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蛋白质甲基化修饰的蛋白质组学分析方法新进展 被引量:3
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作者 王科云 叶明亮 邹汉法 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期1161-1167,共7页
蛋白质的甲基化修饰是一类重要的翻译后修饰。但与磷酸化、糖基化和泛素化等翻译后修饰相比,甲基化修饰的蛋白质组学分析方法开发还是一个较新的研究领域。近几年,由于甲基化修饰在表观遗传调控中的重要作用,这一修饰类型得到了越来越... 蛋白质的甲基化修饰是一类重要的翻译后修饰。但与磷酸化、糖基化和泛素化等翻译后修饰相比,甲基化修饰的蛋白质组学分析方法开发还是一个较新的研究领域。近几年,由于甲基化修饰在表观遗传调控中的重要作用,这一修饰类型得到了越来越多的关注,相关的分析技术和分析方法也取得了较多进展。其中,基于质谱的蛋白质组学分析方法在甲基化修饰中发挥着关键的作用,实现了这一甲基化修饰的高通量分析。该综述将从甲基化修饰的分离富集、假阳性率控制以及定量蛋白质组学等方面对一些蛋白质甲基化修饰的分析技术和方法的最新进展进行介绍。 展开更多
关键词 蛋白质甲基化修饰 选择性富集 可信度控制 定量蛋白组学 综述
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小鼠垂体瘤细胞冷暴露后蛋白质甲基化修饰分析 被引量:1
2
作者 徐颖 王雪 +2 位作者 王倩倩 朱云平 贾辰熙 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期12-22,共11页
目的:研究小鼠垂体瘤细胞(mouse pituitary tumor cell, AtT20)冷暴露后蛋白质甲基化的变化,以及高效富集和大规模鉴定AtT20细胞的甲基化肽。方法:使用胰蛋白酶和肽N-糖苷酶F(peptide N-glycosidase F,PNGase F)消化蛋白质,利用亲水相... 目的:研究小鼠垂体瘤细胞(mouse pituitary tumor cell, AtT20)冷暴露后蛋白质甲基化的变化,以及高效富集和大规模鉴定AtT20细胞的甲基化肽。方法:使用胰蛋白酶和肽N-糖苷酶F(peptide N-glycosidase F,PNGase F)消化蛋白质,利用亲水相互作用色谱(hydrophilic interaction liquid chromatography, HILIC)尖端富集甲基化肽,最后利用质谱法对甲基化肽进行整体分析;通过PhosphoSitePlus?数据库比对新的甲基化位点和蛋白,利用DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,最后对两组细胞所得的甲基化肽和甲基化位点进行差异分析。结果:共鉴定到55个甲基化蛋白和83个甲基化位点,其中78.3%的甲基化位点是未被报道过的;鉴定到的甲基化蛋白主要分布在核染色体、核小体和细胞核中,参与了基因沉默的调控、RNA剪接和mRNA加工等生物过程;KEGG通路富集表明这些蛋白与中性粒细胞胞外陷阱形成、酒精中毒和系统性红斑狼疮等相关。甲基化肽和甲基化位点差异分析显示有7条显著变化的甲基化肽和2个显著变化的位点。结论:AtT20细胞短期冷暴露后蛋白质甲基化变化不显著,首次对AtT20细胞进行全面甲基化蛋白质鉴定,发现了多个未被报道过的甲基化蛋白质和甲基化位点,以期为AtT20细胞的研究提供理论参考。 展开更多
关键词 小鼠垂体瘤细胞 蛋白质甲基化 冷暴露 质谱
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蛋白质精氨酸甲基转移酶调控骨形成与骨愈合的研究进展
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作者 吴楠 郑苗苗 +2 位作者 王信哲 朱祥 唐昊 《实用临床医药杂志》 CAS 2024年第5期126-129,134,共5页
蛋白质精氨酸甲基化是由蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMTs)介导的调控蛋白质功能的重要翻译后修饰(PTM),其与众多疾病的发生发展密切相关。精氨酸的甲基化修饰与炎症相关疾病及骨折愈合关系密切,PRMTs表达下降可导致骨折延迟愈合甚至不愈合... 蛋白质精氨酸甲基化是由蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMTs)介导的调控蛋白质功能的重要翻译后修饰(PTM),其与众多疾病的发生发展密切相关。精氨酸的甲基化修饰与炎症相关疾病及骨折愈合关系密切,PRMTs表达下降可导致骨折延迟愈合甚至不愈合。PRMT5、PRMT6在骨折愈合方面均有重要意义,其与PI3K-AKT通路、NF-κB通路息息相关。探讨蛋白质精氨酸甲基化与骨折愈合之间的联系,可为预防骨折延迟愈合甚至不愈合提供新思路。 展开更多
关键词 蛋白质精氨酸甲基 蛋白质精氨酸甲基转移酶 PRMT5 PRMT6 骨折愈合 成骨细胞 破骨细胞
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蛋白质精氨酸甲基化修饰在糖代谢调节中的作用 被引量:1
4
作者 孙佳颖 王南楠 +1 位作者 刘东方 梅希 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期993-997,共5页
蛋白质精氨酸甲基化是重要的细胞翻译后修饰方式,参与众多生命过程.精氨酸的甲基化修饰与糖代谢相关疾病如糖尿病、糖耐量异常密切相关.蛋白质精氨酸甲基化转移酶(proteinarginine methyltransferases,PRMTs)活性下降及表达异常是糖代... 蛋白质精氨酸甲基化是重要的细胞翻译后修饰方式,参与众多生命过程.精氨酸的甲基化修饰与糖代谢相关疾病如糖尿病、糖耐量异常密切相关.蛋白质精氨酸甲基化转移酶(proteinarginine methyltransferases,PRMTs)活性下降及表达异常是糖代谢疾病的重要发病基础.目前研究表明,PRMT1、PRMT4、PRMT5在糖代谢调节中均扮演重要角色,与糖代谢关键酶如磷酸烯醇式丙酮酸羧基激酶、葡萄糖6磷酸酶,胰岛素受体-胰岛素受体配体1-磷脂酰肌醇3激酶通道及其它通路密切相关.给予甲基化抑制剂MTA及siRNA干扰甲基化则可引发糖代谢紊乱,进而诱发糖代谢疾病.糖尿病药物罗格列酮、氨基胍与蛋白质精氨酸甲基化也有一定联系.深入研究蛋白质精氨酸甲基化与糖代谢调节之间的联系及机制,可为防治糖代谢疾病及相关并发症提供更多的理论依据. 展开更多
关键词 蛋白质精氨酸甲基 蛋白质精氨酸甲基转移酶 糖尿病 糖耐量异常 糖代谢调节
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蛋白质精氨酸甲基化转移酶5在肝细胞肝癌中的表达及其临床意义 被引量:5
5
作者 朱凯 战昊 +1 位作者 代智 周俭 《中国临床医学》 2018年第5期710-715,共6页
目的:探讨蛋白质精氨酸甲基化转移酶5(protein arginine methyltransferase 5,PRMT5)在肝细胞肝癌中的表达及其临床意义。方法:对323例肝细胞肝癌组织及对应正常肝脏组织进行免疫组化染色,分析PRMT5在肝癌组织中的表达以及在细胞内的分... 目的:探讨蛋白质精氨酸甲基化转移酶5(protein arginine methyltransferase 5,PRMT5)在肝细胞肝癌中的表达及其临床意义。方法:对323例肝细胞肝癌组织及对应正常肝脏组织进行免疫组化染色,分析PRMT5在肝癌组织中的表达以及在细胞内的分布情况。分析PRMT5表达及分布与肝癌患者临床特征及预后之间的关系,以及与异黏蛋白(metadherin,MTDH)联合预测肝癌患者预后的价值。结果:免疫组化染色结果显示,PRMT5在肝癌组织中表达明显高于对应的正常肝脏组织,其中核内表达占优势者为36.8%(119/323)。PRMT5表达及分布情况与MTDH表达相关(P<0.01)。PRMT5表达水平不影响患者的生存率及复发率;PRMT5核内表达组患者的生存率和复发率优于核外表达组(P<0.05)。PRMT5表达分布是影响患者生存率和复发率的独立预后因素(P<0.05);PRMT5表达分布联合MTDH表达量的预测价值更优(P<0.001)。结论:PRMT5表达在肝癌细胞核外分布占优势提示预后不佳;PRMT5核表达模式联合MTDH表达量可作为肝癌预后的潜在预测指标。 展开更多
关键词 蛋白质精氨酸甲基转移酶5 异黏蛋白 肝细胞肝癌
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蛋白质精氨酸甲基转移酶5参与泌尿系统肿瘤发病的机制及其相关治疗研究进展 被引量:2
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作者 郭晨明 王星 +1 位作者 赵磊 周逢海 《山东医药》 CAS 2022年第32期109-112,共4页
蛋白质精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)在多种人类恶性肿瘤组织中表达上调,发挥类似致癌基因的作用。研究发现,PRMT5在前列腺癌、膀胱癌、肾细胞癌组织中表达上调,可促进肿瘤增殖、侵袭、转移等,并与肿瘤耐药、患者低生存率等密切相关。不同... 蛋白质精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)在多种人类恶性肿瘤组织中表达上调,发挥类似致癌基因的作用。研究发现,PRMT5在前列腺癌、膀胱癌、肾细胞癌组织中表达上调,可促进肿瘤增殖、侵袭、转移等,并与肿瘤耐药、患者低生存率等密切相关。不同泌尿系统肿瘤中PRMT5介导的分子机制和作用仍不完全清楚。深入研究PRMT5在泌尿系统肿瘤中的作用,有助于寻找有效的治疗靶点,开发新的治疗药物,实现患者个体化、精准化治疗。 展开更多
关键词 蛋白质精氨酸甲基转移酶5 泌尿系统肿瘤 前列腺癌 膀胱癌 肾细胞癌 表观遗传学 蛋白质甲基化
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蛋白质精氨酸甲基化转移酶的研究进展
7
作者 高锐 刘凌霄 《山东医药》 CAS 2014年第21期104-106,共3页
在哺乳动物中,目前发现的组蛋白精氨酸甲基化位点包括H3-Arg2、H3-Arg8、H3-Arg17、H3-Arg26和H4-Arg3。精氨酸甲基化由组蛋白精氨酸甲基化转移酶(PRMTs)催化完成;与赖氨酸甲基化类似,精氨酸甲基化也可激活或抑制染色质的相关功能... 在哺乳动物中,目前发现的组蛋白精氨酸甲基化位点包括H3-Arg2、H3-Arg8、H3-Arg17、H3-Arg26和H4-Arg3。精氨酸甲基化由组蛋白精氨酸甲基化转移酶(PRMTs)催化完成;与赖氨酸甲基化类似,精氨酸甲基化也可激活或抑制染色质的相关功能。精氨酸甲基化存在单甲基化、对称双甲基化和非对称双甲基化三种状态。现结合文献对PRMTs的研究进展综述如下。 展开更多
关键词 精氨酸 甲基 蛋白质精氨酸甲基转移酶
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蛋白质精氨酸甲基转移酶5在心血管疾病中的研究进展
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作者 王贺 袁扬 +2 位作者 宁小平 张冠鑫 徐志云 《国际心血管病杂志》 2022年第6期347-350,共4页
蛋白质精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)是Ⅱ型精氨酸甲基转移酶,其通过多种途径参与机体的病理生理过程,涉及心血管、消化、免疫、血液等多个系统。PRMT5可以改变细胞形态,调节细胞的生长过程。在心血管疾病方面,PRMT5可以抑制心肌肥厚,促进... 蛋白质精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)是Ⅱ型精氨酸甲基转移酶,其通过多种途径参与机体的病理生理过程,涉及心血管、消化、免疫、血液等多个系统。PRMT5可以改变细胞形态,调节细胞的生长过程。在心血管疾病方面,PRMT5可以抑制心肌肥厚,促进炎性因子聚集及粥样斑块形成,参与内皮细胞的血管生成及心肌Na^(+)通道表达。PRMT5特异性抑制剂的出现,使PRMT5可作为潜在治疗靶点,用于治疗心血管疾病。 展开更多
关键词 蛋白质精氨酸甲基转移酶 蛋白质甲基化 心血管疾病
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circPRMT5、EZH2在宫颈癌组织中表达及与预后的关系
9
作者 李和丽 梁殿迅 +3 位作者 王秋宇 姜平 朱军义 郭哲 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第22期5411-5415,共5页
目的探讨环状RNA(circRNA)蛋白质精氨酸甲基化转移酶(circPRMT)5、果蝇zeste基因增强子同源物(EZH)2在宫颈癌(CC)患者中表达水平及其临床意义。方法选取84例CC患者癌组织和对应癌旁正常组织,检测circPRMT5、EZH2 mRNA表达水平;分析癌组... 目的探讨环状RNA(circRNA)蛋白质精氨酸甲基化转移酶(circPRMT)5、果蝇zeste基因增强子同源物(EZH)2在宫颈癌(CC)患者中表达水平及其临床意义。方法选取84例CC患者癌组织和对应癌旁正常组织,检测circPRMT5、EZH2 mRNA表达水平;分析癌组织circPRMT5、EZH2 mRNA表达水平与临床病理特征及预后的关系、癌组织circPRMT5表达水平与EZH2 mRNA的相关性及影响CC患者预后的因素。结果CC患者癌组织circPRMT5、EZH2 mRNA表达水平均显著高于癌旁正常组织(P<0.05);癌组织circPRMT5、EZH2 mRNA表达水平与肿瘤分化程度、淋巴结转移、FIGO分期相关(P<0.05);癌组织circPRMT5表达水平与EZH2 mRNA呈正相关(P<0.05);circPRMT5、EZH2低表达组36个月生存率均明显高于circPRMT5、EZH2高表达组(P<0.05);circPRMT5、EZH2 mRNA、FIGO分期、淋巴结转移是影响CC患者不良预后的独立危险因素(P<0.05)。结论circPRMT5、EZH2在CC患者癌组织中均呈高表达,两者均可能与CC患者不良预后有关,检测癌组织circPRMT5、EZH2表达水平有助于CC患者预后评估。 展开更多
关键词 环状RNA蛋白质精氨酸甲基转移酶5 果蝇zeste基因增强子同源物2 宫颈癌
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甲基化与HIV-1复制 被引量:1
10
作者 眭维国 林华 +3 位作者 邬俊勇 黄河 陈洁晶 戴勇 《中国艾滋病性病》 CAS 2009年第5期539-540,548,共3页
甲基化是基因组DNA主要的表观遗传修饰方式,它可调节基因组功能的表达。甲基转移酶是细胞进程的调节器。最近的研究主要集中在,甲基化作用对艾滋病毒Ⅰ型(HIV-1)生活周期的影响上。新的证据表明,蛋白质甲基化可以调节HIV-1复制。另外,DN... 甲基化是基因组DNA主要的表观遗传修饰方式,它可调节基因组功能的表达。甲基转移酶是细胞进程的调节器。最近的研究主要集中在,甲基化作用对艾滋病毒Ⅰ型(HIV-1)生活周期的影响上。新的证据表明,蛋白质甲基化可以调节HIV-1复制。另外,DNA甲基化和RNA甲基化也可能影响HIV-1复制。该文对这些方面进行了综述,以期为今后开展进一步的研究提供参考。 展开更多
关键词 甲基转移酶 蛋白质甲基化 DNA甲基 RNA甲基 HIV-1复制
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Methyl-CpG binding proteins in the nervous system 被引量:7
11
作者 Leah HUTNICK 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2005年第4期255-261,共7页
Classical methyl-CpG binding proteins contain the conserved DNA binding motif methyl-cytosine binding domain(MBD), which preferentially binds to methylated CpG dinucleotides. These proteins serve as transcriptional re... Classical methyl-CpG binding proteins contain the conserved DNA binding motif methyl-cytosine binding domain(MBD), which preferentially binds to methylated CpG dinucleotides. These proteins serve as transcriptional repressors,mediating gene silencing via DNA cytosine methylation. Mutations in methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2) have beenlinked to the human mental retardation disorder Rett syndrome, suggesting an important role for methyl-CpG bindingproteins in brain development and function. This mini-review summarizes the recent advances in studying the diversefunctions of MeCP2 as a prototype for other methyl-CpG binding proteins in the development and function of thevertebrate nervous system. 展开更多
关键词 神经系统 甲基CpG蛋白质 细胞分 染色质 蛋白 基因抑制 DNA 胞嘧啶
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MBD2在老年胃癌中的表达及其对胃癌细胞多药耐药性的作用 被引量:3
12
作者 韩雪晶 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2017年第7期1666-1668,共3页
目的探讨甲基化CpG结合域蛋白质2(MBD2)在老年胃癌中的表达及其对胃癌细胞多药耐药性的作用。方法采用免疫组化染色法检测70份老年胃癌组织及其相应的癌旁组织标本中的MBD2表达情况,并分析其表达水平与病理参数的关系。Western印迹检测M... 目的探讨甲基化CpG结合域蛋白质2(MBD2)在老年胃癌中的表达及其对胃癌细胞多药耐药性的作用。方法采用免疫组化染色法检测70份老年胃癌组织及其相应的癌旁组织标本中的MBD2表达情况,并分析其表达水平与病理参数的关系。Western印迹检测MBD2在胃癌细胞系SCG7901及其耐药细胞系中的表达。使用MBD2的小干扰RNA静默MBD2表达后,通过MTT试验检测化疗药物顺铂、5-氟尿嘧啶对胃癌细胞的半数抑制浓度(IC50)。结果 MBD2在胃癌组织中阳性表达率为72.86%,明显低于相应的癌旁组织中的92.86%(P<0.01)。MBD2在胃癌组织中表达与TNM分期、远处转移相关;其中MBD2在TNM分期为Ⅰ期和Ⅱ期的患者中阳性表达率明显高于Ⅲ期和Ⅳ期患者(P<0.05)。SGC7901/阿霉素、GC7901/长春新碱中的MBD2/β-actin灰度比值明显低于其亲本细胞SGC7901(P<0.01)。SGC7901细胞和转染无关序列对照寡核苷酸的SGC7901细胞MBD2/β-actin比值之间差异无统计学意义(P>0.05);转染MBD2特异性小干扰RNA的SGC7901细胞中MBD2/β-actin比值明显低于上述两株对照组细胞(P<0.05)。转染MBD2特异性小干扰RNA的胃癌细胞对顺铂和5-氟尿嘧啶的IC50值均明显高于转染无关序列对照寡核苷酸的胃癌细胞(P<0.01)。结论 MBD2在老年胃癌组织中表达明显降低,与临床分期和远处转移有关,可抑制胃癌细胞的多药耐药性,说明MBD2表达失调参与了胃癌的发生、发展。 展开更多
关键词 胃癌 甲基CpG结合域蛋白质2 耐药性
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灵芝精氨酸甲基转移酶基因鉴定及表达分析 被引量:2
13
作者 查良平 刘爽 +2 位作者 赵玉洋 袁媛 黄璐琦 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第15期28-32,共5页
目的:在灵芝转录组基础上,对灵芝蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMTs)GLPRMT1,GLPRMT2和GLPRMT3基因进行全面的生物信息学分析。方法:利用生物信息学方法对灵芝GLPRMT1,GLPRMT2和GLPRMT3基因编码氨基酸序列的理化特性、亲/疏水性、功能域、... 目的:在灵芝转录组基础上,对灵芝蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMTs)GLPRMT1,GLPRMT2和GLPRMT3基因进行全面的生物信息学分析。方法:利用生物信息学方法对灵芝GLPRMT1,GLPRMT2和GLPRMT3基因编码氨基酸序列的理化特性、亲/疏水性、功能域、二级结构、三级结构和系统发育进化等进行分析和预测;利用转录组FPKM分析灵芝不同生长时期GLPRMT1,GLPRMT2和GLPRMT3基因的相对表达量。结果:GLPRMT1和GLPRMT2均具有完整的开放阅读框且为全长,而GLPRMT3不为全长互补脱氧核糖核酸;GLPRMT1,GLPRMT2和GLPRMT3都具有蛋白质精氨酸甲基转移酶最保守的Ado Met-MTases结构域;GLPRMT1,GLPRMT2,GLPRMT3分别与真菌的PRMT3家族,PRMT1家族和PRMT5家族聚为一支;GLPRMT2的表达量明显高于GLPRMT1和GLPRMT3,且3个蛋白质精氨酸甲基转移酶基因表达随着灵芝个体的发育均呈上升趋势。结论:本研究结果为揭示灵芝的表观调控机制提供理论基础。 展开更多
关键词 灵芝 蛋白甲基 蛋白质精氨酸甲基转移酶 生物信息学 基因鉴定
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