程模型。与其它蛋白质折叠过程模拟算法的实验结果比较表明,拟蛇算法所构造的空间结构能量值最小、相似度最好。进而说明拟蛇算法和蛋白质折叠过程模型在描述蛋白质折叠过程方面具有明显优势。

蛋白质折叠的三维计算机模拟

介绍了计算机模拟蛋白质的三维模型．利用混合遗传算法对模型问题进行了模拟计算，获得了由２７个氨基酸残基组成的肽链的能量最小的折叠构象．计算结果表明，对于蛋白质折叠的三维晶格模型而言，混合遗传算法是很有效的．

基于HP模型的蛋白质折叠问题的研究

基于蛋白质二维HP模型提出改进的遗传算法对真实蛋白质进行计算机折叠模拟。结果显示疏水能量函数最小值的蛋白质构象对应含疏水核心的稳定结构,疏水作用在蛋白质折叠中起主要作用。研究表明二维HP模型在蛋白质折叠研究中是可行的和有效的并为进一步揭示蛋白质折叠机理提供重要参考信息。