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蛋白质—小分子相互作用模型的构建
1
作者
李怀松
袁琴
+1 位作者
王才华
刘娟
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2014年第7期2129-2131,2144,共4页
构建可解释和可大规模计算的蛋白质—小分子相互作用模型是一个重要的课题。提出一种新的蛋白质—小分子相互作用模型:首先分别用氨基酸三聚物集群和化合物结构片段来描述蛋白质和小分子;然后将蛋白质和小分子片段作为二部图的两部分,...
构建可解释和可大规模计算的蛋白质—小分子相互作用模型是一个重要的课题。提出一种新的蛋白质—小分子相互作用模型:首先分别用氨基酸三聚物集群和化合物结构片段来描述蛋白质和小分子;然后将蛋白质和小分子片段作为二部图的两部分,片段间的相互作用强度作为二部图的边;最后蛋白质和小分子的相互作用则是蛋白质片段和小分子片段之间相互作用的叠加。实验结果表明,该模型预测的准确率达到97%且具有很好的解释性。
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关键词
蛋白质描述
小分子
描述
蛋白质
—小分子相互作用模型
二部图
片段
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职称材料
题名
蛋白质—小分子相互作用模型的构建
1
作者
李怀松
袁琴
王才华
刘娟
机构
武汉大学计算机学院
出处
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2014年第7期2129-2131,2144,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(61272274
60970063
31270101)
文摘
构建可解释和可大规模计算的蛋白质—小分子相互作用模型是一个重要的课题。提出一种新的蛋白质—小分子相互作用模型:首先分别用氨基酸三聚物集群和化合物结构片段来描述蛋白质和小分子;然后将蛋白质和小分子片段作为二部图的两部分,片段间的相互作用强度作为二部图的边;最后蛋白质和小分子的相互作用则是蛋白质片段和小分子片段之间相互作用的叠加。实验结果表明,该模型预测的准确率达到97%且具有很好的解释性。
关键词
蛋白质描述
小分子
描述
蛋白质
—小分子相互作用模型
二部图
片段
Keywords
protein representation
compound representation
protein-compound interaction
bipartite graph
fragment
分类号
TP399 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蛋白质—小分子相互作用模型的构建
李怀松
袁琴
王才华
刘娟
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2014
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