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基于准等重二甲基化标记的高通量蛋白质组选择性交叉标记装置
被引量:
1
1
作者
刘健慧
张晓丹
+4 位作者
周愿
单亦初
方菲
张丽华
张玉奎
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期230-236,共7页
面对生物学及精准医学等领域多变量、大样本量的蛋白质组定量分析的需求,高通量的定量标记及分析已经成为近年来蛋白质组学方法发展的趋势。发展了一种基于准等重二甲基化标记策略的高通量肽段末端选择性交叉标记装置(pIDL-StageTip),...
面对生物学及精准医学等领域多变量、大样本量的蛋白质组定量分析的需求,高通量的定量标记及分析已经成为近年来蛋白质组学方法发展的趋势。发展了一种基于准等重二甲基化标记策略的高通量肽段末端选择性交叉标记装置(pIDL-StageTip),借助简单的装置及离心力,有效地增加了定量标记的通量,并保证了肽段末端两步标记反应时间的可控性及操作的简便性。通过优化酸性条件下NaBD_3CN与NaBH_3CN体系的标记条件,得到了标准蛋白质酶解产物100%的标记效率、95%以上的标记选择性;在人源蛋白质组复杂体系下,标记效率大于99%,标记选择性为100%。基于该装置的定量方法具有很高的定量准确度及精密度。该装置为实现高可操作性、高准确度、高通量的蛋白质组定量标记提供了一个可靠的解决方案。
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关键词
蛋白质组标记装置
准等重二甲基化
选择性交叉
标记
高通量
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职称材料
题名
基于准等重二甲基化标记的高通量蛋白质组选择性交叉标记装置
被引量:
1
1
作者
刘健慧
张晓丹
周愿
单亦初
方菲
张丽华
张玉奎
机构
中国科学院分离分析化学重点实验室
中国科学院大学
出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期230-236,共7页
基金
国家自然科学基金项目(21405154).
文摘
面对生物学及精准医学等领域多变量、大样本量的蛋白质组定量分析的需求,高通量的定量标记及分析已经成为近年来蛋白质组学方法发展的趋势。发展了一种基于准等重二甲基化标记策略的高通量肽段末端选择性交叉标记装置(pIDL-StageTip),借助简单的装置及离心力,有效地增加了定量标记的通量,并保证了肽段末端两步标记反应时间的可控性及操作的简便性。通过优化酸性条件下NaBD_3CN与NaBH_3CN体系的标记条件,得到了标准蛋白质酶解产物100%的标记效率、95%以上的标记选择性;在人源蛋白质组复杂体系下,标记效率大于99%,标记选择性为100%。基于该装置的定量方法具有很高的定量准确度及精密度。该装置为实现高可操作性、高准确度、高通量的蛋白质组定量标记提供了一个可靠的解决方案。
关键词
蛋白质组标记装置
准等重二甲基化
选择性交叉
标记
高通量
Keywords
proteome labeling equipment
pseudo-isobaric dimethyl labeling(pIDL)
crosssequence labeling using site-selectivity
high throughput
分类号
O658 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于准等重二甲基化标记的高通量蛋白质组选择性交叉标记装置
刘健慧
张晓丹
周愿
单亦初
方菲
张丽华
张玉奎
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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职称材料
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参考文献
引证文献
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